柳军涛
柳军涛
1988年11月生；讲师；硕士生导师；博士
研究领域：生物信息学；组合优化
联系方式
地址：山东省威海市文化西路180号，山东大学（威海）数学与统计学院
邮编：264209
电子邮件：juntao@sdu.edu.cn；juntaosdu@126.com

行政职务与学术兼职
1. Frontiers in Genetics杂志：Review Editor; 2.多个学术杂志（如：Bioinformatics, BMC Genomics, Applied Spectroscopy, Plos One等）的审稿人；

访问经历
2015.10 - 2016.10，美国加州大学河滨分校，计算机科学与工程系，联合培养博士
学习经历
2012.09 - 2017.06，山东大学数学学院，运筹学与控制论，博士学位
2008.09 - 2012.06 山东大学数学学院，信息与计算科学，学士学位
工作经历
2017.07 -至今，山东大学（威海）数学与统计学院
项目

1. 基于参考基因组的转录组拼接算法研究及其在癌症中的应用，国家自然科学基金青年基金，25万，主持，2019/01-2021/12；
2.基于高通量RNA-seq数据的转录组拼接算法设计与应用，山东省自然科学基金培养基金，5万，主持，2018/03-2020/06;
3.基于二代RNA-seq数据转录组拼接的理论研究与算法设计，中国博士后科学基金面上资助，5万，主持；
4. 癌症基因组中关键驱动突变信号通路的理论问题研究及算法设计，国家自然科学基金委员会面上项目，280万，参与,2016.01 - 2019.12；
5. 基于数据整合的生物大数据分析理论与关键技术，国家自然科学基金委员会重点项目，50万，参与,2015.01 - 2019.12；

论著
11. Zengchao Mu, Ting Yu, Enfeng Qi, Juntao Liu^# (通讯作者), Guojun Li(2019.06) DCGR: Feature extractions from protein sequences based on CGR via remodeling multiple information. BMC Bioinformatics, 20:351. (SCI, 2区，IF：2.511)
10. Juntao Liu, Ting Yu, Zengchao Mu, Guojun Li. TransLiG: a de novo transcriptome assembler that uses line graph iteration.Genome Biology, 28(81).（SCI, IF: 14.028）
9. Juntao Liu, Xiangyu Liu, Xianwen Ren, Guojun Li. scRNAss: a single-cell RNA-seq assembler via imputing dropouts and combing junctions.Bioinformatics, 2019.(SCI, IF：4.531)
8.Juntao Liu,Ting Yu, Tao Jiang, Guojun Li. TransComb: genome-guided transcriptome assembly via combing junctions in splicing graphs.Genome Biology, 2016,17(213).（SCI, IF: 14.028）
7.Juntao Liu, Guojun Li, Zheng Chang, Ting Yu, Bingqiang Liu, Rick McMullen, Pengyin Cheng, Xiuzhen Huang. BinPacker: Packing-Based De Novo Transcriptome Assembly from RNA-seq Data.Plos Computational Biology, 2016, 12(2): e**.（SCI, IF: 4.428）
6.Juntao Liu, Jianyang Sun, Xiuzhen Huang, Guojun Li, Bingqiang Liu. Goldindec: A Novel Algorithm for Raman Spectrum Baseline Correction.Applied Spectroscopy, 2015, 69(7): 834.（SCI, IF: 1.872）
5.Juntao Liu, Xiaoyun Duan, Jianyang Sun, Yanbin Yin, Guojun Li, Lushan Wang, Bingqiang Liu. Bi-Factor Analysis Based on Noise-Reduction (BIFANR): A New Algorithm for Detecting Coevolving Amino Acid Sites in Proteins.Plos One, 2013, 8(11):e79764.（SCI, IF: 2.766）
4. Bo Gao, Yue Zhao, Yang Li,Juntao Liu, Lushan Wang, Guojun Li, Zhengchang Su. Prediction of Driver Modules via Balancing Exclusive Coverages of Mutations in Cancer Samples.Advanced Science, 2018. (SCI, IF: 8.129)
3. Ashraful Arefeen,Juntao Liu, Xinshu Xiao, Tao Jiang. TAPAS: Tool for Alternative Polyadenylation Site Analysis.Bioinformatics, 2018.（SCI, IF: 4.531）
2. Bo Gao, Guojun Li,Juntao Liu, Yang Li, Xiuzhen Huang. Identification of driver modules in pan-cancer via coordinating coverage and exclusivity.Oncotarget, 2017, 8(22): 36115. （SCI, IF: 5.168）
1. Zheng Chang, Guojun Li,Juntao Liu, Yu Zhang, Cody Ashby, Deli Liu, Carole L. Cramer, Xiuzhen Huang. Bridger: A new framework for de novo transcriptome assembly using RNA-seq data.Genome Biology,2015, 16(30).（SCI, IF: 14.028）

在读研究生（以入学时间为序）
王春祥（硕士）