环境工程学院下设环境工程系、给水排水工程系、建筑环境与设备工程系、应用化学系、给水排水实验室（部级重点实验室）、环境工程实验室、建筑环境与设备实验室、化学工程与生物工程实验室、环境科学研究实验室和环境研究工程研究所、市政与人工环境工程研究所、环境工程设计研究所、海威环境技术公司，从事教学、科研、和社会服务。学院设有环境工程、给水排水工程、建筑环境与设备工程、化学工程与工艺、生物工程五个本科专业。重点培养能从事本专业规划、设计、施工、管理、教育和科研开发等方面工作的高级技术人才。学院具有环境工程专业硕士学位授予权。