农学院作物遗传育种学科创建于1951年，1958年起招收3届研究生，1978年恢复招收研究生，1984年被山西省定为10个省级重点学科之一，1990年获硕士学位授权点。
　　
　　该系目前已形成三个稳定的研究方向，作物新种质、新品种的创育及遗传理论的研究，植物染色体工程育种，作物优异基因的转移，78—94年共培养硕士生35名，95—99年共招收硕士生25名，2000至今，在校硕士生30名。目前开设的主要课程：细胞遗传学、数量遗传学、高级作物育种学、细胞生物学、分子遗传学、分子生物学、高级种子学、基因工程原理与技术、植物显微技术、专业外语等。
　　
　　作物遗传育种系现有教师13人，其中教授4人，副教授3人，讲师4人，助教2人。近五年来主持完成的科研项目29项，其中国家级7项，研究经费333万元，获国家级奖2项，省部级7项，发表研究论文183篇，专著7部，该系拥有专业实验室1681平方米，万元以上仪器91台件，价值516.3万元，遗传实验室、育种实验室、研究室分别为：大豆育种研究室、小麦育种研究室、棉花育种研究室、烟草育种研究室、重点学科实验室（配备大量的先进仪器设备）。
　　
　　目前作物遗传育种系实验研究条件得到进一步改善，学科建设稳步发展，学术梯队整体实力强，我们有信心，有能力把作物遗传育种系建设成为全国同类学科中的一流学科。