邓 子 新 教 授

一、学习及工作简历
1982年1月毕业于华中农业大学微生物专业 , 留校任教，1984年2月被选派到英国 John Innes 研究所，在英国 University of East Anglia 注册攻读博士学位1987年5月获博士学位，然后在英国John Innes研究所做博士后一年,于1988 年6月回国。1990年至1998年，每年赴英国John Innes中心从事三个月的合作研究。1988年任讲师,1991年12月任副教授，1992年8月任教授，1993年遴选为博士生指导教师。现任上海交通大学教授、博士生导师,Bio-X 生命科学研究中心副主任。2001-2003 年兼美国康乃尔大学客座教授。 现任科学通报特邀编辑、 Process Biochemistry、Journal of Biological Sciences、 Journal of Microbiology 等数个国际刊物编委会成员。

1991年被评为国家级有突出贡献的中青年专家; 被评为有突出贡献的留学回国人员；1992 年获霍英东基金会"青年教师奖"；1993年获首届中国青年科学家提名奖和国务院政府特殊津贴；1994 年获 首 届 “国家杰出青年科学基金”、"中国青年科技奖" 、农业部科技进步一等奖并入选国家教委跨世纪人才计划; 1996年入选人事部 "百千万人才工程" 第一、二层次; 2004年被评为教育部“****”特聘教授；

1991、1994 、1997 年三次获得美国洛氏基金会"生物技术生涯奖" ；1997年获"瑞典国王Baudiouin 奖"。2000年获美国康乃尔大学首届”Tang-Cornell中国学者奖”。
二、 主要研究领域和方向

主要从事放线菌遗传学及抗生素生物合成的生物化学和分子生物学研究。其研究领域涉及 微生物农 ( 医 ) 药的高新技术研究 , 链霉菌 质粒和噬菌体的分子生物学， DNA 复制调控、限制 和 修饰系统、微生物代谢途径、代谢工程及 次生代谢产物的生物化学、抗生素基因 簇的 克隆、定位 , 基因的结构、功能、表达和调控，非天然性抗生素药物创新的基因工程等。先后 共主持 30 余项国家级和国际合作项目 , 已 在国内外学术刊物上 发表100余篇研究论文。

三、主要论文

? Yu Y., L. Bai, K. Minagawa, X. Jian, L. Li, J. Li, S. Chen, E. Cao, T. Mahmud, H. G. Floss, X. Zhou, and Z. Deng (2005), A gene cluster encoding validamycin biosynthesis in Streptomyces hygroscopicus var. jinggangensis 5008, Applied and Environmental Microbiology, Accepted.

? D. Zhu, X. He, X. Zhou, and Z. Deng (2005): Expression of the melC operon in several Streptomyces strains is positively regulated by AdpA, an AraC family transcriptional regulator involved in morphological development in Streptomyces coelicolor, Journal of Bacteriology, In press.

? X Zhou, X He, A Li,T. Kieser and Z. Deng (2004). Streptomyces coelicolor A3(2) lacks a genomic island which is present in Streptomyces lividans 66， Applied and Environmental Microbiology, 70(12): 7110-7118.

? Li X, X. Zhou, and Z. Deng (2004): Isolation and characterization of Micromonospora phage ?HAU8 and development into a phasmid. Applied and Environmental Microbiology, 70(7): 3893-7.

? Qin L, Wang HA, Wu ZQ, Zhang XF, Jin ML, Deng ZX, Zhao GP (2004): Identification and Characterization of hmr19 Gene Encoding a Multidrug Resistance Efflux Protein from Streptomyces hygroscopicus subsp. yingchengensis Strain 10-22. Acta. Biochim. Biophys. Sin. 36(8):519-28.

? S. Chen, X. Huang, X. Zhou, L. Bai, J. He, K. J. Jeong, S. Y. Lee and Z. Deng (2003) : Organizational and mutational analysis of a complete FR-008/candicidin gene cluster encoding a structurally related polyene complex. Chemistry & Biology, 10: 1065-1076.

? Y. Sun, X. Zhou, H. Dong, G. Tu, M. Wang, B. Wang, and Deng Z (2003): A Complete Gene Cluster from Streptomyces nanchangensis NS3226 encoding biosynthesis of the polyether ionophore nanchangmycin. Chemistry & Biology, 10: 431-441.

? M. Tao, E. Takano, F. Long, Maureen J. Bibb, L. Wang, W. Li, M. J. Buttner, Mervyn J. Bibb, Z. Deng and K. F. Chater (2003): A rare leucine codon in adpA is implicated in the morphological defect of bldA mutants of Streptomyces coelicolor . Molecular Microbiology , 50(2): 475-486.

? Li X. X. Zhou, and Deng Z. (2003): Vector systems allowing efficient autonomous or integrative gene cloning in Micromonospora sp. 40027. Applied and Environmental Microbiology, 69 (6): 3144-3151.

? Y. Sun, X. Zhou, G. Tu , and Z. Deng (2003): Identification of a gene cluster encoding meilingmycin biosynthesis among multiple PKS contigs isolated from Streptomyces nanchangensis NS3226. Archives of Microbiology, 180: 101-107.

? Pang X, Zhou X, and Deng Z (2002): Physical Map of the Linear Chromosome of Streptomyces hygroscopicus 10-22 Deduced by the Analysis of Large Overlapping Chromosomal Deletions. Journal of Bacteriology , 184 (7): 1958-1965.

? Sun Y, Zhou X, Liu J, Bao K, Zhang G, Tu G, Kieser T, and Deng Z (2002): Streptomyces nanchangensis, a producer of the insecticidal polyether antibiotic nanchangmycin and the antiparasitic macrolide meilingmycin, contains multiple polyketide gene clusters. Microbiology (UK), 148:361-371.

? Pang X, Liu J, Zhou X, and Deng Z (2002): A linear plasmid temperature-sensitive for replication in Streptomyces hygroscopicus 10-22. FEMS Microbiology Letters, 208 (1): 25-28.

? Bao K, Hu Z, Zhou X, Zhou Q, Deng Z (1997): A bi-functional cosmid vector for the mobilized conjugal transfer of DNA from E. coli to Streptomyces sp. Progress in Natural Science , 7(5): 568-572.

? Qin Z ， Peng K ， Zhou X ， Liang R ， Zhou Q ， Chen H ， Hopwood D A ， Kieser T and Deng Z (1994): Development of a gene cloning system for Streptomyces hygroscopicus var yingchengensis ， a producer of three useful antifungal compounds ， by elimination of three barriers to DNA transfer. Journal of Bacteriology , 176(7) ： 2090-2095.

? Hu Z ， Bao K ， Zhou X ， Zhou Q ， Hopwood D A ， Kieser T and Deng Z (1994): Repetitive polyketide synthase modules involved in the biosynthesis of a heptaene macrolide of Streptomyces hygroscopicus FR-008. Molecular Microbiology , 14(1): 163-172.

? Zhou X ， Deng Z ， Hopwood D A and Kieser T (1994): Streptomyces lividans 66 ， contains a φHAU3-resistance gene which is similar to the phage λea59 endonuclease gene. Molecular Microbiology , 12(5): 785-797.

? Zhou X ， Deng Z ， Hopwood D A and Kieser T (1994): Characterization of φHAU3 ， a wide host-range temperate Streptomyces phage and development of phasmids. Journal of Bacteriology , 176(7): 2096-2099.

? Deng Z and Zhou X (1992): A Streptomyces plasmid pHZ65 and its development into cloning vectors. Science in China (Series B) ， 35(11):1315-1322.

? Deng Z ， Kieser T and Hopwood D A (1988): “Strong incompatibility ”between derivatives of the Streptomyces multi-copy plasmid pIJ101. Molecular and General Genetics ， 214: 286-294.

? Zhou X ， Deng Z ， Firmin J L ， Hopwood D A and Kieser T (1988): Site-specific degradation of Streptomyces lividans DNA during electrophoresis in buffers contaminated with ferrous iron. Nucleic Acids Research ， 16(10): 4341-4352.

? Deng Z ， Kieser T and Hopwood D A (1988): Co-integrate formation between Streptomyces plasmid simulated by a sequence of the multi-copy plasmid pIJ101. Heredity ， 61: 297.

? Kieser T ， Deng Z, and Hopwood D A (1988): Biology of the Streptomyces multi-copy plasmid ， pIJ101. Heredity ， 61: 277.

? Deng Z, Kieser T and Hopwood D A (1987): Activity of a Streptomyces transcriptional terminator in E. coli . Nucleic Acids Research ， 15 (6):1665-2775.

? Deng Z, Kieser T and Hopwood D A (1986): Expression of a Streptomyces plasmid promoter in E . coli . Gene , 43: 295-300.

四、近期主要研究课题

(1) 一种新的DNA硫化修饰系统 已知 DNA是由C,H,O,N,P五种元素所构成的, 我室 在作为生命中枢的DNA大分子上发现了某些微生物基因组中 硫(S)的存在, 而且分离出与 硫 修饰有关的完整基因簇。 这项发现为从遗传学、生化学和化学领域协作攻关并从根本上揭示DNA硫修饰的本质提供了新思路。DNA新结构的最终阐明将丰富分子生物学的基础理论， 打开一个新 的学科 领域, 也将为DNA损伤,甚至癌症治疗因子的作用机理提供理论基础。如同甲基化的修饰(以前已知的唯一DNA修饰)导致了一系列新的发现一样，DNA上硫化修饰的发现也可预期产生分子生物学领域新的 “ 信息 ” 流。目前，已拥有硫化修饰基因 (簇)和一系列突变株, 奠定了进行体外基因表达，研究酶学功能的条件, 也为最终从分子水平上阐明修饰的化学本质和生物学意义奠定了良好的基础。

(2) 重要微生物基因（簇）分离与克隆 基因资源是生命科学领域竞争白热化的一个焦点领域，也是未来重量级微生物新知识产权形成的基础。我室正加强对我国微生物基因（簇）资源，而不仅仅是菌种资源的重视。在已分离鉴定的许多重要微生物基因的基础上，在近年内将形成我国新知识产权的微生物基因（簇）包括：杀虫性大环内酯抗生素梅岭霉素基因簇和多醚类抗生素南昌霉素基因簇，抗病性氨基糖苷类抗生素井岗霉素基因簇，抗真菌多烯大环内酯类抗生素杀念菌素基因簇，具有重要价值的微生物酶类的基因将包括磷酯酶A2，胆固醇氧化酶，脂肪酶基因及其一系列杀虫抗病微生物农药产品的正、负调节（途径专一性或全局性）基因等。许多类别的基因将构成我国首创和独有的知识产权，预期会对农业、医药、卫生、环境等领域高新技术产业的形成与发展作出贡献。

(3) 微生物代谢工程与化学生物学 随着分子生物学的发展及其向微生物农、医药研究领域的渗透，微生物药物的生物合成正面临着又一次革命性的变化，即由基因工程发展到代谢工程的变化，也就是用基因工程手段来重新设计代谢系统。我室顺应这种变化，为近年内在此领域取得突破奠定了较好的物质和技术基础，获得了大量与生物合成相关的基因并阐明了一些重要基因的结构、功能及其表达、调控之机理，发展了一系列体内外的分子操作技术。已经分离的多烯、聚醚、氨基糖苷抗生素基因簇及其一系列与抗生素生物合成、代谢调控有关的因子的分离已经构成我国特有的知识产权，并用来提高现有一些药物的产量，它们的全序测定将使利用模块替换、基因改变、功能消除、功能获得等多种组合生物学手段设计和改造药物，形成一系列非天然性的天然化合物，在药物创新方面取得一系列突破成为可能。这种突破既可能是基础理论的突破，也具有潜在的应用前景，预期会对我国代谢工程的发展产生影响。

(4) 分子微生物学技术和方法学创新 众所周知，以微生物为研究对象的分子微生物学方法学的进展是当今生命科学突飞猛进，一日千里的原动力。我室多年来在此领域积极探索，通过对质粒、噬菌体、转座子、基因岛、跨属接合转移等基础微生物学的深入研究，衍生出一系列“通用型”或具有特殊用途的载体，有些研究材料已被收录入大型工具书(Practical Streptomyces Genetics)，供全世界使用。同时，还不断揭示出国际上通用的一些基因工程受体菌株的一些新属性，并构建出新一代受体菌株。我们将百倍努力，力争持续在此领域有所作所为。

五、 联系方式

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