删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)

海洋所绘制完成菊黄东方鲀基因组草图_海洋研究所

海洋研究所 免费考研网/2017-12-10

近日,中国科学院海洋研究所宋林生研究员研究团队绘制完成菊黄东方鲀基因组草图。

  菊黄东方鲀俗称“满天星”(图A),隶属鲀形目、东方鲀科,在亚洲有着悠久的食用历史和极高的经济价值,也是我国重要的河鲀养殖品种之一。科研人员依托中科院海洋所自主构建的海洋生物基因资源平台和超算平台独立完成了菊黄东方鲀(Takifugu flavidus)全基因组的测序、拼装及分析,利用SOLiD 4第二代高通量测序仪测序得到总长度76.0 Gb的序列,并创新性地采用“辅助拼接”策略拼接获得scaffolds 50,947条(scaffold N50为305,741 bp)。研究发现菊黄东方鲀基因组在GC含量和重复序列等多方面与红鳍东方鲀基因组相似,菊黄东方鲀基因组中共有30,285个蛋白编码基因,蛋白平均长度为519.9个氨基酸,获得51,990条GO注释信息(图B~D),117 条KEGG通路信息和270,803条InterPro注释信息。

  该项研究积累了东方鲀属鱼类的遗传背景资料,为深度发掘海洋动物功能基因、开展蛋白功能的高效验证分析奠定了基础。相关研究结果在DNA Research发表(全文链接http://dnaresearch.oxfordjournals.org/content/early/2014/07/22/dnares.dsu025.long )。


相关话题/基因 信息 序列 海洋 中国科学院

  • 领限时大额优惠券,享本站正版考研考试资料!
    大额优惠券
    优惠券领取后72小时内有效,10万种最新考研考试考证类电子打印资料任你选。涵盖全国500余所院校考研专业课、200多种职业资格考试、1100多种经典教材,产品类型包含电子书、题库、全套资料以及视频,无论您是考研复习、考证刷题,还是考前冲刺等,不同类型的产品可满足您学习上的不同需求。 ...
    本站小编 Free壹佰分学习网 2022-09-19
  • 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目“典型弧后盆地热液活动及其成矿机理”课..._海洋研究所
    7月31日至8月1日,由中国科学院海洋研究所承担的国家重点基础研究发展计划(973计划)项目“典型弧后盆地热液活动及其成矿机理”课题中期评估会议在青岛召开。  科技部项目责任咨询专家马福臣研究员、赵振华研究员、丁悌平研究员,国家自然科学基金委员会任建国处长,科技部基础研究管理中心陈友淦主管,山东省科 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 海洋所刺参池塘生态苗种培育和资源修复技术取得新进展_海洋研究所
    图1.培育的刺参生态苗种  目前我国刺参增养殖模式主要是围堰和池塘养殖,在水深4-5m的浅海也进行少量增养殖,南方一些地方也进行笼养。浅海增养殖的刺参与围堰和池塘养殖的刺参相比,更加接近野生环境自然生长的刺参,品质和价格相对较高,2014年浅海增养殖鲜活刺参售价高达80-120元/500g,而池塘养 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 中国近海海洋观测研究网络荣成楮岛两套浮标成功布放_海洋研究所
    7月16日,中国近海海洋观测研究网络07号综合观测研究浮标和01号水质浮标成功布放于荣成楮岛附近海域观测站点。  07号浮标为直径3米的综合观测研究浮标系统,搭载了海洋气象、水文物理和水质等观测设备,主要观测项目有海洋气象参数、水文参数和水质参数等。2014年6月9日,该浮标被渔船撞击损坏,经过技术 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 海洋研究所三疣梭子蟹“科甬1号”新品种培育成功_海洋研究所
    三疣梭子蟹是我国海水养殖的主导种类之一,年产值近100亿元,以浙江和江苏为代表的东海沿岸的养殖面积和产量居全国首位。自2005年以来,海洋研究所实验海洋生物学重点实验室崔朝霞研究员带领其科研团队与宁波大学合作,在浙江省开展了三疣梭子蟹优良品种的选育工作,成功培育出三疣梭子蟹“科甬1号”新品种,并获得 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 中科院海洋所两个山东省地方标准顺利通过审定_海洋研究所
    中国科学院海洋研究所和马山集团有限公司制定的山东省地方标准《刺参生态苗种培育技术规范》和《脉红螺》顺利通过山东省质量技术监督局组织的专家审定。  《刺参生态苗种培育技术规范》规定了刺参Apostichopusjaponicus生态苗种繁育和中间培育的设施和操作技术要点,适用于池塘和潟湖中刺参生态苗种 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 国家自然科学基金委员会-山东省人民政府 “海洋生态与环境科学研究中心”联合资助..._海洋研究所
    6月16日,国家自然科学基金委员会-山东省人民政府“海洋生态与环境科学研究中心”联合资助项目启动会在青岛召开。国家自然科学基金委员会、山东省科技厅和中国科学院海洋研究所等单位有关领导出席了启动会,来自中国科学院海洋研究所、中国海洋大学、国家海洋局第一海洋研究所、中国水产科学院黄海水产研究所和厦门大学 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 中国工程院“腐蚀成本经济性分析与防腐策略研究预研”项目启动_海洋研究所
    6月27日,中国工程院“腐蚀成本经济性分析与防腐策略研究预研”项目启动会在中国科学院海洋研究所召开,就全国腐蚀调查委员会的人员架构、腐蚀调查的领域,以及数据的采集分析方式等议题进行了深入研讨。  中国工程院二局副局长阮宝君、中国工程院侯保荣院士、中国科学院海洋研究所所长助理刘鹰、中国腐蚀与防护学会秘 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 海洋所科研人员编纂南海诸岛底栖海藻名录_海洋研究所
    中科院海洋所科研人员根据多年来我国南海的调查研究结果,结合相关文献资料,系统编纂了三沙市南海诸岛底栖海藻名录,并比较分析了该海区的海藻区系性质。  该名录包括红藻门、褐藻门和绿藻门3个门,21个目,43个科,总共291种底栖大型海藻,涉及的海区包括西沙、南沙、黄岩岛以及东沙等,并且对以上每种海藻在南 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 揭开暖池的神秘面纱——热带西太平洋次表层研究取得显著进展_海洋研究所
    王凡(右四)率队开展西太平洋考察,起航时与科考队员合影  ■薛坤  热带西太平洋及印度洋东部,存在多年平均海表温度在28℃的暖水区,被称为热带西太平洋暖池(以下简称“暖池”)。暖池的一丝一毫的变化都左右着亚洲、太平洋区域,甚至全球气候和某些重大自然灾害的形成与动向,可以说,对它的研究具有非常重要的意 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10
  • 全球腐蚀成本调研中国区工作正式启动_海洋研究所
    5月20日,全球腐蚀成本调研项目(IMPACT)中美合作协议签约仪式在北京举行,中国工程院院士、中国科学院海洋研究所研究员侯保荣,美国腐蚀工程师协会(NACE)主席HarveyHack博士、首席执行官BobChalker先生、全球腐蚀成本调研项目经理ElaineBowman女士等出席仪式。  侯保荣 ...
    海洋研究所 免费考研网 2017-12-10