中国科学院上海药物研究所是我国历史最悠久、也是中国科学院唯一的综合性药物研究机构。全所现有中国科学院院士4人，中国工程院院士2人，均是我国药物化学、药理学等领域的著名专家。全所现有员工500多人，其中具有高级职称的研究人员约占30%。在学研究生400多人,其中三分之二以上攻读博士学位，在站博士后20余人。
　　上海药物所设有新药研究国家重点实验室、国家新药筛选中心两个国家级研究中心；此外还有6个研究室：天然药物化学研究室、合成药物化学研究室、分析化学研究室、药理第一研究室、药理第二研究室、药理学第三研究室；6个技术平台：药物发现与设计中心、药物安全性评价和研究中心、药物代谢中心、药物制剂研究中心、中药现代化研究中心、药效评价研究中心。另有图书情报室、实验动物室和植物标本室等支撑服务机构；主办两本英文学术杂志《AsianJournalofAndrology》和《ActaPharmacologicaSinica》，一本科普杂志《家庭用药》。
　　上海药物所拥有药学一级学科授予权。现有招生专业：药物化学、药理学、药物分析学、药剂学、药物设计学。2010年预计招收硕士学位研究生80名。