基础医学部组建于1985年，目前有15个教研室、4个综合实验室和1个流行病研究所，承担全院各专业的医学基础课和专业基础课的教学任务。生物技术（制药）专业归基础医学部管理。病理学和病理生理学、神经生物学、流行病与卫生统计学为硕士授权点；人体解剖学和组织胚胎学为山东省普通高等学校教学改革试点课程；生理学、组织胚胎学、人体解剖学、病原生物学、病理学5门课程为院一类课程。现有教职工163人，其中教师136人，实验技术人员29人。教授18人，副教授38人；博士15人，硕士40人，硕士生导师16人。有省级专业技术拔尖人才1人，院级专业拔尖人才2人；享受国务院政府特殊津贴1人；省级中青年学术骨干和学科带头人培养对象6人。
　　
　　在科研工作方面，主持与合作承担国家自然科学基金课题5项；省部级科研与教学课题15项；省多个部门研究课题40余项。获得省部级教学与科技成果一等奖1项、二等奖2项、三等奖10项；省教育厅、省卫生厅、省计生委多部门科技进步奖30余项。出版教材和专著26部；发表论文1000余篇。