蓝细菌有一个强有力的昼夜节律振荡器,称为Kai系统,是由KaiC, KaiB和KaiA三种蛋白质组成,在ATP的存在下,可以计时。KaiC六聚物在一个昼夜24小时进行自体磷酸化,并与不同数目的KaiB和KaiA结合成不同的形式。Science发表文章对Kai系统进行了研究,研究通过质谱分析进行监控,研究定量的KaiCB与KaiCAB的组装。研究数据揭示了Kai蛋白之间的相互作用,并为研究蛋白振荡器的规律组装提供的结构基础。
从蓝细菌到动物,许多生命体都进化有内在生物钟适应地球的昼夜循环。这些生物钟使得基因表达和代谢的节律周期约为24小时。许多昼夜节律依赖于复杂的转录-翻译调解网络,蓝细菌和人类红细胞中的生物钟为转译后节律振荡器,稍微简单。蓝细菌的节律振荡器——Kai系统由KaiC, KaiB和KaiA三种蛋白质组成,非常稳定,可以通过在ATP存在的情况下孵化纯化的KaiC, KaiB和KaiA蛋白进行重组,这种体外节律振荡器可以稳定保持几周。
Kai系统中的三种蛋白质通过与KaiC的自身磷酸化与脱磷酸化相关的动态组装形成KaiCB和KaiCBA复合体形成昼夜节律。单个的Kai系统蛋白质的原子结构已经明确,但复合体的结构尚不明确。KaiB在溶液中可以单体、二聚体和四聚体的形式存在,KaiB六聚体可以与KaiC六聚体结合,但KaiB与KaiC的结合域尚不明确。
实验中通过在30摄氏度的条件下一定摩尔配比的三种蛋白质反应,通过质谱分析研究该条件下Kai蛋白质的组装。通过摩尔配比的调整和实验条件的改变,最终得到了KaiC6B6A12 和 KaiC6B6两种组装,通过冷冻电子显微镜获得两种复合体的原子结构模型,如图1。
图1 Cryo-EM map and pseudoatomic model of the KaiCBA complex.
在实验的基础上,研究人员提出了体外Kai系统的在ATP存在情况下的组装模式,如图2所示。该模型可以作为进一步研究蓝细菌细胞生物钟的框架。
图2蓝细菌生物钟周期性组装的结构基础
(A) 昼夜循环中单个Kai蛋白的过渡结构(B) KaiCBA振荡器的分子结构。磷酸化作用是的KaiB单体结合到KaiC的C1区域,形成KaiCB复合体(II). KaiCB为KaiA的结合提供基础,进一步形成KaiCBA复合体(III). KaiA簇促使KaiC自动脱磷酸化,通过释放KaiBA亚基,重新产生KaiC单体(IV).
原文链接:http://science.sciencemag.org/content/355/6330/1181.full
编译 苏郁洁
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
Science:蓝细菌生物钟结构研究_青岛生物能源与过程研究所
青岛生物能源与过程研究所 免费考研网/2017-12-08
相关话题/系统 结构 基础 实验 动物
伯克利实验室与小企业合作实现清洁能源产品商业化_青岛生物能源与过程研究所
加州大学伯克利——劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)将与清洁能源的小型企业合作,以加快其创新生物能源、建筑和汽车技术的商业化。这是2015年7月美国能源部(DOE)推出的小企业资助(SBV)试点的一部分。SBV试点是国家合作性的努力,将为9个能源技术领域的小企业提供高达2000万美元资助。九个能 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08Nature报道具有多孔结构的液体材料_青岛生物能源与过程研究所
一个国际联合研究小组宣称,他们合成了世界首种具有永久性多孔结构的液体材料。这种液体对气体具有极强的吸纳和溶解能力,有望提升目前许多化学反应的反应效率,并在碳捕获等领域获得应用,相关论文发表在11月12日出版的《自然》杂志上(Nature,2015,DOI:10.1038/nature16072)。 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08光合膜蛋白超分子复合物精细结构获解析_青岛生物能源与过程研究所
5月29日,美国《科学》杂志以封面文章的形式发表了中国科学院植物研究所沈建仁和匡廷云研究团队的一项突破性研究成果,研究人员获得了高等植物光系统I(PSI-LHCI)光合膜蛋白超分子复合物2.8埃的世界最高分辨率晶体结构。 科研人员经过多年的累积,首次全面解析了高等植物PSI-LHCI光合膜蛋白超分 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08美国农业部投资1亿美元发展生物燃料基础设施建设_青岛生物能源与过程研究所
2015年5月29日,美国农业部部长宣布将投资1亿美元用于生物燃料基础设施建设,并为探索提高可再生燃料混掺比例的测试和评估项目提供配套资金。2014年美国乙醇出口贸易额达到20亿美元,是世界上最大的乙醇输出国。目前,传统的气泵设施可以输送的混掺燃料中生物乙醇最大含量为10%,限制了消费者对于可再生能 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08人工光合作用系统新进展_青岛生物能源与过程研究所
美国劳伦斯伯克利国家实验室与加利福尼亚大学联合构建了一种复杂的半导体纳米线和微生物系统,可以模拟自然界中的光合作用过程,并且系统还可以将光合作用中释放的二氧化碳与水合成醋酸盐,该系统是生物科学与材料科学的跨学科研究成果,文章发表于杂志NanoLetters。Thisbreak-througharti ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08自然:科学家确定植物光合作用“单位”立体结构_青岛生物能源与过程研究所
日本研究人员在新一期《自然》杂志上报告说,他们明确了植物体内一种光合作用“单位”的立体结构。这一发现将有助于模拟植物光合作用的技术研发,有望为解决能源问题提供新思路。 植物叶绿体内的光系统Ⅱ是一种光合作用“单位”,它是蛋白质和催化剂的复合体,能够吸收太阳光的能量,将水分解为氧和氢离子。 日本冈山 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-08学术报告通知——缺氧诱导因子等 bHLH-PAS家族蛋白的结构与功能研究(山东大学 武大雷 教授)_青岛生物能源与过程研究所
报告题目:缺氧诱导因子等bHLH-PAS家族蛋白的结构与功能研究 报告人:武大雷教授 工作单位:山东大学 报告时间:2017年11月20日(星期一)下午16:00-17:00 报告地点:行政楼205会议室 报告人简介: 武大雷,山东大学生命科学学院、微生物技术国家重点实验室教授、博士生导 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-07学术报告通知——细菌六型分泌系统的离子转运新功能(西北农林科技大学 沈锡辉 教授)_青岛生物能源与过程研究所
报告题目:细菌六型分泌系统的离子转运新功能 报告人:沈锡辉教授 工作单位:西北农林科技大学 报告时间:2017年11月20日(星期一)下午14:00-15:00 报告地点:行政楼205会议室 报告人简介: 沈锡辉,西北农林科技大学生命科学学院教授、博士生导师,国家杰出青年科学基金获得者( ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-07群体遗传学在家犬驯化和人工选择上的应用(中科院昆明动物研究所 王国栋 副研究员)_青岛生物能源与过程研究所
报告题目:群体遗传学在家犬驯化和人工选择上的应用 报告人:王国栋副研究员 报告单位:中国科学院昆明动物研究所 报告时间:2017年4月25日(星期二),下午14:00-15:00 报告地点:行政楼205会议室 报告人简介: 王国栋,博士,中国科学院昆明动物所副研究员,隶属分子进化与基 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-07界面电化学基础及应用探索(中科院长春应化所 牛利 研究员 )_青岛生物能源与过程研究所
报告题目:界面电化学基础及应用探索 报告人:牛利研究员 工作单位:中国科学院长春应用化学研究所 报告时间:2017年4月19日(星期三)上午9:30 报告地点:能源楼111会议室 报告人简介: 牛利研究员,博士生导师,中国科学院长春应用化学研究所现代分析技术工程实验室主任。国家杰出青年科 ...青岛生物能源与过程研究所 青岛生物能源与过程研究所 免费考研网 2017-12-07