建筑系成立于1985年，设建筑学、城市规划两个本科专业。每个专业每年招收一个班，每班24～30人。1992年增设环境艺术专科专业，1993年改为本科专业（文科艺术类），每年招收一个班，每班20人。1999年该专业脱离建筑系，成立艺术设计系。
1995年建筑学专业从92级学生开始，学制改为5年。2000年城市规划专业从99级开始，学制改为5年。目前两个专业每年各招生2～3个班，每班30余人。全系现有24个班，在校学生801人。2000年6月，建筑学专业通过全国高等学校建筑学专业教育评估委员会组织的本科教育评估，获建筑学学士学位授予权。
2000年城市规划与设计和建筑技术科学两个学科获得硕士学位授予权，2003年建筑设计及其理论获得硕士学位授予权。
经过40余年的努力，山东建筑工程学院建筑系经历了曲折起伏和健康发展的漫长历程，业已具有建筑设计及其理论和城市规划与设计两个校级重点学科。至今已招收城市规划本科学生25届，建筑学本科学生20届，环境艺术本科学生6届，专科学生1届，为国家输送了2000余名建筑学及相关专业的专门人才，成为山东省培养建筑学及相关专业工程技术人才和管理人才的重要基地。
