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同济大学生命科学与技术学院研究生导师简介-施威扬
同济大学 免费考研网/2013-01-31
姓名:施威扬
学位:博士
研究领域:发育生物学,非编码RNA
研究方向:
1、Wnt/PlanarCellPolarity信号通路对脊索发育和神经嵴细胞迁移的调控
2、非编码RNA在神经发育,癌症跟人类疾病模型的作用
3、决定脊索发育的基因网络的进化与调控
E-mail:contingency@gmail.com
联系电话:021-65981839
通讯地址:
个人简介:
1997年本科毕业于清华大学生物系,2003年在美国WashingtonUniversityinSt.Louis获得博士学位(发育生物学),后在UniversityofCalifornia,Berkeley从事博士后研究,主要利用一种新的模式动物海鞘研究脊索动物早期胚胎发育的分子调控跟非编码RNA的生物学功能。
研究领域(具体内容):
1.脊索动物胚胎发育过程中,细胞极性化是定向运动的基础。我们的研究发现在经典的Wnt/PCP通路之外,FGF信号通路也对此起着重要的调节作用。它们通过共同控制一个下游的功能因子来决定多种细胞的机型极性化过程。我们正进一步在分子水平阐释这种调控的机制。
2.我们利用高通量测序技术在海鞘和其它物种中发现了一种和microRNA共生的新的非编码RNA,正在进一步研究各类非编码RNA在胚胎发育跟疾病模型(前列腺癌等)中的调节作用。
3.利用比较基因组学的方法去阐释脊索在进化过程中基因网络的组织与调控是如何变化的。我们并同时在利用这些转录组的信息,去鉴定影响人类新生儿开裂神经管这一先天发育缺陷的各种未知基因。
发表论文:(*通讯作者)
Hendrix,D,Levine,M&Shi,W*miRTRAP,acomputationalapproachtosystematicallyidentifymiRNAsinthesimplechordateCionaintestinalis.GenomeBiology2010,11(4):R39
Christiaen,L,Wagner,E,Shi,W&Levine,M.EmergingModelOrganisms:TheSeaSquirtCionaintestinalis.ColdSpringHarborProtocols2009(12)
Shi,W.,Hendrix,D,Levine,M&Haley,B.AdistinctclassofsmallRNAarisingfrompri-microRNAsequencesinasimplechordate.NatureStructuralandMolecularBiology16,183-189(2009)
Shi,W.*,Peyrot,S.,Munro,E.&Levine,M.FGF3inthefloorplatedirectsnotochordconvergentextensionintheCionatadpole.Development136,23-28(2009)
Shi,W.*&Levine,M.EphrinsignalingestablishesasymmetriccellfatesinanendomesodermlineageoftheCionaembryo.Development135,931-40(2008)
Beh,J.,Shi,W.,Levine,M.,Davidson,B.&Christiaen,L.FoxFisessentialforFGF-inducedmigrationofheartprogenitorcellsintheascidianCionaintestinalis.Development134,3297-305(2007).
Davidson,B.,Shi,W.,Beh,J.,Christiaen,L.&Levine,M.FGFsignalingdelineatesthecardiacprogenitorfieldinthesimplechordate,Cionaintestinalis.GenesDev20,2728-38(2006).
Shi,W.,Levine,M.&Davidson,B.Unravelinggenomicregulatorynetworksinthesimplechordate,Cionaintestinalis.GenomeRes15,1668-74(2005).
Davidson,B.,Shi,W.&Levine,M.UncouplingheartcellspecificationandmigrationinthesimplechordateCionaintestinalis.Development132,4811-8(2005).
Shi,W.Y.&Skeath,J.B.TheDrosophilaRCC1homolog,Bj1,regulates
nucleocytoplasmictransportandneuraldifferentiationduringDrosophiladevelopment.DevBiol270,106-21(2004).
Alvarez,A.D.,Shi,W.,Wilson,B.A.&Skeath,J.B.pannierandpointedP2actsequentiallytoregulateDrosophilaheartdevelopment.Development130,3015-26(2003).
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