海岸带环境恶化对生态系统的影响主要表现为生物多样性的变化。由于微生物对环境状况的指示作用和物质循环的驱动作用，对其群落结构特征的研究具有重要意义。

中科院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室李佳霖博士针对国内养殖污染对潮间带生态环境的影响问题，采用t-RFLP技术，对大连和秦皇岛不同功能类型海岸潮间带沉积物中的微生物群落结构特征进行比对和分析，并通过16S rRNA基因文库解析养殖污染对微生物群落结构产生的影响。研究发现养殖污染使微生物丰度、香农指数和均匀度明显增高，其对群落结构的影响已明显大于地理隔离效应。对多个站位建立的克隆文库显示γ-变形菌纲是主要存在的微生物类群。盐度、磷酸盐、硝酸盐和叶绿素a浓度是影响微生物群落结构的主要环境因子，而产生群落结构差异的主成分类群为γ-变形菌纲、梭菌纲、黄杆菌纲、芽孢杆菌纲和浮霉菌纲。

本研究揭示了微生物群落结构对养殖污染环境压力的响应，为探索环境压力的敏感指示物种及潜在修复物种提供了基础性资料，并为海岸带环境可持续发展提供了微生物群落可耐受能力的考核参数。研究成果发表于国际著名微生物杂志《Microbial Ecology》(DOI: 10.1007/s00248-013-0272-6)。