长链非编码RNA AL109955.1在80例结直肠癌组织中的表达及对细胞增殖与迁移侵袭的影响

李宁^1,2,李娟^1,2,谢艳^1,2,李培龙^1,2,王允山^1,2,杜鲁涛^1,2,王传新^1,2

1.山东大学第二医院检验医学中心, 山东 济南 250033;2.山东省肿瘤标志物检测工程实验室, 山东 济南 250033

发布日期:2020-07-10
通讯作者:王传新. E-mail:cxwang@sdu.edu.cn

基金资助:国家自然科学基金(81772271);山东省重大科技创新工程项目(2018YFJH0505);山东大学基本科研专项资金资助(2018JC002)

Expression of LncRNA AL109955.1 in 80 cases of colorectal cancer and its effect on cell proliferation, migration and invasion

LI Ning^1,2, LI Juan^1,2, XIE Yan^1,2, LI Peilong^1,2, WANG Yunshan^1,2, DU Lutao^1,2, WANG Chuanxin^1,2

1. Department of Clinical Laboratory, The Second Hospital, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan 250033, Shandong, China;
2. Tumor Marker Detection Engineering Laboratory of Shandong Province, Jinan 250033, Shandong, China

Published:2020-07-10

摘要/Abstract

摘要： 目的 探讨长链非编码RNAs(LncRNAs)AL109955.1在结直肠癌(CRC)组织中的表达水平及其对CRC细胞增殖和迁移侵袭的影响。 方法 对癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)中的CRC数据和基因型组织表达数据库(GTEx)中正常组织数据合并分析,筛选在CRC组织中低表达且与患者不良预后相关的LncRNAs,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的方法在80例经病理学确诊的CRC组织及癌旁正常组织中验证其表达。采用细胞增殖检测试剂盒(CCK8)检测细胞增殖能力,以划痕实验和Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力。同时利用网页分析工具TargetScan和Tarbase,对下游miRNAs及其靶基因进行筛选和功能富集分析,使用cytoscape(3.7.2)软件构建LncRNA-miRNAs-mRNA的ceRNA调控网络。 结果 研究发现了一种新的LncRNA AL109955.1,其在CRC组织中的表达水平(1.18±2.46)较癌旁正常组织(1.81±1.65)明显降低(t=2.142,P=0.008)。进一步分析结果显示,AL109955.1的表达水平在不同分化程度的肿瘤组织中有差异［低分化:0.18(0.10~0.55)、中分化:0.49(0.22~1.81)、高分化:0.87(0.15~3.33)］;此外,随着肿瘤瘤体的增加,AL109955.1的表达水平逐渐降低［≥5 cm:0.26(0.11~0.62)、<5 cm:0.49(0.181~1.99)］,且差异具有统计学意义(U=570.5,P=0.020)。CCK8实验结果显示,AL109955.1能够显著抑制CRC细胞的增殖能力。划痕实验与Transwell实验结果则显示过表达AL109955.1后,细胞的迁移与侵袭能力明显下降。基因功能注释和基因通路富集分析显示AL109955.1可能通过影响Wnt、p53、Notch以及Jak-STAT等肿瘤经典信号通路从而发挥其生物学作用。 结论 LncRNA AL109955.1在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织,并可抑制CRC细胞的增殖、迁移和侵袭。


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