梁晶丹 副研究员

电话：+86--2061
邮箱：jdliang@sjtu.edu.cn
地址：华山路1954号徐汇校区哲生馆206室
实验室网址：http://mml.sjtu.edu.cn/





学术经历
上海交通大学获博士学位；
2011年2月-2013年2月，加州大学伯克利分校细胞生物学系访学；
上海交通大学微生物系任教。


上海交通大学获博士学位；
2011年2月-2013年2月，加州大学伯克利分校细胞生物学系访学；
上海交通大学微生物系任教。





研究方向

细菌生理DNA硫修饰



硫修饰当前的科学难题及意义



研究方向






细菌DNA上发现的低丰度修饰。与化学合成的硫修饰结构一致。低丰度的修饰却完成非常复杂的生理功能，如限制-修饰，抗氧化功能等。


硫修饰DNA，常用于寡核苷酸药物。寡核苷酸药物的硫修饰是高丰度修饰。细菌生理DNA硫修饰是低丰度事件。细菌硫修饰如何利用低丰度的硫修饰，实现相应的生理功能，相关原理的阐明，可能为反义核酸药物设计提供新的线索。


1. DNA硫修饰酶学机制和抗氧化生理意义探究；
2. 天然重要药物合成机器的冷冻电镜单颗粒技术结构解析和生化机理研究。






研究方向


细菌生理DNA硫修饰 细菌DNA上发现的低丰度修饰。与化学合成的硫修饰结构一致。低丰度的修饰却完成非常复杂的生理功能，如限制-修饰，抗氧化功能等。




硫修饰当前的科学难题及意义 硫修饰DNA，常用于寡核苷酸药物。寡核苷酸药物的硫修饰是高丰度修饰。细菌生理DNA硫修饰是低丰度事件。细菌硫修饰如何利用低丰度的硫修饰，实现相应的生理功能，相关原理的阐明，可能为反义核酸药物设计提供新的线索。




研究方向 1. DNA硫修饰酶学机制和抗氧化生理意义探究；
2. 天然重要药物合成机器的冷冻电镜单颗粒技术结构解析和生化机理研究。











代表论著
? Pu T,Liang J#,Mei Z, Yang Y, Wang J, Zhang W, Liang W, Zhou X, Deng Z, Wang Z. Phosphorothioated DNA is shielded from oxidative damage.Applied and Environmental Microbiology. 2019 Apr 4;85(8):e00104-19. Selected as Spotlight. Co-first author

论文下载 支撑材料


? Pu T，Mei Z, Zhang W，Liang W, Zhou X, Liang J*，Deng Z*, Wang Z*. An in vitro DNA Phosphorothioate Modification Reaction. Molecular Microbiology. 2020 Feb;113(2):452-463. Co-corresponding author

论文下载 支撑材料


? Wu H,Liang J#,Gou L, Wu Q, Liang W, Zhou X, Bruce IJ, Deng Z, Wang Z. Recycling of Overactivated Acyls by a Type II Thioesterase during Calcimycin Biosynthesis in Streptomyces chartreusis NRRL 3882. Applied and Environmental Microbiology. 2018 May 31;84(12). e00587-18. Co-first author

论文下载 支撑材料


? Wu H,Liang J#, Wang J, Liang W, Gou L, Wu Q, Zhou X, Bruce IJ, Deng Z, Wang Z. Cezomycin Is Activated by CalC to Its Ester Form for Further Biosynthesis Steps in the Production of Calcimycin in Streptomyces chartreusis NRRL 3882. Applied and Environmental Microbiology. 2018 May 31;84(12). e00586-18. Co-first author

论文下载 支撑材料


? Yang Y, Xu G,Liang J#, He Y, Xiong L, Li H, Bartlett D, Deng Z, Wang Z, Xiao X. DNA Backbone Sulfur-Modification Expands Microbial Growth Range under Multiple Stresses by its anti-oxidation function.Scientific Reports. 2017 Jun 14;7(1):3516. Co-first author

论文下载 支撑材料



? Dai D, Du A, Xiong K, Pu T, Zhou X, Deng Z,Liang J*, He X*, Wang Z*. DNA Phosphorothioate Modification Plays a Role in Peroxides Resistance in Streptomyces lividans.Frontiers in Microbiology. 2016 Aug 31; 7:1380. Co-corresponding author

论文下载 支撑材料


? Xie X,Liang J#,Pu T, Xu F, Yao F, Yang Y, Zhao Y, You D, Zhou X, Deng Z, Wang Z. Phosphorothioate DNA as an antioxidant in bacteria.Nucleic Acids Research.2012 Oct; 40(18):9115-24. Co-first author

论文下载 支撑材料


? An X, Xiong W, Yang Y, Li F, Zhou X, Wang Z, Deng Z*,Liang J*.A novel target of IscS in Escherichia coli: participating in DNA phosphorothioation.PLoS One.2012; 7(12):e51265.Co-corresponding author

论文下载 支撑材料


? Liang J, Niu Q, Xu X, Luo Y, Zhou X, Deng Z, Wang Z. Effective elimination of nucleic acids from bacterial protein samples for optimized blue native polyacrylamide gel electrophoresis.Electrophoresis. 2009 Jul; 30(14):2454-9.

论文下载 支撑材料


? Liang J#,Wang Z#, He X, Li J, Zhou X，Deng Z. DNA modification by sulfur: analysis of the sequence recognition specificity surrounding the modification sites.Nucleic Acids Research. 2007 Apr; 35(9):2944-54.

论文下载 支撑材料













主持自然基金面上项目、上海市自然基金、浦江****项目、合成生物学项目，转基因专项。
参与自然基金重大培育项目、上海市自然基金重点项目。

承担项目