马庆军，博士，责任研究员，博士生导师。研究方向为海洋微生物病害发生的分子机制及防治。
2014年至今，中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室，研究员。
2004-2007，欧洲分子生物学实验室汉堡分部，博士后。
2000-2003，德国哥廷根大学结构化学系，自然科学博士。
1997-2000，中国科学院生物物理研究所，分子生物学硕士。
1993-1997，南开大学，微生物学学士。
研究领域
主要对海洋病原微生物致病相关蛋白的三维结构与功能进行系统研究，在结构和机制的基础上尝试靶向药物与疫苗设计。
近期代表性工作：（1）报道了白斑综合症病毒dUTPase的晶体结构，发现该酶的活性位点由两亚基组成，更新了dUTPase三聚体家族蛋白由三亚基共同组成活性位点的传统认识。本研究扩展了dUTPase三聚体家族的结构多样性，并为氨基酸序列插入、缺失和置换协同推进蛋白质进化提供了一个典型案例,同时针对其结构的独特性有望进行白斑综合症病毒特异性靶向抑制药物的设计和开发。（2）报道了创伤弧菌磷脂酶A2（VvPlpA）的晶体结构, 是不耐热溶血素家族蛋白中解析的首个三维结构，为弧菌病的药物设计提供了新的靶点信息。该研究还发现了“丝氨酸-组氨酸-氯离子”这一不同寻常的催化三联体类型，拓展了人们对催化三联体和氯离子功能的认识。
招生专业及方向
海洋生物学（免疫学基础及应用）
研究室及联系方式
实验海洋生物学重点实验室，海洋生物蛋白结构功能及应用课题组。
地址：办公室2号楼134室，实验室2号楼129室，
邮箱：qma@qdio.ac.cn，
电话：。
承担的主要科研项目
1、中科院海洋研究所引进人才项目，海洋结构生物学；
2、海洋国家实验室“鳌山人才”计划资助项目，海洋生命过程与资源利用；
3、海洋国家实验室“鳌山科技创新”计划资助项目，近海健康养殖关键技术研究；
4、国家自然科学基金项目，对虾白斑综合症病毒胸苷激酶-胸苷酸激酶嵌合蛋白的分子特性探究（**）；
5、国家自然科学基金项目，基于对虾白斑综合症病毒dUTPase结构的抑制剂设计及抗病毒活性研究（**）。
研究成果及奖励
已在PNAS、J Biol Chem、J Virol和Acta Crystallogr D等国际权威期刊发表论文30余篇，他引逾600次。
代表性论文及著作
近期论文代表作有：
1. Ye Wan#, Changshui Liu#, Qingjun Ma*. Structural analysis of a vibrio phospholipase reveals an unusual Ser-His-chloride catalytic triad. Journal of Biological Chemistry, 2019. 294:11391-11401.（封面论文，编辑精选，期刊同期专题评论）
2. Kun Zang, Fuhua Li, Qingjun Ma*. The dUTPase of white spot syndrome virus assembles its active sites in a noncanonical manner. Journal of Biological Chemistry, 2018. 293:1088-1099.