54、微胶囊生物有机肥的中试生产及推广，济南市科技成果转化基金项目，2007-2009
55、利用微藻开发生物柴油的研究，山东省支撑计划项目，2008-2010
56、利用工业固体废物研制有机肥及中试示范工程建设，山东省支撑计划，省科技厅，2007-2009，山东省科学院中日友好生物技术研究中心，李纪顺主持
奖励（22项）
1989、山东省马铃薯细菌病害研究。山东省第二届优秀学术成果三等奖，第二名。
1990、山东省马铃薯细菌病害研究。山东农业大学科学技术进步二等奖，第二名。
1994、高效生物农药－－姜瘟灵。第八届全国发明展览会铜牌奖。中国发明协会.唯一受奖人。
1994、稀土提高蔬菜产量和品质的研究.济南市科学技术进步三等奖。列第三位。
1995、蔬菜青枯病生防制剂研究。山东省科学院科学技术进步二等奖。列第一位。
1996、小麦全蚀病生防制剂－－嗜铁素产生菌制剂中试。山东省科学院科学技术进步二等奖。列第一位。
2000、山东省农业系统先进个人，三等奖。
2003、农作物土传病害生防菌剂（B908）研制与开发，云南省科技进步二等奖，主要贡献者（R06）
2003、山东省留学回国创业奖，山东省人民政府
2003、山东省科学院优秀论文二等奖（杨合同，唐文华，迟建国，徐砚珂。植病生防菌株B1301的种类鉴定、作用机理及其对生姜青枯病的防治，中国生物防治，18（1）：21-24）
2004、多功能微生物制剂的研制及其在中国农业上的应用，山东省科学院科技进步二等奖，第一位
2004、一种新型生物可完全降解塑料PHB的化学合成研究，山东省科学院自然科学奖一等奖，第三位
2005、生物杀菌剂与PGPR系列产品研究与开发，山东省科学院科技进步三等奖，第一位。
2005、聘请的澳大利亚专家Maarten Ryder博士荣获“齐鲁友谊奖”，山东省人民政府人事厅
2005、植物病害生物防治菌的改造以及制剂研制，山东省优秀引智项目
2006、木霉菌的遗传改造，山东省科学院自然科学奖，三等，第一位
2006、聘请的澳大利亚专家Maarten Ryder博士荣获“山东省国际科学技术合作奖”，山东省人民政府
2007、“山东省植物病理学科优秀人才”荣誉称号，山东省植物病理学会授予
2007、“多功能微生物制剂及其在中国农业上的应用”，山东省科学技术进步二等奖，第一位，（主要完成人：杨合同，李纪顺，陈凯，郭勇，韩德强，蒋红彬）。
2007、“多功能低抗药性风险的新型生物源农药技术研究”。江苏省科技进步奖二等奖。（郭坚华、罗玉明、马忠华、魏利辉、刘红霞、李红叶、杨合同、李健强、李师默、祁红英、叶永浩、陈利锋、张志高）
2008、“绿色木霉LTR-2菌株及其制剂”，2008年度济南市发明专利二等奖，杨合同、李纪顺、陈凯、郭勇、黄玉杰、王加宁、周红姿
2008、“生物杀菌剂与PGPR系列产品研究与开发”，2008年度山东省科技进步三等奖，杨合同,李纪顺,陈凯,郭勇,黄玉杰,周红姿
发明专利13项（授权10项）
1、荧光假单胞杆菌、用于果蔬防病保鲜的菌剂及其生产工艺（已授权）
发明人：唐文华、张力群、王烨、杨合同、周洪友。专利号：ZL 01 1 42063.4。
2、可完全降解塑料聚-beta-羟基丁酸酯的化学合成方法（已授权）
发明人：王加宁、马沛生、杨合同、聂玉敏、王彦飞、姚碗生。专利号：ZL 02 1 00406.4。
3、一种哈茨木霉真菌菌株（已授权）
申请人：何月秋，发明人：何月秋、张乃明、李作森、杨合同。专利号：ZL 2003 1 0104197.5
4、巨大芽孢杆菌内切葡聚糖酶的基因及其制备方法（已授权）
发明人：杨合同，黄玉杰，李纪顺，Maarten Ryder，Paul Harvey。专利号：ZL 2004 1 0035737.3
5、奶牛之犊牛前胸腺素基因及其克隆方法与应用（已授权）
发明人：张显升、魏艳丽、李红梅、任艳、张大伟、杨合同。专利号：ZL 2004 1 0035736。
6、绿色木霉LTR-2菌株及其制剂（已授权）
发明人：杨合同、李纪顺、陈凯、郭勇、黄玉杰、王加宁、周红姿。专利号：ZL 2005 1 0104385.7。
7、吡喃酮抗生素及其制备方法与应用（已授权）
发明人：杨合同、陈凯、王加宁、李纪顺、扈进冬、张广志。专利号：ZL200510104387.6。
8、间苯三酚乙酰基衍生物及其合成方法与应用（已授权）
发明人：高永超、孔学、杨合同、王加宁、陈贯虹、聂玉敏，专利号：ZL 2005 1 0044250.6。
9、间苯三酚丙酰基衍生物及其合成方法与应用（已授权）
发明人：孔学、高永超、杨合同、王加宁、陈贯虹、聂玉敏。专利号：ZL 2005 1 0044251.0。
10、一种无致病性双核丝核菌、发酵方法及其制剂与应用
李纪顺，陈 凯，杨合同，周红姿，苏 哈，郭 勇，黄玉杰，张新建。申请（专利）号： CN200610070048.5。
11、伯克氏菌多功能工程菌株及其构建方法。
发明人：杨合同,黄玉杰,张新建,陈凯,李纪顺,郭勇,A·巴扎诺娃,D·巴扎诺夫。申请号：200710016278.8
12、 降解石油污染物及石油产品的固体微生物菌剂及制备方法（已授权）
发 明 (设计)人：王加宁;李超敏;黄国强;杨合同;孔 学;张新建;李鑫钢;廉景燕。专利号：ZL200710013906.7。
13、杀棉叶螨苏云金芽孢杆菌悬浮剂、制备方法及应用
发明人：杨合同、李纪顺等，申请号：200910013850.4，
发表论文情况
2009 张广志，张新建，扈进冬，王贻莲，杨合同（通讯作者）。有机磷农药降解菌的筛选及降解能力测定。河南农业科学，2009,03:63-65
2009 张广志，杨合同（通讯作者），李纪顺，扈进冬。多功能芽孢杆菌的分离、筛选及活性测定。江苏农业科学，1:298-300
2009 陈凯，杨合同（通讯作者），李纪顺，张广志，黄玉杰，赵晓燕。木霉菌产生的聚酮类抗生性代谢产物。中国生物防治。25（2）：171-175
2009 陈凯，扈进冬，李纪顺，张彦杰，杨合同（通讯作者）。绿色木霉菌LTR-2产生的真菌柴油—烷烃类物质及其衍生物。山东科学，22（2）：13-18