基础医学院的前身是基础医学部, 伴随着我校近50年的发展历程，历经整合变迁与发展，形成了今天的格局。现下设中医基础理论（含内经）、方剂学、解剖学、生物学、组织胚胎学、生物化学、生理学、病理生理学、病理学、计算机、数学等11个教研室，形态实验中心、解剖实验中心、机能实验中心、生物实验中心、计算机实验中心、中医药生物技术与免疫学实验中心等6个实验中心，其中国家中管局重点学科1个、省教育厅重点学科1个、院级重点学科1个；省级精品课程2门、校精品课程4门；规范化教研室3个，规范化实验中心4个。并拥有大学生科技创新基地1个，解剖学实验教学基地1个。

　　基础医学院教学用房面积6000多平方米，现有800元以上教学仪器设备1708台（套），总价值1217万余元，拥有国家中管局二级实验室4个，国家中管局三级实验室1个，陕西省重点实验室1个，省级研究所1个，研究室4个（其中省级1个、校级3个）。基础医学实验教学中心为“陕西省实验教学示范中心”。

　　基础医学院是我校特色鲜明、开拓创新的基础医学教育教学平台。现有专任教师87人，其中教授18人，副教授36人，讲师27人，助教6人；实验技术人员18人，其中高级实验师4人，实验师9人，助理实验师5人。具有博士学位者占40%，硕士以上学位者占80%。师资队伍职称结构、学历结构、年龄结构、学缘结构较为合理、发展趋势良好。经过近50年的积淀，我院拥有一支团结、勤奋、求实、创新的高素质教学团队，有一批勤奋敬业，师德高尚，严谨治学、从严治教，寓育人于教书之中的优秀教师，涌现出省优秀教师4人，省师德标兵2人，省劳动模范1人，享受政府特殊津贴专家4人，校“十大名师”4人，省级优秀教学团队1个。

　　基础医学院现有3个硕士研究生培养点，分别为中医基础理论、方剂学和中西医结合基础（含生理学、生物学、生物化学、病理学、病理生理学、解剖学等方向）。有博士生导师4人，硕士生导师23人。

　　基础医学院在近50年的建设与发展中，注重素质，鼓励创新，强化实践，努力打造部门特色，着力夯实本科基础教学，紧跟现代科技发展的步伐，注重培养学生的实践动手能力，在生物技术的教学、研究与应用方面成果显著，学术交流活动蔚然成风。近5年来我院教师承担省厅级教改课题12项；主编、参编国家级规划教材33部，出版或自编实验教材、实验讲义30余部，创新和自制实验教学多媒体课件5套，获省级和校级各类教学成果奖10余项, 省级优秀教材奖3项。承担省厅级以上科研项目95项，其中国家自然科学基金4项，发表学术论文510余篇，发表科研论文230多篇，其中SCI收录11篇, 获得科研成果奖励21项，其中省部级科技奖3项。研究水平居于全国同类院校领先地位。