姓名：
李程


学位：
博士

导师情况：
博士生导师

研究方向：
生物信息学、计算基因组学以及在癌症和神经科学领域的应用
E-mail：
lch3000@gmail.com

通讯地址：
上海市四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院（200092）

个人简介：
1995年毕业于北京师范大学数学系，主修计算机专业，获学士学位。2001年毕业于加州大学洛杉矶分校，获统计专业博士学位。2001年起在哈佛公共卫生学院及Dana-Farber癌症研究所的生物统计与计算生物学系从事博士后研究，2002年起任助理教授，2008年起任副教授。研究组开发的dChip软件和相关数据分析方法被广泛应用于基因表达和SNP生物芯片的数据分析和展示，主要文章被引用1800余次。在Nature、NatureGenetics、Blood、PNAS、BMCGenomics等刊物发表论文60余篇。目前做为PI由美国国家卫生院R01项目研究资助。

代表文章(SelectedPublications)：
1.LiC,andWongWH.Model-basedanalysisofoligonucleotidearrays:Expressionindexcomputationandoutlierdetection,Proc.Natl.Acad.Sci.2001;98,31-36
2.LinM,WeiLJ,SellersWR,LieberfarbM,WongWH*,andLiC*.dChipSNP:SignificancecurveandclusteringofSNP-array-basedloss-of-heterozygositydata.Bioinformatics2004;20:1233-1240.
3.ZhaoX,LiC,PaezJG,ChinK,JännePA,ChenTH,GirardL,MinnaJ,ChristianiD,LeoC,GrayJW,SellersWR,MeyersonM.Anintegratedviewofcopynumberandallelicalterationsinthecancergenomeusingsinglenucleotidepolymorphismarrays.CancerResearch2004;64:3060-3071.
4.LuT,PanY,KaoSY,LiC,KohaneI,ChanJ,YanknerBA.GeneregulationandDNAdamageintheageinghumanbrain.Nature2004;429:883–891.
5.LeykinI,HaoK,ChengJ,MeyerN,PollakMR,SmithRJH,WongWH,RosenowC*,LiC*.Comparativelinkageanalysisandvisualizationofhigh-densityoligonucleotideSNParraydata.BMCGenetics2005;6:7.
6.GarrawayLA,WidlundHR,RubinMA,GetzG,BergerAJ,RamaswamyS,BeroukhimR,MilnerDA,GranterSR,DuJ,LeeC,WagnerSN,LiC,GolubTR,RimmDL,MeyersonML,FisherDE,SellersWR.IntegrativegenomicanalysesidentifyMITFasalineagesurvivaloncogeneamplifiedinmalignantmelanoma.Nature2005.436(7047):117-22.
7.BeroukhimR,LinM,ParkY,HaoK,ZhaoX,GarrawayLA,FoxEA,HochbergEP,MellinghoffIK,HoferMD,DescazeaudA,RubinMA,MeyersonM,WongWH,SellersWR*,LiC*.InferringLoss-of-HeterozygosityFromTumor-onlySamplesUsingHigh-DensityOligonucleotideSNPArrays.PLoSComputationalBiology.2006.2(5):e41.
8.JohnsonWE,LiC*,RabinovicA.AdjustingbatcheffectsinmicroarrayexpressiondatausingEmpiricalBayesmethods.Biostatistics.2007.8(1):118-127.
9.LiC*,BeroukhimR,WeirBA,WincklerW,GarrawayLA,SellersWR,MeyersonM.MajorcopyproportionanalysisoftumorsamplesusingSNParrays.BMCBioinformatics.2008.9:204.
10.LiC.AutomatingdChip:towardreproduciblesharingofmicroarraydataanalysis.BMCBioinformatics.2008.9:231.
11.LiC,KimSW,RaiD,BollaAR,AdhvaryuS,KinneyMC,RobetoryeRS,AguiarRC.Copynumberabnormalities,MYCactivityandthegeneticfingerprintofnormalB-cellsmechanisticallydefinethemicroRNAprofileofDLBCL.Blood.2009.Publishedonline.