生物工程学院前身为河北轻工业学院发酵工程专业，建于1958年。1964年全国院校整合时，北京轻工业学院发酵工程专业迁入我院，使学院发酵工程专业成为我国高校中实力最强的两个发酵工程专业之一。1999年本科专业更名为生物工程专业，2000年新增制药工程专业。2004年组建成生物工程学院。

　　目前学院设有生物工程专业和制药工程专业。2006年，根据人才市场和就业情况需求，生物工程专业设置微生物工程和生物化工两个方向，制药工程专业设置生物制药和药物设计与合成两个方向。

　　发酵工程是学院的特色学科，2007年“发酵工程”成功跻身国家级重点学科。1993年获得“发酵工程”博士学位授予权，是国内最早的三个发酵工程博士学位授予专业之一。2006年“发酵工程”列为天津市高校“十一五”综合投资建设学科。

　　学院拥有轻工技术与工程的一级学科博士点和博士后流动站，发酵工程博士学位授权点，发酵工程、生物化工、微生物与生化药学（医）、微生物与生化药学（理）、药物化学（医）和药物化学（理）专业等6个学术型硕士学位授权点，轻工技术与工程（发酵工程）、生物工程和制药工程等3个专业型硕士学位授权点，轻工技术与工程（发酵工程）、生物工程和制药工程等3个工程硕士学位授权点，发酵工程、生物化工、微生物与生化药学、药物化学专业等4个在职人员同等学力硕士学位授权点。

　　学院拥有“工业微生物教育部重点实验室”、国家劳动和社会保障部轻工行业特有工种“酿酒行业职业技能鉴定站”和“氨基酸行业职业技能鉴定站”、“天津市发酵行业工程技术中心”以及和食品学院联合支撑国家教育部“食品生物技术工程研究中心”。目前是中国发酵协会常务理事单位、教育部高等学校生物工程与生物技术专业教学指导分委员会委员单位等。

　　学院现有教职工72人，95%以上的教师具有研究生学历。其中教授22人，副教授14人，讲师13人；其中国务院政府特贴专家3人，教育部新世纪人才2人，天津市****2人，天津市特聘教授4人，天津科技大学“海河学者”特聘教授5人，全国优秀教师2人，博士生导师9人，硕士生导师27人。近几年，学院从国内外各知名院校及企业聘请客座教授、名誉教授50余人。目前在校博士、硕士研究生500余人，工程硕士及同等学力在职研究生100余人，本科生900余人。学院每年招收近硕士和博士生200余名，是我国生物技术产业高级研究与技术人才的培养基地。

　　学院拥有3个教学一级实验室，下设9个二级实验室。其中“生物工程基础实验中心”为天津市优秀实验室。学院积极开展产学研合作，并设有校内实训基地，培养知识、能力、素质协调发展的技术人才，培养了大批优秀人才。

　　学院依托轻工发酵的传统优势，以“发酵工程”国家重点学科的发展与国家及滨海新区的需求为主要导向，设立代谢控制发酵、生物反应工程、现代酿造技术、生物制药、分子药理学、药物化学以及中药生物工程等研究方向。近五年，学院承担国家“973”项目，“863”计划，国家支撑计划4项，国家自然科学基金50余项，省部级项目80余项，企业委托项目60余项。科研项目为本科生的创新能力和实践能力的培养及科研素养的提高搭建良好的平台。近五年，共发表学术论文750余篇，被SCI、EI收录论文150余篇。其中本科生参与发表科研论文200余篇。取得80余项科研成果，其中20项科研成果获得省部级以上科研奖励。同时，学院高度重视知识产权的保护，申请专利85项，已授权的国家发明专利24项。出版学术著作或教材15部。

　　学院在氨基酸和核苷发酵、生物防腐剂、活性干酵母、有机酸、微生物发酵食品配料与添加剂、益生菌制品、酶制剂及其应用、工业微生物菌种改造与鉴定保藏、现代酿造技术、中药天然产物开发、濒临灭绝名贵中草药的拯救、临床快速诊断试剂盒、药用蛋白表达、甾体激素药物生物转化、药物化合物的化学修饰等方面的部分科研成果具有可以转化成生产力的条件。

　　近年来合作企业对学院发展和人才培养提供了大力支持，先后设立了“梅花味精奖学金”、“诺维信创新奖学金”、“海河杯”科技创新奖学金等。创新奖学金的设立提高了学生的科研创新能力，有效的提升了学院的教学效果，提高企业知名度。

　　学院领导高度重视学院的文化建设，把文化建设纳入学院发展的总体规划，组织开展了“国学文化传播、学院毕业生墙建设、知行讲堂、教育环境优化、杰出生物人评选”等系列活动，取得了突出成效。学院积极营造良好的育人环境，不断提升学生的思想素质和人文素质，努力构建和谐校园。

　　长期以来，学院按照学校“国际化”发展的目标，先后与日本、英国、法国、美国、德国、捷克等国进行了多项合作科研和学术交流，扩大和提升了学院的学术地位和影响。

　　目前学院正在大力推进学科建设，努力建成在国内外生物工程和制药工程领域有一定影响的教学研究型学院。