临床医学系是泰山医学院开设专业最早、目前在校生规模最大的系。现有临床医学本、专科、临床医学专（科）升本（科）、临床医学（老年医学）本科、临床医学（中西医结合）本、专科、临床医学与计算机（三至四年级）、临床医学与英语（四至六年级）等学历层次和专业方向，现有在校生3347名。
　　
　　泰山医学院实行临床医学系与附属医院合一管理体制，领导班子、各职能管理部门、各教研室与相应临床科室等完全合并，医疗、教学、科研等一体化管理。附属医院是一所省属的大型综合性医院（情况介绍请看本网站上页），系院合一后优势互补、资源共享，综合实力大增强，更有力的保证了教学工作。
　　
　　临床医学系（附属医院）明确二名党政领导具体分管教学与学生管理工作，专门设有教育科、学生工作办公室、团总支等教学与学生管理部门，共设有内科学、外科学、妇产科学、儿科学、诊断学、中医学、传染病学、神经内科学、口腔科学、眼科学、耳鼻喉科学、急诊医学、皮肤性病学、精神病学、核医学等15个教研室。内科学、外科学、妇产科学、老年医学、影像医学与核医学、运动医学7个专业及相关32个专业方向为硕士研究生培养点。目前有见习、实习医院30所，每年要选派在校学生到日本爱媛大学学习。
　　
　　临床医学系十分重视教学和学生管理工作，突出重点，狠抓学生入学、见习、实习、毕业等关键环节的工作，采取有力措施狠抓考试及格率、四、六级英语考试通过率、专升本率、考研率、毕业生就业率等工作，经常组织开展适合大学生特点的文体活动，使学生的综合素质不断提高。
　　
　　多年来，在学院党委的正确领导下，临床医学系教学与学生管理工作取得了较为显著的成绩。学生英语四级通过率达98%以上，英语六级通过率达60%以上，考研率达30%以上，毕业生初次就业率（毕业离校时）达70%以上，毕业当年就业率达100%，每年都有一大批学生获得省、市、校级荣誉称号。