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同济大学生命科学与技术学院研究生导师简介-赵倩

同济大学 免费考研网/2013-01-31


姓名:赵倩
学位:博士
导师情况:
研究领域:生物信息学,表观基因组学
研究方向:
1、开发BS-seq综合分析平台,关注不同细胞状态下的DNA甲基化变化,进而探讨不同细胞状态变化背后的表观遗传机制。
2、基于单碱基分辨率的DNA羟甲基化数据,研究其相关转录调控机制。
3、发展全新生物信息算法,发现和探讨印迹基因的表观遗传修饰特征。
E-mail:zhaoqian@tongji.edu.cn
联系电话:
通讯地址:上海市杨浦区四平路1239号同济大学生命科学与技术学院

个人简介:
2005年本科毕业于北京邮电大学,获学士学位;2010年毕业于中国科学院北京基因组研究所,获博士学位;2010年-2012年于同济大学生命科学与技术学院从事博士后研究工作。在博士和博士后期间一直从事高通量表观基因组学的数据库搭建、数据整合分析、方法学建立以及算法开发工作。目前致力于基于高通量生物学数据,发展生物信息算法,整合多维度数据,希望能够揭示在全能和多能干细胞中所发生的表观遗传调控机制。
作为负责人先后承担中国博士后基金和国家自然基金委青年项目。

代表性文章:
1.ZhaoQ,ZhangY.Epigenomesequencingcomesofageindevelopment,differentiationanddiseasesmechanismresearch.Epigenomics2011;3(2):207-20.
2.ZhaoQ,XiaoJ,YuJ.Anintegratedanalysisoflineage-specificsmallproteinsacrosseighteukaryotesrevealsfunctionalandevolutionarysignificance.PROGBIOCHEMBIOPHYS2012;39(4):359-67.
3.HeX*,ChangS*,ZhangJ*,ZhaoQ*.MethyCancer:thedatabaseofhumanDNAmethylationandcancer.NucleicAcidsRes2008;36(suppl1):D836-41(*co-firstauthor)
4.LiJ*,ZhaoQ*,LarsBolund.Computationalmethodsforepigeneticanalysis:theprotocolofcomputationalanalysisformodifiedmethylation-specificdigitalkaryotypingbasedonmassivelyparallelsequencing.MethodsMolBiol2011;791:313-28(*co-firstauthor)
5.WangC,TianR,ZhaoQ,XuH,MeyerCA,LiC,ZhangY,LiuXS.ComputationalinferenceofmRNAstabilityfromhistonemodificationandtranscriptomeProfiles.NucleicAcidsRes2012(advanceonline).
6.YangL,ZhangK,DaiW,HeX,ZhaoQ,WangJ,SunZ.Systematicevaluationofgenome-widemethylatedDNAenrichmentusingaCpGislandarray.BMCGenomics2011;12:1







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