第一章绪论（2学时）：共四节，主要介绍蛋白质组形成历史沿革、研究内容与技术路线、发展趋势。第二章蛋白质样品全息制备（4学时）：共四节，主要介绍蛋白质样品裂解液成分、细胞裂解与蛋白提取、纯化原理与方法、亚细胞蛋白提取。第三章双向凝胶电泳（4学时）：共六节。主要介绍双向凝胶电泳、凝胶中蛋白质检测、蛋白质印迹、图像采集与后续分析等。第四章电泳图谱的图像分析（4学时）：共四节，主要介绍双向电泳图谱分析技术要点、双向电泳蛋白质谱数据库构建。第五章生物质谱技术与蛋白质鉴定（6学时）：共二节，主要介绍生物质谱的基本原理，质谱技术在鉴定蛋白质中的应用。第六章蛋白质翻译后修饰的鉴定（4学时）：共四节，主要介绍磷酸化蛋白、糖蛋白质和泛素蛋白的鉴定技术等。第七章定量蛋白质组学（4学时）：共三节，主要介绍荧光双向差示凝胶电泳技术稳定同位素代谢标记技术、稳定同位素的体外标记法。第八章蛋白质-蛋白质互作（4学时）：共七节，主要介绍蛋白质-蛋白质相互作用的类型、蛋白质互作的分析原理、蛋白质免疫共沉淀、酵母双杂系统、噬菌体展示技术、蛋白质微阵列和芯片技术、串联亲和纯化技术）第九章蛋白质组学技术的应用（2学时）：共三节，主要介绍蛋白质组学技术在植物科学、动物科学、微生物学中的应用。第十章：生物信息学原理（2学时）：共四节，主要介绍生物信息学简介，主要相关网络和数据库、数据库搜索、质谱识别蛋白质方法。

第一周第一章 概论 重点掌握蛋白质组学的概念、特点和发展趋势第二周第二章 样品的全息制备 掌握不同组织、细胞材料样品破碎、蛋白质提取、裂解的原则和方法。第三周第三章 电泳技术掌握凝胶与非凝术、电泳图谱的图像分析方法。第四周第四章 生物质谱技术和蛋白质鉴定掌握各类生物质谱技术的基本原理和肽指纹技术、肽序列标签技术和串联质谱技术在鉴定蛋白中的应用第五周 定量蛋白质组学 掌握体内记和 体外标记方法第六周 第六章 蛋白质组研究中翻译后修饰分析 掌握磷酸化蛋白质、糖基化蛋白质鉴定方法第七周 第七章 蛋白质相互作用 掌握蛋白质免疫共沉淀、酵母双杂交、蛋白质芯片第八周 第八章 蛋白质生物信息学基础 掌握生物信息学的主要内容，数据库构建的基本原则和主要蛋白质数据的特点。第九周 考试

开卷考试或闭卷考试、讨论为主要考核形式。考核成绩有两部组成：考试成绩占80%，评时讨论成绩占20%。

• 1、钱小红、贺福初主编《蛋白质组学：理论与方法》，科学出版社， 2003 2、夏其昌、曾嵘等编著《蛋白质化学与蛋白质组学》，科学出版式社，2004 3、《蛋白质与蛋白质组学实验指南》{澳]R.J.辛普森著 科学出版社(影印本),2003 4、《蛋白质组学：从序列到功能》{英}S.R.Pennington M.J.Dunn(钱小红 贺福初译) 科学出版,2002 5、Peter James《Proteome Research: Mass Spectrometry》 Springer-Verlag Berlin Heidelberg ,2001