基本信息

霍红卫　教授
博士生导师，硕士生导师
博士学科：计算机软件与理论，软件工程
硕士学科：计算机软件与理论　
工作单位：计算机学院
联系方式
通信地址：西安市西安电子科技大学163信箱，710071
电子邮箱：hwhuo@mail.xidian.edu.cn
办公电话：88202363
办公地点：计算中心201

个人简介
西安电子科技大学计算机学院教授、博士生导师，计算机软件与理论学术带头人，计算机科学系主任。先后于西北大学获理学学士，西安电子科技大学获工学硕士和博士学位。受到JeffreyS.Vitter教授邀请，2013年1月至2014年1月在堪萨斯大学（TheUniversityofKansas）做访问学者。先后主持国家自然科学基金、青年科学基金、博士点基金、南京大学计算机软件新技术国家重点实验室、华为基金等多项科研课题。曾获香港亿利达优秀论文奖，首届西安电子科技大学“十佳青年教师”称号，电子工业部科技进步三等奖（第一完成人），陕西省高等学校科学技术进步二等奖（第一完成人）。IEEE/CS及ACM会员。中国计算机学会高级会员。国际权威刊物IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics(TCBB)和BMCBioinformatics的审稿人。在《MathematicalandComputerModeling》,《JournalofBioinformaticsandComputationalBiology》,《PLoSONE》,《计算机学报》,《软件学报》,《电子学报》,DCC,BIBM,BIBE,CSB等国内外权威刊物和会议发表学术论文70余篇。

2012年邀请JeffreyS.Vitter教授访问西电（http://oice.xidian.edu.cn/html/news/express/2012/1218/1787.html）
（http://oice.xidian.edu.cn/html/news/guojijiaoliu/2012/1203/1778.html）
主要研究方向
大数据算法及压缩数据结构，并行与分布式算法，生物信息学算法，外存算法，算法工程


-----------------------------------------------------------------

基本信息

霍红卫　教授
博士生导师，硕士生导师
博士学科：计算机软件与理论，软件工程
硕士学科：计算机软件与理论　
工作单位：计算机学院
联系方式
通信地址：西安市西安电子科技大学163信箱，710071
电子邮箱：hwhuo@mail.xidian.edu.cn
办公电话：88202363
办公地点：计算中心201

个人简介
西安电子科技大学计算机学院教授、博士生导师，计算机软件与理论学术带头人，计算机科学系主任。先后于西北大学获理学学士，西安电子科技大学获工学硕士和博士学位。受到JeffreyS.Vitter教授邀请，2013年1月至2014年1月在堪萨斯大学（TheUniversityofKansas）做访问学者。先后主持国家自然科学基金、青年科学基金、博士点基金、南京大学计算机软件新技术国家重点实验室、华为基金等多项科研课题。曾获香港亿利达优秀论文奖，首届西安电子科技大学“十佳青年教师”称号，电子工业部科技进步三等奖（第一完成人），陕西省高等学校科学技术进步二等奖（第一完成人）。IEEE/CS及ACM会员。中国计算机学会高级会员。国际权威刊物IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics(TCBB)和BMCBioinformatics的审稿人。在《MathematicalandComputerModeling》,《JournalofBioinformaticsandComputationalBiology》,《PLoSONE》,《计算机学报》,《软件学报》,《电子学报》,DCC,BIBM,BIBE,CSB等国内外权威刊物和会议发表学术论文70余篇。

2012年邀请JeffreyS.Vitter教授访问西电（http://oice.xidian.edu.cn/html/news/express/2012/1218/1787.html）
（http://oice.xidian.edu.cn/html/news/guojijiaoliu/2012/1203/1778.html）
主要研究方向
大数据算法及压缩数据结构，并行与分布式算法，生物信息学算法，外存算法，算法工程


-----------------------------------------------------------------

科学研究
目前承担的科研项目：
1．大数据压缩索引与搜索算法研究国家自然科学基金2．多核系统mapReduce模型及算法研究国家自然科学基金3．多核系统并行算法研究博士点基金4．XML硬件加速，华为

-----------------------------------------------------------------

学术论文
1.QiangYu,HongweiHuo,JeffreyScottVitter,JunHuanandYakovNekrich,AnEfficientExactAlgorithmfortheMotifStemSearchProblemoverLargeAlphabets,IEEE/ACMTransactionsonComputationalBiologyandBioinformatics.Submitted
http://www.ittc.ku.edu/~jsv/Papers/YHV13.MotifStems.pdf
2.HongweiHuo,LonggangChen,JeffreyScottVitter,andYakovNekrich,APracticalImplementationofCompressedSuffixArrayswithApplicationstoSelf-indexing,DataCompressionConference(DCC),Snowbird,USA,2014.
http://www.ittc.ku.edu/~jsv/Papers/HCV13.PracticalCSAImplementation.pdf
3.QiangYu,HongweiHuo,JeffreyScottVitter,JunHuanandYakovNekrich,StemFinder:AnEfficientAlgorithmforSearchingMotifStemsoverLargeAlphabets,IEEEInternationalConferenceonBioinformaticsandBiomedicine(BIBM),Shanghai,pages473-476,2013.
4.YipuZhang,HongweiHuo,andQiangYu,AHeuristicCluster-basedEMAlgorithmforthePlanted(l,d)Problem,JBioinformComputBiol.,11(4):1350009,2013.
5.QiangYu,HongweiHuo,YipuZhang,HongzhiGuo,andHaitaoGuo,PairMotif+:AFastandEffectiveAlgorithmforDeNovoMotifDiscoveryinDNAsequences,InternationalJournalofBiologicalSciences,9(4):412-424,2013.
6.张懿璞,霍红卫,于强,用于转录因子结合位点识别的定位投影求精算法,计算机学报,36(12):2545-2559,2013.
7.YuQ,HuoH,ZhangY,andGuoH,PairMotif:ANewPattern-drivenAlgorithmforPlanted(l,d)DNAMotifSearch,PLoSONE,7(10):e48442,2012.
8.HongweiHuo,ShuaiLin,QiangYu,YipuZhang,andVojislavStojkovic,AMapReduce-basedAlgorithmforMotifSearch,2012IEEE26thInternationalParallelandDistributedProcessingSymposiumWorkshops(IPDPSW),Shanghai,pages2052-2060,2012.
9.霍红卫,郭丹丹,于强,张懿璞,牛伟,(l,d)-模体识别问题的遗传优化算法,计算机学报,35(7):1429-1439,2012.
10.于强,霍红卫,高效存储的深度包检测算法,软件学报,22(1):149-163,2011.
11.HongweiHuo,ZhenhuaZhao,andV.Stojkovic,OptimizingGeneticAlgorithmforMotifDiscovery,MathematicalandComputerModelling,52(11-12):2011-2020,2010.
12.HongweiHuo,V.Stojkovic,andQiaoluanXie,Aquantum-inspiredgeneticalgorithmbasedonprobabilisticcodingformultiplesequencealignment,JournalofBioinformaticsandComputationalBiology,8(1):59-75,2010.
13.HUOHongwei,YEMangu,andGAODongpei,Amemory-efficientmulti-dimensionalhardware-specificalgorithmforpacketclassification,ChineseJournalofElectronics,38(4):634-636,2010.
14.霍红卫,王小武,DNA序列中基于适应性后缀树的重复体识别算法,计算机学报,33(4):747-754,2010.
15.HongweiHuoandV.Stojkovic,Apartition-basedsuffixtreeconstructionanditsapplications,AdvancesinGreedyAlgorithms,bookchapter,Bookeditedby:WitoldBednorz,ISBN978-953-7619-27-5,I-Tech,Vienna,Austria,pages69-84,2008.
16.HongweiHuo,V.Stojkovic,andQiaoluanXie,andXubangShen,Aprobabilisticcodingbasedquantumgeneticalgorithmformultiplesequencealignment,inProceedingsofthe7thAnnualInternationalConferenceonComputationalSystemsBioinformatics(CSB),StanfordUniversity,California,USA,pages15-26,2008.
17.HongweiHuoandV.Stojkovic,ASuffixTreeConstructionAlgorithmforDNASequences,IEEE7thInternationalSymposiumonBioInformatics&BioEngineering(BIBE),HarvardUniversity,Boston,Massachusetts,USA,pages1178-1182,2007.
18.霍红卫,白帆,一种具有精确边界的重复体识别算法,计算机学报,31(2):214-219,2008.
19.霍红卫,肖智伟,基于最大权值路径算法的DNA多序列比对方法,软件学报,18(2):185-195,2007.
20.HongweiHuo,ZhenhuaZhao,V.Stojkovic,andLifangLiu,CombiningGeneticAlgorithmandRandomProjectionStrategyfor(l,d)-MotifDiscovery,TheFourthInternationalConferenceonBio-InspiredComputing:TheoriesandApplications(BICTA),PekingUniversity,Beijing,pages235-240,2009.
21.HongweiHuoandVojislavStojkovic,Two-phaseQuantumbasedEvolutionaryAlgorithmforMultipleSequenceAlignments,InternationalConferenceonComputationalIntelligenceandSecurity(CIS),Guangzhou,China,pages374-379,2006.
22.HongweiHuoandHuaMing,SimulatedAnnealingwithStar-alignmentforMultipleSequenceAlignments,LNAI3801,pages821-826,2005.


-----------------------------------------------------------------

荣誉获奖


-----------------------------------------------------------------

科研团队
团队教师
郭鸿志博士
2011年毕业于哈尔滨工业大学，获得计算机科学与技术博士学位

博士研究生
1.于强
2.张懿璞
3.郭海涛
4.严苗苗
5.孙春晓
6.孙志刚

硕士研究生
略。

-----------------------------------------------------------------

课程教学
目前本人承担的教学任务：
1．算法设计与分析，硕士学位课程
2．并行与分布式计算，博士学位课程
3．生物信息学算法，硕士选修课程


-----------------------------------------------------------------

招生要求
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
关于研究生招生的信息：
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
欢迎对我们研究方向感兴趣的同学报考！



-----------------------------------------------------------------

Profile
NameTitle:Professor&ChairHongweiHuoDepartment:ComputerScience
ContactInformation
Address:Email:Tel:
Introduction
Putbriefintroductionofyourselfhere
ResearchInterests
1．
2.
3．
4．
5．