基本信息
计算生物信息学研究所
高琳 教授博导
博士学科：计算机应用技术
硕士学科：计算机应用技术
工作单位：计算机学院
联系方式
办公室地址：主楼I434
实验室地址：主楼I436，I437，I427
Email：lgao@mail.xidian.edu.cn
个人简介
高琳，女，博士，西安电子科技大学计算机学院教授，学术带头人，博士生导师。西安交通大学数学系计算数学专业理学学士学位、西北大学数学系计算数学专业理学硕士学位、西安电子科技大学雷达信号处理国家重点实验室电路与系统专业博士学位。1990年7月至1994年9月在西电公司电子计算技术应用研究所工作，从事有限元分析程序设计、工程算法设计、计算与分析等计算应用与研究工作；1994年10月调入西安电子科技大学计算学院从事教学和科研工作至今。2004年至2005年被国家留学基金委批准选派赴加拿大UniversityofGuelph做访问学者，从事生物信息学交叉学科的研究工作。在科研方面，先后主持多项国家自然科学基金，863子项目，教育部博士点学科基金，国家留学回国人员基金及多项省部级项目，科研成果获多项省部级奖励。在教学方面，曾荣获校“永新”、“贝尔”、“华为”、等奖教金、“陕西省师德标兵”称号、西安电子科技大学“十佳师德标兵”称号。近年来，主要研究方向包括计算生物信息学，数据挖掘，图论与组合优化算法及应用等。
研究所成立于2011年4月，由高琳教授创办。依托西安电子科技大学信息学科优势，“计算机科学与技术”一级学科博士学位授权点和博士后流动站的支撑，用信息和系统的观点研究面向生物数据分析、挖掘和模式发现的基础理论和关键技术，开发生物数据分析软件平台，培养学科交叉型研究人才。研究所现有教授2人，副教授4人，具有博士学位讲师4人。自1998年以来一直从事计算机，数学与生物学科的交叉研究工作，已经在生物数据分析与挖掘、模式识别与机器学习、图论与组合优化等方面进行了长期理论研究与科研开发工作，承担了国家自然基金重大研究计划项目、重点项目、面上项目，教育部博士点基金项目等。在国内外有影响的杂志和学术会议上发表论文100多篇。
主要研究方向
机器学习与数据挖掘
1、机器学习基础理论研究
2、数据挖掘理论、方法与算法
3、模式理论与生物数据的模式发现
生物网络建模与分析
1、生物网络建模与拓扑特征分析
2、生物网络模块化分析及在疾病分析中的应用
3、生物网络演化与进化分析
非编码RNA分析
1、非编码RNA识别与功能预测
2、非编码RNA与疾病
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基本信息
计算生物信息学研究所
高琳 教授博导
博士学科：计算机应用技术
硕士学科：计算机应用技术
工作单位：计算机学院
联系方式
办公室地址：主楼I434
实验室地址：主楼I436，I437，I427
Email：lgao@mail.xidian.edu.cn
个人简介
高琳，女，博士，西安电子科技大学计算机学院教授，学术带头人，博士生导师。西安交通大学数学系计算数学专业理学学士学位、西北大学数学系计算数学专业理学硕士学位、西安电子科技大学雷达信号处理国家重点实验室电路与系统专业博士学位。1990年7月至1994年9月在西电公司电子计算技术应用研究所工作，从事有限元分析程序设计、工程算法设计、计算与分析等计算应用与研究工作；1994年10月调入西安电子科技大学计算学院从事教学和科研工作至今。2004年至2005年被国家留学基金委批准选派赴加拿大UniversityofGuelph做访问学者，从事生物信息学交叉学科的研究工作。在科研方面，先后主持多项国家自然科学基金，863子项目，教育部博士点学科基金，国家留学回国人员基金及多项省部级项目，科研成果获多项省部级奖励。在教学方面，曾荣获校“永新”、“贝尔”、“华为”、等奖教金、“陕西省师德标兵”称号、西安电子科技大学“十佳师德标兵”称号。近年来，主要研究方向包括计算生物信息学，数据挖掘，图论与组合优化算法及应用等。
研究所成立于2011年4月，由高琳教授创办。依托西安电子科技大学信息学科优势，“计算机科学与技术”一级学科博士学位授权点和博士后流动站的支撑，用信息和系统的观点研究面向生物数据分析、挖掘和模式发现的基础理论和关键技术，开发生物数据分析软件平台，培养学科交叉型研究人才。研究所现有教授2人，副教授4人，具有博士学位讲师4人。自1998年以来一直从事计算机，数学与生物学科的交叉研究工作，已经在生物数据分析与挖掘、模式识别与机器学习、图论与组合优化等方面进行了长期理论研究与科研开发工作，承担了国家自然基金重大研究计划项目、重点项目、面上项目，教育部博士点基金项目等。在国内外有影响的杂志和学术会议上发表论文100多篇。
主要研究方向
机器学习与数据挖掘
1、机器学习基础理论研究
2、数据挖掘理论、方法与算法
3、模式理论与生物数据的模式发现
生物网络建模与分析
1、生物网络建模与拓扑特征分析
2、生物网络模块化分析及在疾病分析中的应用
3、生物网络演化与进化分析
非编码RNA分析
1、非编码RNA识别与功能预测
2、非编码RNA与疾病
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科学研究
一、研究方向
计算生物信息学（ComputationalBioinformatics）是生命科学与计算机科学、数理科学、化学等领域相互交叉而形成的一门新兴学科，以生物数据作为研究对象，研究理论模型和计算方法，开发分析工具，进而达到揭示这些数据蕴含的生物学意义的目的。
针对高通量的生物网络数据，我们研究的重点集中在图模型及其相关的图论与组合优化算法、数据挖掘与机器学习算法等在以下问题中的应用：
1、计算生物信息学
?生物网络数据分析
?生物网络的模体识别与模块挖掘
?生物网络的比较与进化分析
?基于网络模型的疾病基因预测与药物靶标识别
?生物序列数据分析
?二代测序数据分析算法
?非编码RNA分析
?生物网络数据分析平台及可视化软件
?网络数据分析评价平台及可视化软件
?序列数据分析平台及可视化软件
2、数据挖掘技术及应用
?图的挖掘技术
?频繁子图挖掘算法研究
?图的聚类算法研究
?文本挖掘
?基于机器学习的文本信息抽取
?文本中基因和蛋白质实体的识别
?智能化故障检测与诊断
?故障预测模型构建方法研究
?粗糙集理论及属性约简算法研究
3、图论与组合优化算法及应用
?图的划分算法
?图的划分算法研究
?划分算法的应用
?组合优化算法
?生物信息中的组合优化问题
?智能化计算方法
二、科研项目
[1]国家自然基金重大研究计划项目：复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究
No.**2.1-2014.12项目负责人
[2]国家自然基金重点项目：生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术
No.**0.1-2013.12项目负责人
[3]国家自然基金项目：动态生物分子网络演化模式挖掘算法研究
No.**2.1-2014.12
[4]国家自然基金项目：协同学习模式下流数据的聚类与预测联合实现方法研究
No.**1.1-2013.12
[5]高等学校博士学科点专项科研基金，基于图挖掘的蛋白质网络功能模块识别算法
No.**32009.1-2011.12项目负责人
[6]国家自然科学基金资助项目，生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究
No.**6.1-2008.12项目负责人
[7]国家自然科学基金资助项目，基于自装配的分子计算模型及算法研究
No.**5.1-2005.12项目负责人
[8]教育部留学回国人员科研启动基金，生物网络的模体发现算法研究
2007.1-2008.12
[9]应用材料基金项目，混合模式超大规模集成电路布局布线算法研究
No.XA-AM-**.1-2009.12项目负责人
[10]陕西省科技攻关项目，基于H.254的新一代视频会议系统
No.2004K05-G302004.1-2005.12项目负责人
[11]西安市信息专项，AES加密模块IP
No.ZX**.4-2007.4项目负责人
[12]陕西省自然科学研究计划项目，DNA计算：自装配模型及算法研究
No.2003F092004.1-2004.12项目负责人
[13]陕西省自然科学研究计划项目，DNA分子生物计算理论及其在决策和组合优化问题中的应用
No.2001X052002.1-2003.12项目负责人
[14]太原卫星发射基地项目，多测速设备远程智能诊断方法及技术研究
2009.12-2010.6项目负责人
[15]西门子公司，基于贝叶斯网络的告警事件关联分析
2010.1-2010.6项目负责人
[16]国家自然科学基金资助项目，用于癌症基金诊疗的基因表达谱智能盲数据分析
No.**4.1-2004.12第一参加人
[17]国家自然科学基金资助项目，脉冲耦合神经网络理论及其在自动目标识别中的应用研究
No.**1.1-2003.12第三参加人
[18]国家自然科学基金资助项目，基于图论方法的前向神经网络优化结构的机理研究
No.**万元2000.1-2002.12第三参加人
[19]国防科技预研基金项目，基于脉冲耦合神经网络的自动目标识别研究
No.00J1.4.4DZ01062000.1-2002.12第三参加人
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学术论文
一、论文
2013
[1]XingliGuo,LinGaoetal.Longnon-codingRNAsfunctionannotation:aglobalpredictionmethodbasedonbi-colorednetwork.NucleicAcidsResearch,2013,41(2):e35-e35【SCIIF=8.026,JCR=2】
[2]BingboWang,LinGao,YongGao,YueDeng.Maintainthestructuralcontrollabilityundermaliciousattacksondirectednetworks.EurophysicsLetters,2013,101(5):58003【SCIIF=2.171,JCR=2】
[3]YueDeng,LinGao,BingboWang.ppiPre:Predictingprotein–proteininteractionsbycombiningheterogeneousfeatures.BMCSystemBiologyAccepted
[4]GuiminQin,LinGao,JianyeYang,ZhanyingXiong.SignificantSubstructureDiscoveryinDynamicNetworks.CurrentBioinformatics,2013,8(1):46~55【SCIIF=0.898】
[5]郭杏莉,高琳,刘永轩,党合萱等.长非编码RNA特征研究与分析.科学通报,2013,58:1~8
2012
[1]XiaokeMa,LinGao.Biologicalnetworkanalysis:insightsintostructureandfunction.BriefinginFunctionalGenomics,2012,11(6):434~442【IF=4.126】
[2]XiaokeMa,LinGao.Discoveringproteincomplexesinproteininteractionnetworksviaexploringtheweakties.BMCSystemBiology,2012,6(Suppl1):S6【SCIIF=3.148，JCR=2】
[3]XiaokeMa,LinGao.PredictingproteincomplexesinPPInetworksbyusingacore-attachmentalgorithmbasedongraphcommunicability.InformationScience,2012,189:233~254【SCIIF=2.833，JCR=2】
[4]BingboWang,LinGao,YongGao.Controlrange:acontrollability-basedindexfornodesignificanceindirectednetworks.JournalofStatisticalMechanics:TheoryandExperiment,2012,04:P04011【SCIIF=2.758】JCR=2
[5]BingboWang,LinGao.Seedselectionstrategyinglobalnetworkalignmentwithoutdestroyingtheentirestructuresoffunctionalmodules.ProteomeScience,2012,10(Suppl1):S16【SCIIF=2.49】
[6]GuiminQin,LinGao.Analgorithmfornetworkmotifdiscoveryinbiologicalnetworks.InternationalJournalofDataMiningandBioinformatics,2012,6(1):1~16.Pressrelease
[7]付立东,高琳,马小科.基于社团检测的复杂网络中心性方法.中国科学F辑,2012,42(5):550~560
[8]YuWang,LinGao.DetectingProteinComplexesbyanImprovedAffinitypropagationAlgorithminProtein-ProteinInteractionNetworks.JournalofComputers,2012,7(7)1761~1768
[9]ZengfaDou,LinGao.AParticleSwarmOptimizerbasedExtensionClassifierforBiomedicalDocument.JournalofComputationalInformationSystems,2012,8(1):249~258.
[10]ZengfaDou.AnalyzingrequirementsofcustomerforWLANusingnoveltwo-stagemethod.InternationalJournalofDigitalContentTechnologyanditsApplications,2012,6(3):93-100.
[11]YueDeng,LinGao.ppiPre-anRpackageforpredictingprotein-proteininteractions.IEEEInternationalConferenceonSystemBiology(ISB2012).Proceedings,pp,333~337.Xian,China,August18-20.2012
2011
[1]XingliGuo,LinGao.Acomputionalmethodbasedontheintegrationofheterogeneousnetworksforpredictingdisease-geneassociations.PLoSOne,2011,6(9):e24171【SCIIF=4.411】JCR=2
[2]LiangYu,LinGao,ChuiliangKong.Identificationofcore-attachmentcomplexesbasedonminingmaximalfrequentpatternsinprotein-proteininteractionnetworks.Proteomics,2011,11(19):3826~3834【SCIIF=4.815】JCR=2
[3]PengGangSun,LinGao.Identificationofoverlappingandnon-overlappingcommunitystructurebyfuzzyclustering.InformationScience.2011,181(6):1060-1071【SCIIF=3.291】JCR=2
[4]XiaokeMa,LinGao.Non-traditionalspectralclusteringalgorithmsforcommunitydetectionincomplexnetworks:acomparativeanalysis.JournalofStatisticalMechanics:TheoryandExperiment.2011,05:P05012【SCIIF=2.758】JCR=2
[5]PengGangSun,LinGao.Predictionofhumandisease-relatedgeneclustersbyclusteringanalysis.InternationalJournalofBiologicalSciences.2011,7(1),61-73.【SCIIF=2.865】JCR=3
[6]LiangYu,LinGao,KuiLi.Adegree-distributionbasedhierarchicalagglomerativeclusteringmethodforproteincomplexesidentification.ComputationalBiologyandChemistry.2011,35(5):298-307【SCIIF=1.37】
[7]PenggangSun,LinGao.IdentificationofConservedProteinComplexesbyModuleAlignment.InternationalJournalofDataMiningandBioinformatics,2011,6(5):593~610【SCIIF=0.933】
[8]鱼亮，高琳，孙鹏岗.蛋白质网络中功能模块预测算法研究.计算机学报.2011,34(7):1239-1251
2010
[1]XiaokeMa,LinGao,XuerongYong.EigenspacesofnetworksrevealtheoverlappingandhierarchicalcommunitystructuremorepreciselyJournalofStatisticalMechanics:TheoryandExperiment.2010,08:P08012【SCIIF=2.758】【SCI:**019】
[2]XiaokeMa,LinGao,XuerongYong,LidongFu.Semi-supervisedclusteringforcommunitystructuredetectionincomplexnetworks.PhysicaA,2010,389(1):187~197【SCIIF=1.562】【SCI:**022】
[3]GuiminQinLinGao.SpectralClusteringforDetectingProteinComplexesinPPINetworks.MathematicalandComputerModelling,2010,52(11-12):2066~2074【SCIIF=1.103】【SCI:**019&EI:**907】
[4]LiangYu,LinGao,PenggangSun.AHybridClusteringAlgorithmforIdentifyingModularityinProtein-ProteinInteractionNetworksInternationalJournalofDataMiningandBioinformatics2010,5(4):600~615【SCI:**008】
[5]LidongFu,LinGao.AcentralitymeasurebasedonspectraloptimizationofmodularitydensityScienceinChinaSeriesF,2010,53(9):1727~1737【SCI:**003】
[6]郭杏莉,高琳,陈新.生物网络比对的模型与算法.软件学报,2010,21(9):2089~2106【EI:**346】
[7]赵建邦,董安国,高琳.一种用于生物网络数据的频繁模式挖掘算法.电子学报,2010,38(8):1803~1807【EI:**759】
[8]LiangYu,LinGao.QuantitativeFunctionforCommunityStructureDetection.InternationalJournalofDataMining,ModellingandManagement,2010,4(2):351~368
[9]LiangYu,LinGao,Amethodbasedonlocaldensityandrandomwalksforcomplexesdetectioninprotein-proteininteractionnetworks.JournalofBioinformaticsandcomputationalBiology.2010，8(Suppl.1):1~16DOINo:10.1142/S**5191
Conference
[1]LiangYu,LinGao.Anaverage-degreebasedmethodforproteincomplexesidentification.TheFourthInternationalConferenceonBioinformaticsandBiomedicalEngineering(iCBBE2010)Proceedings,pp.175-182,June18-20,Chengdu,China.【EI:**605】
[2]JianBangZhao,LinGao.Analgorithmforextractingsubgraphofspecificspeciesfromme[ant]tabolicpathway.TheFourthInternationalConferenceonBio-InspiredComputing:TheoriesandApplications,(BIC-TA2010)Proceedings,pp,74~79.Sep23-26,2010Changsha,China.【EI:**605】
[3]YuWang,LinGao.AnimprovedAPalgorithmforidentifyingoverlappingfunctionalmodulesinprotein-proteininteractionnetworks.IEEEInternationalConferenceonSignalProcessing(ICSP10)Proceedings,pp,1809~1812.October24-28,2010Beijing,China.【EI:**605】
[4]LiangYu,LinGao.Identificationofcore-attachmentcomplexesbasedonminingmaximalfrequentpatternsinprotein-proteininteractionnetworks.IEEEInternationalConferenceonBioinformaticsandBiomedicine(IEEEBIBM2010)pp,29~34.Dec.18-21,2010,HongKong
2009年之前
[1]LinGao，PenggangSun,JiaSong.ClusteringAlgorithmsfordetectingfunctionalmodulesinproteininteractionnetworks.JournalofBioinformaticsandComputationalBiology,2009,7(1):217-242.
[2]赵建邦,高琳,宋佳.基于代谢路径构建系统发生树的方法.电子学报,2009,37(8):1633~1638.【EI:**483】
[3]覃桂敏,高琳.生物网络模体发现算法研究综述.电子学报,2009,37(10):2258~2265.【EI检索:**354】
[4]覃桂敏,高琳,周晓锋.一种基于统计的生物网络模体发现算法.电子学报,2009,37(11):2420~2426.【EI:**399】
[5]JialuHu,LinGao,GuiminQin.Evaluationofsubgraphsearchingalgorithmsdetectingnetworkmotifinbiologicalnetworks.FrontiersofComputerScienceinChina,2009,3(3):412~416【EI:**746】
[6]PenggangSun,LinGao.Afastiterative-cliquepercolationmethodforidentifyingfunctionalmodulesinproteininteractionnetworks.FrontiersofComputerScienceinChina,2009,3(3):405~411【EI:**745】
[7]LinGao，YanZeng,AnguoDong.AnantcolonyalgorithmforsolvingMax-cutproblems.ProgressinNaturalScience,2008,18(9):1173~1178【SCI**018】
[8]高琳，覃桂敏，周晓峰.图数据中频繁模式挖掘算法研究综述.电子学报,2008,36(8):1603~1609.【EI:**523】
[9]LinGao,LinWenbin,WeifengLi，DavidK.Y.Chiu.Self-AssemblyBasedModelsandAlgorithmsforDNAComputationInternationalJournalofUnconventionalComputing2006,2:267~280
[10]WenbinLiu,LinGao,QiangZhang,GuandongXu,XiangouZhu,XiangrongLiuandJinXu.ARandomWalkDNAAlgorithmforthe3-SATProblem.CurrentNanoscience,2005,1,85-90【SCI:**009】
[11]LinGao,YangXiao,LiuWenbin,JinXu.DNABasedModelforAdditionComputation.ProgressinNaturalScience2004,14(8):705~709【SCI:**010】
[12]高琳，许进.图的顶点着色问题的DNA算法.电子学报.2003,31(4):14~18
[13]WenbinLiu,LinGao,ShudongWang,JinJinXu.Solvingthe3-SATProblemBasedonDNAComputing.JournalofChemicalInformationandComputerSciences.2003,43,1872~1875【SCI:**019】
[14]张强,高琳,王超,袁涛，许进.具有时滞的一阶细胞神经网络的动态行为研究.物理学报,2003,52(7):1606~1610【SCI:**010】
[15]刘文斌，高琳，王淑栋，许进.最大匹配问题的DNA表面计算模型.电子学报.2003，31(10):1496~1499【EI:**】
[16]张强,高琳,王超,许进.时滞双向联想记忆神经网络的全局稳定性.物理学报，2003,52(7):1060~1065【SCI:**009】
[17]高琳，马润年，许进.基于质粒求解最大匹配问题的DNA算法.生物化学与生物物理进展.2002,29(5):820~823【SCI:**032】
[18]LinGao,MaRunnian,Xujin.DNASolutionofVertexCoverProblemBasedonStickerModel.ChineseJournalofElectronics.2002,11(2):280~284.【SCI:**032】
[19]高琳，许进，张军英.DNA计算的研究进展与展望.电子学报,2001,29(7):945-949.
[20]高琳，张军英，许进.基于神经网络的单通道冗余VLSI/WSI阵列重构算法.电子学报,2001,29(12):1683-1686
Conference
[1]PenggangSun,LinGao.AlgorithmsbasedonDensityandSharedNeighborsforFunctionalModulesIdentificationinPPINetworks.IEEEInternationalConferenceonBioinformaticsandBioengineeringBIBE2009–Proceedings,pp.228-235,June22-24,2009inTaichung,Taiwan【EI:**373】
[2]PenggangSun,LinGao.FastalgorithmsfordetectingoverlappingfunctionalmodulesinPPInetworks.IEEESymposiumonComputationalIntelligenceinBioinformaticsandComputationalBiology,CIBCB2009-Proceedings,pp.247-254,2009March30-April2,2009inNashville,U.S.A【EI:**311】
[3]GuiminQin,LinGao.SpectralClusteringforDetectingProteinComplexesinPPINetworksTheFourthInternationalConferenceonBio-InspiredComputing:TheoriesandApplications,BIC-TA2009-Proceedings,pp.175-182,October16-19,2009inBeijing,China【EI:**789】
[4]LinGao,DavidK.Y.Chiu.Classificationalgorithmsandanalyzingfunctionalityofproteinfamilies.SixthInternationalConferenceonDataMining,TextMiningandtheirBusinessApplications,25-27May2005,Skiathos,Greece.pp.431-443【ISTP:**0043】
二、软件与专利
软件2010
《蛋白质功能模块分析与可视化软件》1.0
获得软件著作权，登记号：2010SR041536
欢迎您使用《蛋白质功能模块分析与可视化软件》，该软件需要安装.Netfr[ant]amework3.5及以上版本。
（软件）
以下是MIPS数据库的数据，用户下载后可以放在：蛋白质功能模块分析与可视化软件—>DataBase中。若软件中已经有MIPS文件夹，直接覆盖即可更新到我们提供的最新数据。我们会尽快加入其他数据库的数据！
（数据）
译著2010
《基因组信号处理》刘文斌，高琳。科学出版社，2010年4月。
翻译由美国系统生物所(InstituteforSystemsBiology)IlyaShmulevichandEdwardR.Dougherty于2007年由PrincetonUniversityPress出版的专著《GenomicSignalProcessing》
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荣誉获奖
教学获奖
1.陕西省教育工会“陕西省师德标兵”称号
2006
2.西安电子科技大学“十佳师德标兵”称号
2006
3.西安电子科技大学获第四届校级青年教师讲课竞赛三等奖
2001
4.西安电子科技大学计算机学院讲课竞赛一等奖
2000
5.西安电子科技大学“华为”奖教金三等奖
1999
6.西安电子科技大学“永新”奖教金三等奖
1998
科研获奖
1.生物分子网络数据分析中相关图问题及其算法研究西安电子科技大学优秀科研成果奖
第一完成人2010证书编号：一等奖
2.耦合神经网络和DNA计算的若干理论与应用研究陕西省科学技术奖
二等奖第三完成人2006证书编号：06-2-011-D1
3.智能计算理论及其应用研究陕西省教育厅科学技术奖
二等奖第三完成人2006证书编号：06C15
4.民用高性能GPS芯片组西安市科学技术奖
二等奖第三完成人2005证书编号：2005-2-22-R3
5.优化计算中若干理论及其应用的研究教育部自然科学技术
一等奖第十一名2004证书编号：2004-030
6.基于脉冲耦合神经网络的图象处理和优化问题求解西安电子科技大学优秀科研成果奖
二等奖第四完成人2003证书编号：020904
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科研团队
团队教师
姓名职称研究方向Email
高琳教授
鱼亮副教授ModulestructureanalysisinPPInetworkslyu@xidian.edu.cn
纪建副教授Patternrecongnitionjijiangao@126.com
覃桂敏副教授Motifdiscoveryinbiologicalnetworkgmqin@mail.xidian.edu.cn
孙鹏岗讲师ModuleanalysisinPPInetworksun198268@163.com
博士研究生
姓名研究方向Email
郭杏莉Alignmentofbiologicalnetworkxlguo@mail.xidian.edu.cn
guoxingli@sei.xidian.edu.cn
豆增发Datamininginbiologicaldata
jssdzf@126.com
王玙Communitystructureanalysisincomplexnetworkcheerwangyu@163.com
张恩利Graphpartitionyuleeo@163.com
马小科Communitystructureanalysisincomplexnetworkmaxiaoke8218@163.com
邓岳EvaluationandpredictionofPPIanfdeng@163.com
王炳波Complexnetworkw_bingbo@163.com
贾松卫Patterndetectionincomplexnetworkjiasongwei123456@163
张馨东Diseasegenediscoveryzxd841@163.com
硕士研究生
姓名研究方向Email
2011级
杨晓飞yangxiaofeihe@163.com
刘亚盟liuyamengde@yahoo.com.cn
邵海珠shaohaizhu88@126.com
张青芳gogozqf@yeah.com
2012级
王羽**@qq.com
胡宇轩**@qq.com
王培卓wangpeizhuo_37@163.com
张卉宁grass1219@126.com
刘华liuhuaapple@163.com
张献鹏**@qq.com
梁博lb19880512@qq.com
房金飞**@qq.com
2013级
肖飞**@qq.com
王铜**@qq.com
张军雁**@qq.com
张嘉慧**@qq.com
已毕业学生
博士研究生
鱼亮**lyu@xidian.edu.cnModulestructureanalysisin
PPInetworks
赵建邦**Zjb9797@163.comPhylogeneticanalysis
孙鹏岗**psun@mail.xidian.edu.cnModuleanalysisinPPInetwork
马小科**maxiaoke8218@163.comCommunitystructure
analysisincomplexnetwork
付立东**fulidong2005@163.comCommunitystructure
analysisincomplexnetwork
覃桂敏**gmqin@mail.xidian.edu.cnMotifdiscoveryinbiologicalnetwork
硕士研究生
2010级
杨建业**yangjianye0@163.com
去哪儿网(北京)动态网络拓扑结构变化的多角度度量
刘笑逸****@qq.com
IGT(北京)基于异构网络模型的致病基因预测算法
吉烁**amanda_211@126.com
读博(西安)基于拓扑和语义相似性的疾病基因识别算法
刘永轩**lyxuk318@126.com
亚马逊(北京)基于MRF的长非编码RNA功能预测方法
党合萱**dang_hx1987@126.com
阿里(杭州)基于多特征的长非编码RNA识别方法
邓琨**dkxiaobai@163.com
百度(北京)基于拓扑相似性的动态网络链路预测方法
陈喆**xschenzhezhtx@yahoo.com.cn
百度(北京)基于进化和局部优先的动态网络社团检测算法
周慧琪**68292544@qq.com
百度(北京)基于局部强化非负矩阵分解的基因表达数据聚类
2009级
王丹阳**sunshinein@qq.com
腾讯(深圳)
Communitydetection
李佳佳**liudingzhijiajia@163.com
中兴(三亚)
dynamicnetwork
熊站营**xiongzhanying@gmail.com
华为(西安)
dynamicnetwork
王刚**magicwangxd@qq.com
中信证券(北京)
datasimilarity
魏春水****@qq.com
腾讯(深圳)
networkalignment
孔垂亮**morrain1987@foxmail.com
中控集团(杭州)
Communitydetection
廖至峰**78088371@qq.com
腾讯(深圳)
SymmetryofNetwork
2008级
呼加璐**jialu.hu@fu-berlin.de
德国读博士
Motifdiscoveryinnetwork
宋佳**songjia3000@163.com
百度北京
Moduleanalysis
陈新**chafall@163.com
江西省银监局
NetworkAlignment
吴胜**wusheng24@163.com
交通银行总行（上海）
Moduleanalysis
孙玲**riplotus@163.com
德国读博士
Clusteringalgorithm
李奎**lkgreatgreen@163.com
华为
Moduleanalysis
靳二辉**jinerhui1984@163.com
百度北京
Graphpartition
赵雪霞**zhaoxuexia000@163.com
中兴
Goout
2007级
张汉珍88208085zhzmailbox@126.com
杭州淘宝
GraphpartitionapplicationinVLSI
詹海萍**helenazhan@163.com
建设银行总行
Motifdiscoveryinsequence
崔力强****@qq.com
西安斯特沃克
Placementalgorithmin
large-scalemixed-mode
杨常清**surcarles@163.comAttributereductioninKDD
basedonroughset
肖伟甲**topweijia@yahoo.com.cn
上海万得资讯
Detailedplacementalgorithm
牛为秋**mynamefmm@163.com
北京搜狐
Classificationrulemining
刘杰**sqliujie@126.com
西安中兴
Placementalgorithm
王蓓金**Peiking23@126.com
西电计算机学院
Graphclustering
张明**ddxyzm@163.com
西安中兴
Alignmentofbiologicalnetwork
张道广**Hard-workingboy@163.com
郭伟**Gw110511@163.com
北京兴唐通信科技有限公司
吴振华**Wzhkknd@tom.com
2006级
周敬**77531989@qq.com
中兴通讯
Motifdiscoveryinsequence
刘文艳**xd_lwy@126.com
华为公司
Frequentpatternminingingraph
侯青敏**xiaoqing1691@126.com
大唐软件
Motifdiscoveryinsequence
张守霞**sxzhang19840622@qq.com
中兴通讯
StatisticalAnalysisof
BiologicalNetworks
梁多勇**liangduoyong2003@163.com
华为公司
PlacementalgorithminVLSI
谢孝青**xiexiaoqing110@126.com
大唐软件
VLSIdesign-AES
陈熠**Tccy19841013@126.com
杭州中兴科技
Alignmentofbiologicalnetwork
2005级
周晓锋**zxfax@163.com
华为公司
Statisticalanalysisofbiological、
networks
韩明伟**mingweihan@126.com
部队
Placementalgorithmin
large-scalemixed-mode
陈培毅**chenpeiyi9@163.com
华为公司
Phylogeneticanalysis
basedonnetworkdata
王慧蕴**
88207156Why19810811@163.com
Hyw811@sohu.com
华为公司
Phylogeneticanalysis
basedongeneorderorgenecontent
2004级
吴晓成**tjaiwxc@163.com
631研究所
AES算法分析及其IP实现
尹金荔**yinjinli@hotmail.com
华为公司
Graphcomparisonandfeature
detectionalgorithmsforthe
analysisofbiologicalnetworks
汪军锋88206856sunlitww@hotmail.com
sunlitwangwang@163.com
中兴科技
Goout
2003级
曾艳**zengyanzi@163.com
西安邮电学院
ACOapplicationin
combinationaloptimization
王科平**
88206445keping_w@126.com
中兴科技
Facedetectionandrecognition
马春芝**
88200731ma402@163.com
华为公司
DataminingbasedonACO
陈茂**
88206445laomaolaile@hotmail.com
北京大唐电信
AES算法实现加解密芯片
孙柯柯**
88206445sunkeke@gmail.com
上海32研究所
AES加密模块IP实现
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课程教学
目前本人承担的教学任务：研究生教学
计算生物信息学导论自2006年起每年的秋季，46学时双语2009年获研究生院研究型课程建设项目资助
图的挖掘技术及应用0312209自2008年起每年的春季，30学时双语
本科生教学
数据挖掘自2007年起每年的秋季，26+8学时
算法设计与分析，数值分析，概率论，线性代数，组合数学2008年及以前的课程
课件下载示例
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招生要求
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关于研究生招生的信息：
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对学生的要求是：
课程方面：数学基础，如概率与数理统计，线性代数等；算法设计与分析，数据结构等计算机课程。能力方面：良好的编程和动手能力，英语阅读和书写能力，同学之间的协调合作能力。自我激励：具有学习的能动性，善于思考，善于提问，就感兴趣的问题积极讨论，深入钻研。今后我们将继续招收博士研究生，硕士研究生；并在原有的基础上，招收博士后，欢迎有志于从事科研工作的人员报考。祝所有报考的学生都能取得好的成绩！同时也谢谢你们的关注！
