姓名 赵倩 职称 副教授 所在
部门 细胞生物学系 研究
方向 生物信息学、计算基因组学，表观遗传基因组学
办公室 基础医学院202 办公
电话 电子
邮箱 zhaoq@tmu.edu.cn
教育背景
2005年9月–2010年6月，中国科学院北京基因组研究所，生物信息方向
2001年9月–2005年6月，北京邮电大学，计算机科学与技术学院，计算机系

工作经历
2018至今，天津医科大学基础医学院，副教授
2012-2017，同济大学，转化医学高等研究院，副研究员
2010-2012，同济大学，生命科学与技术学院，生物信息系，博士后

研究成果（本人具有代表性的论著、论文及主持的科研项目）
论著
及编
著 　

论文 　1.Li, Shuzhong , ... Zhao, Q.*, Jin, FL*. (2018). Bacillus thuringiensis Suppresses the Humoral Immune System to Overcome Defense Mechanism of Plutella xylostella."?Frontiers in Physiology?9. (IF: 3.4)
　2.Kong Y, Ai C, Dong F, ... Zhao, Q.*, Wu, XD*. (2018). Targeting of BMI-1 with PTC-209 inhibits glioblastoma development. Cell Cycle. 2018;17(10) (IF: 3.3)
　3.Zheng, X.^#, Zhao, Q.^#, Wu, H.-J., Li, W., Wang, H., Meyer, C. A., Qin, Q., et al. (2014). MethylPurify: tumor purity deconvolution and differential methylation detection from single tumor DNA methylomes. Genome biology, 15(8) (IF: 10.5)
　4.Lin, X., Li, J., Yin, G., Zhao, Q., Elias, D., Lykkesfeldt, A. E., Stenvang, J., et al. (2013). Integrative analyses of gene expression and DNA methylation profiles in breast cancer cell line models of tamoxifen-resistance indicate a potential role of cells with stem-like properties. Breast Cancer Res, 15, R119. (IF: 5.881)
　5.Lin, X., Sun, D., Rodriguez, B., Zhao, Q., Sun, H., Zhang, Y., & Li, W. (2013). BSeQC: quality control of bisulfite sequencing experiments. Bioinformatics (Oxford, England). doi:10.1093/bioinformatics/btt548 (IF: 4.621)
　6.Zhao Q^#, Xiao J, Yu J. An integrated analysis of lineage-specific small proteins across eight eukaryotes reveals functional and evolutionary significance. PROG BIOCHEM BIOPHYS, 2012; 39(4):359-67 (IF: 0.290)
　7.Wang C, Tian R, Zhao Q, Xu H, Meyer CA, Li C, Zhang Y, Liu XS. Computational inference of mRNA stability from histone modification and transcriptome Profiles. Nucleic Acids Res 2012; 40(14):6414-23. (IF:8.808)
　8.Zhao Q^#, Zhang Y. Epigenome sequencing comes of age in development, differentiation and diseases mechanism research. Epigenomics, 2011; 3(2):207-20. (IF: 5.215)
　9.Li J^#, Zhao Q^#, Lars Bolund. Computational methods for epigenetic analysis: the protocol of computational analysis for modified methylation-specific digital karyotyping based on massively parallel sequencing. Methods Mol Biol 2011; 791:313-28
　10.Yang L, Zhang K, Dai W, He X, Zhao Q, Wang J, Sun Z. Systematic evaluation of genome-wide methylated DNA enrichment using a CpG island array. BMC Genomics 2011; 12:10 (IF: 4.041)
　11.He X^#, Chang S^#, Zhang J^#, Zhao Q^#. Xiang H, Kusonmano K, Yang L, Sun Z, Yang H and Wang J. MethyCancer: the database of human DNA methylation and cancer. Nucleic Acids Res, 2008; 36(suppl1):D836-41 (IF:8.808)
　
（#:第一作者；*:通讯作者）

科研
项目 　1.建立单样本DNA甲基化的异质性分析平台及其应用，国家自然科学基金面上项目，2017.1-2020.12
　2.基于表观基因组深度挖掘哺乳动物发育相关调控机制，同济大学青年优秀人才培养行动计划，2015.1-2017.11
　3.基于小鼠胚胎干细胞研究DNA羟甲基化降噪算法及其去甲基化相关调控机制, 国家自然科学基金青年项目, 2013.1-2015.12
　4.基于DNA羟甲基化组学数据研究小鼠胚胎干细胞的表观遗传学重编程机制, 第51批中国博士后基金面上项目

荣誉奖励
1.2018年天津市“131”创新人才培训计划（第二层次）
2.第六届全国生物信息学与系统生物学大会（The Sixth National Conference on Bioinformatics and Systems Biology），优秀报告一等奖
3.2013-2014学年第一学期同济大学督导推荐课堂教学特色课程
4.2008年度中国科学院地奥奖学金二等奖

其他事项