袁剑波　副研究员海洋生物学

研究方向：海洋生物学
职　　称：副研究员
部　　门：实验海洋生物学重点实验室
联系方式：
电子邮件：yuanjb@qdio.ac.cn
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　　理学博士，研究方向为海洋生物学，主要从事海洋无脊椎动物基因组学和进化生物学研究。成功组装凡纳滨对虾基因组框架图，揭示对虾基因组高密度简单串联重复和基因组倍型等特征，为全基因组选择育种奠定基础，相关成果发表于Nature子刊Nature Communications上；完成中国明对虾基因组组装，为虾类比较基因组学工作奠定基础；成功组装仿刺参基因组框架图，揭示了棘皮动物脊索咽鳃裂等形态进化生物学问题，以及再生相关关键信号通路，相关成果发表于PLoS Biology上；完成了日本对虾、斑节对虾和脊尾白虾基因组低深度测序和基因组结构特征分析，在多个复杂基因组的组装、进化生物学问题解析，以及比较基因组学和适应性进化分析等方面取得了一系列重要研究成果。以第一作者身份发表SCI论文11篇，通讯作者论文2篇，其中9篇均为JCR一区文章，累计影响因子53.66，合作发表文章20篇，文章总引用443次。主持国家自然科学基金青年基金和面上项目各一项，作为科研骨干参与国家重点研发项目和自然科学基金重点项目等十余项。
教育经历
●2009.09-2014.07，中科院海洋研究所，海洋生物学专业，博士学位；
●2005.09-2009.07，电子科技大学，生物技术专业，学士学位；

工作经历
●2018.01 -至今，中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室，副研究员；
●2017.01-2018.01，中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室，助理研究员；
●2014.07-2017.01，中科院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室，博士后；

主持或参加主要科研项目情况
1、国家自然科学基金面上项目，对虾基因组简单重复序列的爆发与适应性进化研究（**），2019.1-2022.12，62万元，主持，在研。
2、国家自然科学基金青年科学基金项目，通过比较转录组学和适应性进化分析探索对虾的盐度适应性机制（**），2016.1-2018.12，21万元，主持，在研。
3、国家重点研发计划，虾蟹类新种质创制技术平台，2018.12-2022.12，961万元，参与，在研。
4、国家自然科学基金重点项目，凡纳滨对虾抗副溶血弧菌性状的遗传基础及调控机制研究，2019.01-2022.12，290万元，参与，在研。
5、“科学”号高端用户项目，采用多组学方法研究典型深远海甲壳动物和棘皮动物的环境适应特征，2018.08-2020.08，80万元，参与，在研。

发表的代表性文章（限10篇）
(1) Xiaojun Zhang+, Jianbo Yuan+, Yamin Sun+, Shihao Li+, Yi Gao+, Yang Yu+, et al. Penaeid shrimp genome provides insights into benthic adaptation and frequent molting. Nature communications. 2019, 10(356):1-14. (并列一作, IF=12.35)
(2) Jianbo Yuan, Yi Gao, Lina Sun, Songjun Jin, Xiaojun Zhang*, Chengzhang Liu, Fuhua Li and Jianhai Xiang. Wnt signaling pathway linked to intestinal regeneration via evolutionary patterns and gene expression in the sea cucumber Apostichopus japonicus. Frontiers in genetics. 2019, 10(112):1-13. (IF=4.15)
(3) Jianbo Yuan, Yi Gao, Xiaojun Zhang*, Chengzhang Liu, Fuhua Li, Jianhai Xiang*. Genome sequences of marine shrimp Exopalaemon carinicauda Holthuis provide insights into genome size evolution of Caridea. Marine Drugs. 2017, 15(213):1-18. (IF=3.50)
(4) Xiaojun Zhang+, Lina Sun+, Jianbo Yuan+, Yamin Sun+, Yi Gao+, Libin Zhang+, Shihao Li+, Hui Dai, Jean-Franc？ois Hamel, Chengzhang Liu,Yang Yu, Shilin Liu, Wenchao Lin, Kaimin Guo, Songjun Jin, Peng Xu, Kenneth B. Storey, Pin Huan, Tao Zhang, Yi Zhou, Jiquan Zhang, Chenggang Lin,Xiaoni Li, Lili Xing, Da Huo, Mingzhe Sun, Lei Wang, Annie Mercier*, Fuhua Li*, Hongsheng Yang*, Jianhai Xiang*. The sea cucumber genome provides insights into morphological evolution and visceral regeneration. Plos Biology. 2017, 15(10): e**. (并列一作，IF=9.79)
(5) Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang, Chengzhang Liu, Yang Yu, Jiankai Wei, Fuhua Li and Jianhai Xiang*. Genomic resources and comparative analyses of two economical penaeid shrimp species, Marsupenaeus japonicus and Penaeus monodon. Marine Genomics. 2018, 39:22-25. (IF=1.92)
(6) Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang*, Chengzhang Liu, Hu Duan, Fuhua Li, Jianhai Xiang*. Convergent Evolution of the Osmoregulation System in Decapod Shrimps. Marine Biotechnology. 2017, 19:76-88. (IF=3.06)
(7) Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang*, Chengzhang Liu, Xiaoqing Sun, Elayaraja Sivaramasamy, Fuhua Li, Jianhai Xiang*. Comparative genomics analysis of decapod shrimps in the Pancrustacea clade. Biochemical Systematics and Ecology. 2016, 64:111-121. (IF=0.93)
(8) Jianbo Yuan, Meiling Yang, Jianfeng Ren, Beide Fu, Yun Yu, Feng Jiang and Xiaojun Zhang*. Analysis of genomic characters reveals that four distinct gene clusters are correlated with different functions in Burkholderia cenocepacia AU 1054. Applied Microbiology and Biotechnology. 2014. 98:361-372. (IF=3.34)
(9) Jianbo Yuan, Xiaojun Zhang*, Chengzhang Liu, Jiankai Wei, Fuhua Li, Jianhai Xiang*. Horizontally transferred genes in the genome of Pacific white shrimp, Litopenaeus vannamei. BMC evolutionary biology. 2013. 13(165):1-16. (IF=3.41)
(10) Jianbo Yuan, Qingming Zhu and Bin Liu*. Phylogenetic and Biological Significance of Evolutionary Elements. PLoS ONE. 2013, 9(1): e84330. (IF=3.53)

获得的相关奖励
1. 2018年度海洋科学技术奖二等奖. 2018. 对虾免疫防御体系的系统解析及应用途径研究,主要完成人：李富花、相建海、李诗豪、张晓军、于 洋、张继泉、袁剑波、柳承璋、张成松、于奎杰。