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刘永军
性别：男
学位：博士在职信息：在职
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博士生导师 硕士生导师 出生日期：1964-10-07学历：研究生(博士)毕业毕业院校：山东大学在职信息：在职所在单位：化学与化工学院入职时间：2004-09-14办公地点：化学二楼308
个人简介教育经历工作经历社会兼职 研究方向团队成员
个人简介Personal profile
个人简介：
刘永军（Liu Yongjun），男，1964年10月生，理学博士，教授，博士生导师。
联系电话：**
邮箱：yongjunliu_1@sdu.edu.cn
地址：山东省济南市历城区山大南路27号，山东大学中心校区化学新楼308室
课题组主要研究方向：1）催化反应机理研究； 2）功能材料体系的理论计算与分子模拟。在国际期刊如J. Am. Chem. Soc., Nature Comm., ACS Catalysis, Phys. Chem. Chem. Phys., J. Phys. Chem. , Biochemistry等发表SCI论文150余篇，主持承担国家自然科学基金面上项目、国防973项目子课题、中国科学院百人计划项目、省部级项目近20项.
学习及工作经历
教育简历
2001.11-2004.06 加拿大Simon Fraser University,化学系，博士后
1998.09-2001.06 山东大学，化学与化工学院，物理化学专业，理学博士学位
1985.09-1988.06 延边大学，理学院化学系,有机化学专业，理学硕士学位
1981.09-1985.06 曲阜师范大学，化学与化工学院，化学专业，理学学士学位
工作经历
2004.10-至今山东大学化学与化工学院，教授,物理化学专业/理论与计算化学专业,博士生导师。
1988-2004曲阜师范大学化学院工作，1992年晋升为讲师、1995年破格晋升为副教授、1998年破格晋升为教授。
2006年入选中国科学院“百人计划”，2006-2012期间，兼任中国科学院西北高原生物研究所研究员。
2015年7月至今，兼任英国皇家化学会RSC Advances期刊副主编。
科研项目
主持的国家级科研项目:
1. 国家自然科学基金面上项目(2021.1-2024.12)酶催化降解含卤芳烃污染物机理的理论研究
2. 国家重点研发计划子课题（2020.1-2024.12）新分子的生化反应设计与生物合成
3. 国家自然科学基金面上项目(2018.1-2021.12)基于脂肪酸生物合成脂肪烃的酶催化脱羧及脱甲酰基机理研究
4. 国家自然科学基金面上项目(2016.1-2017.12):几类SAM自由基酶催化机理的理论研究
5. 国家自然科学基金面上项目 (2014.1-2017.12):alpha-糖苷酶与糖苷合成酶的催化机理研究
6. 国家自然科学基金面上项目 (2012.1-2015.12):维生素B1依赖酶催化机理的理论研究
7. 国防973子课题（2010.1-2014.12）典型超级xxxxxx
8. 中国科学院“百人计划”人才项目（择优支持）
另外主持完成其它省部级及横向项目10余项。
发表的代表性论文：
1. Ge Tian, Hao Su, and Yongjun Liu*.Mechanism of Sulfoxidation and C?S Bond Formation Involved in the Biosynthesis of Ergothioneine Catalyzed by Ergothioneine
Synthase (EgtB). ACS Catalysis. 2018, 8, 5875-5889.
2. Hao Su, Xiang Sheng, Wenyou Zhu, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*.Mechanistic Insights into the Decoupled Desaturation and Epoxidation Catalyzed by Dioxygenase AsqJ Involved in the Biosynthesis of Quinolone Alkaloids. ACS Catalysis. 2017, 7, 5834-5843.
3. Beibei Lin, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*. Mechanism of the Glutathione Persul?de Oxidation Process Catalyzed by Ethylmalonic Encephalopathy Protein 1. ACS Catalysis. 2016, 6, 7010-7020.
4. Guangcai Ma, Wenyou Zhu, Hao Su, Na Cheng, Yongjun Liu*.Uncoupled Epimerization and Desaturation by Carbapenem Synthase: Mechanistic Insights from QM/MM Studies. ACS Catalysis. 2015, 5, 5556-5566.
5. Wenyou Zhu, Yongjun Liu*.Ring Contraction Catalyzed by the Metal-Dependent Radical SAM Enzyme: 7?Carboxy-7-deazaguanine Synthase from B. multivorans. Theoretical Insightsinto the Reaction Mechanism and the In?uence of Metal Ions. ACS Catalysis. 2015, 5, 3953-3965.
6. Xiaohua Chen*, Guangcai Ma, Weichao Sun, Hongjing Dai, DongXiao, Yangfang Zhang, Xin Qin, YongjunLiu*, Yuxiang Bu. Water promoting electron hole transport betweentyrosine and cystein in proteins via special mechanism: Double proton coupledelectron transfer. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 4515-4524.
7. Xiya Wang, Junyou Shi, and Yongjun Liu*. Oxidative Rearrangement Mechanism of Pentalenolactone F Catalyzed by Cytochrome P450 CYP161C2 (PntM). Inorg. Chem. 2018, 57, 8933-8941.
8. Hao Su, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*. Theoretical Insights into the Mechanism and Stereoselectivity of Ole?n Cyclopropanation Catalyzed by Two Engineered CytochromeP450 Enzymes. Inorg. Chem. 2018, 57, 11738-11745.
9. Jie Bai, Qianqian Hou, Wenyou Zhu, and Yongjun Liu*. Mechanical insights into the oxidative cleavage of resveratrol catalyzed by dioxygenase NOV1: confirmation of dioxygenase mechanism by QM/MM calculations. Catal. Sci. Technol.,2019, 9,444.
10. Hong Li, Xiya Wang, Ge Tian and Yongjun Liu*. Insights into the dioxygen activation and catalytic mechanism of the nickel-containing quercetinase. Catal. Sci. Technol.,2018,8, 2340.
11. Xiya Wang,Wenyou Zhu and Yongjun Liu*. Tryptophan lyase (NosL): mechanistic insights into amine dehydrogenation and carboxyl fragment migration by QM/MM calculations. Catal. Sci. Technol.,2017, 7, 2846.
12. Xiya Wang, Hao Su and Yongjun Liu*. Insights into the unprecedented epoxidationmechanism of fumitremorgin B endoperoxidase (FtmOx1) from Aspergillus fumigatus by QM/MM calculations. Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 7668.
13. Ge Tian and Yongjun Liu*. Mechanistic insights into the catalytic reaction offerulic acid decarboxylase from Aspergillus niger: a QM/MM study. Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 7733
14. Hao Su, Xiang Sheng and Yongjun Liu*. Exploring the substrate specificity and catalytic mechanism of imidazolonepropionase (HutI) from Bacillus subtilis. Phys. Chem. Chem. Phys., 2016, 18,27928.
15. Shujun Zhang, Xiya Wang and Yongjun Liu*. Cleavage mechanism of the aliphatic C–C bond catalyzed by 2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase from sp. 4HAP: a QM/MM study. Catal. Sci. Technol., 2017, 7,911.
16. Hao Su, Xiang Sheng and Yongjun Liu*.I nsights into the catalytic mechanism of
N-acetylglucosaminidase glycoside hydrolase from Bacillus subtilis: a QM/MM study. Org. Biomol. Chem. 2016, 14, 3432.
17. Wenyou Zhu,Yongjun Liu*, and Baoping Ling. Quantum Mechanics and Molecular Mechanics Study of the Catalytic Mechanism of Human AMSH-LP Domain Deubiquitinating Enzymes. Biochemistry, 2015, 54, 5225-5234.
18. Qianqian Hou, Xiang Sheng, and Yongjun Liu*.QM/MM studies of the mechanism of unusual bifunctional fructose-1,6-bisphosphate aldolase/phosphatase. Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 11366.
19. Xiang Sheng, and Yongjun Liu*.A QM/MM study of the catalytic mechanism of nicotinamidase. Org. Biomol. Chem. 2014, 12, 1265.
20. Xiang Sheng, and Yongjun Liu*. QM/MM Study of the Reaction Mechanism of the Carboxyl Transferase Domain of Pyruvate Carboxylase from Staphylococcus aureus. Biochemistry, 2014, 53, 4455-4466.
教育经历Education experience
[1]1998.9--2001.6 山东大学>物理化学>博士 [2]1985.9--1988.7 延边大学>有机化学>理学硕士学位 [3]1981.7--1985.7 曲阜师范大学>化学>理学学士学位 [4]1978.9--1981.7 山东省淄博六中
工作经历Work experience
[1]2004.9--至今 山东大学[2]1988.7--2004.9 曲阜师范大学
社会兼职Professional affiliations
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研究方向Research direction
[1]理论与计算化学
团队成员Team members
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博士生导师 硕士生导师 出生日期：1964-10-07学历：研究生(博士)毕业毕业院校：山东大学在职信息：在职所在单位：化学与化工学院入职时间：2004-09-14办公地点：化学二楼308
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刘永军（Liu Yongjun），男，1964年10月生，理学博士，教授，博士生导师。
联系电话：**
邮箱：yongjunliu_1@sdu.edu.cn
地址：山东省济南市历城区山大南路27号，山东大学中心校区化学新楼308室
课题组主要研究方向：1）催化反应机理研究； 2）功能材料体系的理论计算与分子模拟。在国际期刊如J. Am. Chem. Soc., Nature Comm., ACS Catalysis, Phys. Chem. Chem. Phys., J. Phys. Chem. , Biochemistry等发表SCI论文150余篇，主持承担国家自然科学基金面上项目、国防973项目子课题、中国科学院百人计划项目、省部级项目近20项.
学习及工作经历
教育简历
2001.11-2004.06 加拿大Simon Fraser University,化学系，博士后
1998.09-2001.06 山东大学，化学与化工学院，物理化学专业，理学博士学位
1985.09-1988.06 延边大学，理学院化学系,有机化学专业，理学硕士学位
1981.09-1985.06 曲阜师范大学，化学与化工学院，化学专业，理学学士学位
工作经历
2004.10-至今山东大学化学与化工学院，教授,物理化学专业/理论与计算化学专业,博士生导师。
1988-2004曲阜师范大学化学院工作，1992年晋升为讲师、1995年破格晋升为副教授、1998年破格晋升为教授。
2006年入选中国科学院“百人计划”，2006-2012期间，兼任中国科学院西北高原生物研究所研究员。
2015年7月至今，兼任英国皇家化学会RSC Advances期刊副主编。
科研项目
主持的国家级科研项目:
1. 国家自然科学基金面上项目(2021.1-2024.12)酶催化降解含卤芳烃污染物机理的理论研究
2. 国家重点研发计划子课题（2020.1-2024.12）新分子的生化反应设计与生物合成
3. 国家自然科学基金面上项目(2018.1-2021.12)基于脂肪酸生物合成脂肪烃的酶催化脱羧及脱甲酰基机理研究
4. 国家自然科学基金面上项目(2016.1-2017.12):几类SAM自由基酶催化机理的理论研究
5. 国家自然科学基金面上项目 (2014.1-2017.12):alpha-糖苷酶与糖苷合成酶的催化机理研究
6. 国家自然科学基金面上项目 (2012.1-2015.12):维生素B1依赖酶催化机理的理论研究
7. 国防973子课题（2010.1-2014.12）典型超级xxxxxx
8. 中国科学院“百人计划”人才项目（择优支持）
另外主持完成其它省部级及横向项目10余项。
发表的代表性论文：
1. Ge Tian, Hao Su, and Yongjun Liu*.Mechanism of Sulfoxidation and C?S Bond Formation Involved in the Biosynthesis of Ergothioneine Catalyzed by Ergothioneine
Synthase (EgtB). ACS Catalysis. 2018, 8, 5875-5889.
2. Hao Su, Xiang Sheng, Wenyou Zhu, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*.Mechanistic Insights into the Decoupled Desaturation and Epoxidation Catalyzed by Dioxygenase AsqJ Involved in the Biosynthesis of Quinolone Alkaloids. ACS Catalysis. 2017, 7, 5834-5843.
3. Beibei Lin, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*. Mechanism of the Glutathione Persul?de Oxidation Process Catalyzed by Ethylmalonic Encephalopathy Protein 1. ACS Catalysis. 2016, 6, 7010-7020.
4. Guangcai Ma, Wenyou Zhu, Hao Su, Na Cheng, Yongjun Liu*.Uncoupled Epimerization and Desaturation by Carbapenem Synthase: Mechanistic Insights from QM/MM Studies. ACS Catalysis. 2015, 5, 5556-5566.
5. Wenyou Zhu, Yongjun Liu*.Ring Contraction Catalyzed by the Metal-Dependent Radical SAM Enzyme: 7?Carboxy-7-deazaguanine Synthase from B. multivorans. Theoretical Insightsinto the Reaction Mechanism and the In?uence of Metal Ions. ACS Catalysis. 2015, 5, 3953-3965.
6. Xiaohua Chen*, Guangcai Ma, Weichao Sun, Hongjing Dai, DongXiao, Yangfang Zhang, Xin Qin, YongjunLiu*, Yuxiang Bu. Water promoting electron hole transport betweentyrosine and cystein in proteins via special mechanism: Double proton coupledelectron transfer. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 4515-4524.
7. Xiya Wang, Junyou Shi, and Yongjun Liu*. Oxidative Rearrangement Mechanism of Pentalenolactone F Catalyzed by Cytochrome P450 CYP161C2 (PntM). Inorg. Chem. 2018, 57, 8933-8941.
8. Hao Su, Guangcai Ma, and Yongjun Liu*. Theoretical Insights into the Mechanism and Stereoselectivity of Ole?n Cyclopropanation Catalyzed by Two Engineered CytochromeP450 Enzymes. Inorg. Chem. 2018, 57, 11738-11745.
9. Jie Bai, Qianqian Hou, Wenyou Zhu, and Yongjun Liu*. Mechanical insights into the oxidative cleavage of resveratrol catalyzed by dioxygenase NOV1: confirmation of dioxygenase mechanism by QM/MM calculations. Catal. Sci. Technol.,2019, 9,444.
10. Hong Li, Xiya Wang, Ge Tian and Yongjun Liu*. Insights into the dioxygen activation and catalytic mechanism of the nickel-containing quercetinase. Catal. Sci. Technol.,2018,8, 2340.
11. Xiya Wang,Wenyou Zhu and Yongjun Liu*. Tryptophan lyase (NosL): mechanistic insights into amine dehydrogenation and carboxyl fragment migration by QM/MM calculations. Catal. Sci. Technol.,2017, 7, 2846.
12. Xiya Wang, Hao Su and Yongjun Liu*. Insights into the unprecedented epoxidationmechanism of fumitremorgin B endoperoxidase (FtmOx1) from Aspergillus fumigatus by QM/MM calculations. Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 7668.
13. Ge Tian and Yongjun Liu*. Mechanistic insights into the catalytic reaction offerulic acid decarboxylase from Aspergillus niger: a QM/MM study. Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 7733
14. Hao Su, Xiang Sheng and Yongjun Liu*. Exploring the substrate specificity and catalytic mechanism of imidazolonepropionase (HutI) from Bacillus subtilis. Phys. Chem. Chem. Phys., 2016, 18,27928.
15. Shujun Zhang, Xiya Wang and Yongjun Liu*. Cleavage mechanism of the aliphatic C–C bond catalyzed by 2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase from sp. 4HAP: a QM/MM study. Catal. Sci. Technol., 2017, 7,911.
16. Hao Su, Xiang Sheng and Yongjun Liu*.I nsights into the catalytic mechanism of
N-acetylglucosaminidase glycoside hydrolase from Bacillus subtilis: a QM/MM study. Org. Biomol. Chem. 2016, 14, 3432.
17. Wenyou Zhu,Yongjun Liu*, and Baoping Ling. Quantum Mechanics and Molecular Mechanics Study of the Catalytic Mechanism of Human AMSH-LP Domain Deubiquitinating Enzymes. Biochemistry, 2015, 54, 5225-5234.
18. Qianqian Hou, Xiang Sheng, and Yongjun Liu*.QM/MM studies of the mechanism of unusual bifunctional fructose-1,6-bisphosphate aldolase/phosphatase. Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 11366.
19. Xiang Sheng, and Yongjun Liu*.A QM/MM study of the catalytic mechanism of nicotinamidase. Org. Biomol. Chem. 2014, 12, 1265.
20. Xiang Sheng, and Yongjun Liu*. QM/MM Study of the Reaction Mechanism of the Carboxyl Transferase Domain of Pyruvate Carboxylase from Staphylococcus aureus. Biochemistry, 2014, 53, 4455-4466.
教育经历Education experience
[1]1998.9--2001.6 山东大学>物理化学>博士 [2]1985.9--1988.7 延边大学>有机化学>理学硕士学位 [3]1981.7--1985.7 曲阜师范大学>化学>理学学士学位 [4]1978.9--1981.7 山东省淄博六中
工作经历Work experience
[1]2004.9--至今 山东大学[2]1988.7--2004.9 曲阜师范大学
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科学研究
中文主页-科学研究研究领域
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1刘永军.A water-assisted nucleophilic mechanism utilized by BphD, the meta-cleavage product hydrolase in biphenyl degradation.Journal of Molecular Graphics and Modelling,2020. 2闫丽娟.The Retaining Mechanism of Xylose Transfer Catalyzed by Xyloside α 1,3-Xylosyltransferase (XXYLT1): a Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study.Journal of Chemical Information and Modeling,2020. 3李红.Mechanistic Investigation of Isonitrile Formation Catalyzed by the Nonheme Iron/α-KG-Dependent Decarboxylase (ScoE).ACS catalysis,2020. 4李心怡.Theoretical Study of Iron Porphyrin Nitrene: Formation Mechanism, Electronic Nature, and Intermolecular C-H Amination.Inorganic chemistry,2020.专利
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1新分子的生化反应设计与生物合成, 2020-01-01-2024-12-31 2基于脂肪酸生物合成脂肪烃的酶催化脱羧及脱甲酰基机理研究, 2017-08-17-2021-12-31 3油品减阻机理研究及抗剪切减阻剂的分子设计, 2010-06-01-2012-12-01 4几类SAM自由基酶催化机理的理论研究, 2015-08-17-2017-12-31科研团队
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1刘永军.A water-assisted nucleophilic mechanism utilized by BphD, the meta-cleavage product hydrolase in biphenyl degradation.Journal of Molecular Graphics and Modelling,2020. 2闫丽娟.The Retaining Mechanism of Xylose Transfer Catalyzed by Xyloside α 1,3-Xylosyltransferase (XXYLT1): a Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study.Journal of Chemical Information and Modeling,2020. 3李红.Mechanistic Investigation of Isonitrile Formation Catalyzed by the Nonheme Iron/α-KG-Dependent Decarboxylase (ScoE).ACS catalysis,2020. 4李心怡.Theoretical Study of Iron Porphyrin Nitrene: Formation Mechanism, Electronic Nature, and Intermolecular C-H Amination.Inorganic chemistry,2020.专利
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1新分子的生化反应设计与生物合成, 2020-01-01-2024-12-31 2基于脂肪酸生物合成脂肪烃的酶催化脱羧及脱甲酰基机理研究, 2017-08-17-2021-12-31 3油品减阻机理研究及抗剪切减阻剂的分子设计, 2010-06-01-2012-12-01 4几类SAM自由基酶催化机理的理论研究, 2015-08-17-2017-12-31科研团队
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论文成果
中文主页-科学研究-论文成果[1]刘永军.A water-assisted nucleophilic mechanism utilized by BphD, the meta-cleavage product hydrolase in ....Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2017.[2]闫丽娟.The Retaining Mechanism of Xylose Transfer Catalyzed by Xyloside α 1,3-Xylosyltransferase (XXYLT....Journal of Chemical Information and Modeling, 2020.[3]李红.Mechanistic Investigation of Isonitrile Formation Catalyzed by the Nonheme Iron/α-KG-Dependent D....ACS catalysis, 2020.[4]李心怡.Theoretical Study of Iron Porphyrin Nitrene: Formation Mechanism, Electronic Nature, and Intermol....Inorganic chemistry, 2020.[5]林蓓蓓.Mechanistic insights into the γ？elimination reaction of l？methionine catalyzed by methionine ....Theoretical Chemistry Accounts, 2017.[6]李红.Mechanism of Uncoupled Carbocyclization and Epimerization Catalyzed by Two Non-Heme Iron/alpha-Ke....Journal of Chemical Information and Modeling, 59,5086, 2019.[7]刘永军and刘汝涛.Conversion mechanism of enoyl thioesters into acyl thioesters catalyzed by 2-enoyl-thioester redu....PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS Journal, 2019.[8]刘永军and李恒帅.The charge regulation of electronic structure and optical properties of graphitic carbon nitride ....RSC Adv., 9,7464, 2019.[9]刘永军and盛翔.Computational evidence for the importance of lysine carboxylation in the reaction catalyzed by ca....Theoretical Chemistry Accounts, 138, 2019.[10]刘永军.Mechanism of fatty acid decarboxylation catalyzed by a non-heme iron oxidase (UndA): a QM/MM stud....Org. Biomol. Chem, 2019.共221条1/23 首页上页下页尾页页个人信息
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博士生导师 硕士生导师 出生日期：1964-10-07学历：研究生(博士)毕业毕业院校：山东大学在职信息：在职所在单位：化学与化工学院入职时间：2004-09-14办公地点：化学二楼308
科研项目
中文主页-科学研究-科研项目新分子的生化反应设计与生物合成, 2020-01-01-2024-12-31基于脂肪酸生物合成脂肪烃的酶催化脱羧及脱甲酰基机理研究, 2017-08-17-2021-12-31油品减阻机理研究及抗剪切减阻剂的分子设计, 2010-06-01-2012-12-01几类SAM自由基酶催化机理的理论研究, 2015-08-17-2017-12-31alpha-糖苷（水解）酶与糖苷合成酶的催化机理研究, 2013-08-15-2017-12-31缔合型减阻剂的分子设计, 2008-11-01-2011-06-30分子模拟相关参数及固液面行为研究（二）, 2011-06-29-2011-12-31课题分账：耐温耐盐低张力泡沫剂分子设计与构效关系研究（三）, 2010-05-05-2010-12-31硫胺素依赖酶催化机理的理论研究, 2012-01-01-2015-12-31醛唐还原酶催化机理的QM/MM方法研究, 2010-01-01-2012-12-31 共11条1/2 首页上页下页尾页页个人信息
刘永军
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博士生导师 硕士生导师 出生日期：1964-10-07学历：研究生(博士)毕业毕业院校：山东大学在职信息：在职所在单位：化学与化工学院入职时间：2004-09-14办公地点：化学二楼308
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1计算量子化学2结构化学3结构化学4计算量子化学教学成果
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授课信息
中文主页-教学研究-授课信息本科生课程
课程名称： 学年： 学期： 学时： 学分： 课程号：
结构化学 2019-2020 秋学期64 4 sd01130890
结构化学 2018-2019 春学期64 4 sd01130890
计算量子化学 2018-2019 春学期36 2 0220073
结构化学 2018-2019 64 4 sd01130890
计算量子化学 2017-2018 春学期36 2 0220073
研究生课程
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计算量子化学 2018-2019 春学期36 2 0220073
结构化学 2018-2019 64 4 sd01130890
计算量子化学 2017-2018 春学期36 2 0220073
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计算量子化学 2019-2020 春学期36 2 0220073
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