马磊，男，1979年6月出生，博士（后），博士生导师，教授，石河子大学学科带头人，现从事生物信息学与遗传资源方面的研究。近年主持国家自然科学基金（面上项目、地区基金）、国家高技术研究发展计划（863）子课题、中国博士后科学基金（面上一等资助、特别资助）、人社部留学人员科技活动择优资助等10余项，发表SCI论文、软件著作权、专利等30余项，出版专著1部，获农业部中华农业科技奖、中国农业科学院优秀博士后奖、全国大学生生命科学竞赛二等、三等及优胜奖（指导教师）、石河子大学优秀青年教师等奖项。
1. 学习和工作经历
2005年至今，石河子大学生命科学学院，讲师、副教授、教授；
2013年－2014年，新西兰奥塔哥大学，访问****（博士后）；
2011年－2014年，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，博士后；
2007年－2010年，西北农林科技大学，生物信息学专业，博士学位；
2002年－2005年，西北农林科技大学，动物遗传育种与繁殖专业，硕士学位。
2. 招生专业与开设课程
博士招生专业：生物学（遗传学、生物信息学、生化与分子生物学等方向）
硕士招生专业：
（1）学术学位：生物学（生物信息学、遗传学、微生物等方向）；
（2）专业学位：生物与医药（生物工程）、学科教育（生物）。
承担本科生《遗传学》、《生物统计学》、《生物信息学》、《PERL编程》、研究生《生物信息学算法导论》、《分子进化与系统发育》等课程。
3. 主要研究方向
生物信息学方向：利用数学、统计学和信息科学的方法，探索基因组进化、基因表达调控、基因互作网络、代谢网络等方面的理论和算法。
遗传资源方向：应用生物信息学技术，搜寻、分析和可视化特殊生境中抗旱、抗冻、耐盐碱、固沙等方面的分子遗传特质和生态效应。
4. 主持科研项目
国家自然科学基金（地区基金）：羽毛针禾对其根鞘核心微生物组的遗传塑造作用及调控机制，编号：**，2021/01 - 2024/12，在研，主持。
国家自然科学基金（地区基金）：应用CPR改进基因共表达网络探究反式剪接的调控因子及机制，编号：**，2019/01 - 2022/12，在研，主持。
国家自然科学基金（地区基金）：基于GBS-RNA-seq整合组学解析羽毛针禾基因组变异与沙生适应性的关系，编号：**，2016/01-2019/12，结题，主持。
国家自然科学基金（面上项目）：基于猪生殖系统研究嵌合RNA的形成新机制及其繁殖调控功能，2013/01 - 2016/12，编号：**，结题，主持。
国家高技术研究发展计划（863）子课题：猪经济性状的功能基因组学研究，编号：2013AA102502，2013/01 - 2017/12，结题，主持。
人力资源和社会保障部留学人员科技活动择优资助项目（启动类）：基于GBS-SNPs技术研究固沙植物羽毛针禾基因流动态及沙生适应性，编号：人社厅函[2015]192号2015LX004，2016/01 - 2018/06，结题，主持。
中国博士后科学基金（特别资助）：结合五指山猪基因组探讨嵌合RNA的形成新机制及其功能，编号：2012T50166，2013/01 - 2014/12，结题，主持。
中国博士后科学基金（面上一等资助）：基于高通量组学数据研究猪microRNA靶向调控网络及功能，编号：，2012/01 - 2014/12，结题，主持。
石河子大学高层次人才科研启动专项（博士类）：绵羊融合RNA与其亲本基因的鉴定、功能及在毛囊组织中的表达规律研究，编号：RCZX201137，2012/01 - 2014/12，结题，主持。
石河子大学高层次人才科研启动专项（硕士类）：家禽细胞趋化因子MCP-1克隆及表达研究，编号：RCZX200523，2006/01 - 2007/12，结题，主持。

5. 承担的科研项目
国家自然科学基金（地区基金）：基于代谢网络探究羽毛针禾根鞘土壤微生态通路，编号：**，2021/01 - 2024/12，在研，第一参与人。
国家自然科学基金（地区基金）：应用基因共表达网络探究羽毛针禾的荒漠适应性分子机制，编号：**，2018/01 - 2021/12，在研，第一参与人。
6. 代表性科研成果
主要论文:
Li, Piaopiao, Yingxia Li, Lei Ma*. Potential role of chimeric genes in pathway-related gene co-expression modules. World Journal of Surgical Oncology 2021, 19(1): 149.
Tingting Zhang, Feng Hu*, Lei Ma*. Phosphate-solubilizing bacteria from safflower rhizosphere and their effect on seedling growth. Open Life Sciences 2019, 14(1): 246-254.
Kai Wei, Lei Ma*, Tingting Zhang*. Characterization of gene promoters in pig: Conservative elements, regulatory motifs and evolutionary trend. PeerJ 2019, 7: e7204.
Kai Wei^#, Tingting Zhang^#, Lei Ma*. Divergent and convergent evolution of housekeeping genes in human-pig lineage. PeerJ 2018, 6:e4840.
Lei Ma, Shulin Yang, Weiming Zhao, Zhonglin Tang, Tingting Zhang, Kui Li*. Identification and analysis of pig chimeric mRNAs using RNA sequencing data. BMC Genomics 2012, 13(1):429.
Lei Ma, Tingting Zhang, Zhuoran Huang, Xiaoqian Jiang, Shiheng Tao*. Patterns of nucleotides that flank substitutions in human orthologous genes. BMC Genomics 2010, 11(1):416.
专著:
马磊，张婷婷（著），《嵌合基因——生物分子网络的桥梁》，九州出版社，北京，2016，ISBN：78.

软件著作权:
马磊，张婷婷. GBS-RNA-seq 整合组学分析软件，2017，计算机软件著作权，中国，登记号：2017SR351033.
马磊，张婷婷. Chimeric Gene转录丰度量化软件，2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR154264.
马磊，张婷婷. 嵌合基因网络效应解析软件, 2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR378638.
张婷婷，马磊. 嵌合基因结构域解析软件，2016，计算机软件著作权，中国，登记号：2016SR379095.
马磊，张婷婷. Chimeric RNA 鉴定软件，2014，计算机软件著作权，中国，登记号：2014SR216881.
7. 获奖情况
农业部2015年度中华农业科技奖优秀创新团队类成果奖
中国农业科学院2012年度优秀博士后奖
全国大学生生命科学竞赛二等奖、三等奖和优胜奖（指导教师）
石河子大学2018年度优秀青年教师
石河子大学2017年度实践教学先进个人
石河子大学2015年度优秀教案设计奖
石河子大学2016年度教学成果二等奖
石河子大学2010年度教学成果三等奖
石河子大学2021年度优秀硕士学位论文（指导教师）
8. 毕业的研究生
目前指导8名硕士生毕业，其中2名现在德国攻读博士学位，6名在国内读博或就业；指导1名博士生，现在国内高校任教。
9. 联系方式
电子邮箱：malei1979@hotmail.com；电话：**