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当生物信息学遇上植物科研——计算生物学所李海鹏研究员访问辰山2016-05-26_上海生命科学研究院

上海生命科学研究院 免费考研网/2018-05-05

5月24日下午,计算生物学所李海鹏研究员应邀访问上海辰山植物园(中科院上海辰山植物科学研究中心),在科研中心会议室做了题为“新近发生的正选择?还是假阳性?”的学术报告,报告由观赏植物组组长田代科研究员主持。

  报告中,李海鹏系统介绍了如何利用科学的方法准确检测到近期发生的正选择,是将针对基因型的研究上升到针对表型研究的关键。他重点讲述了利用全基因组数据先估计群体进化历史然后再检测正选择的新方法,并与参会人员就相关问题进行了热烈讨论。据李海鹏介绍,这种新的方法提出从系统发育树角度检测正选择,第一次在数学上证明该检验方法不受群体历史的干扰,开创了新的基于系统发育树检测正选择的理论体系。提出新的颠覆性的高效算法估算遗传重组率,比使用最为普遍的LDhat快10万倍以上,但估值却和后者一样精确,从而避免检测正选择时的遗传重组率的干扰,已经成为一个在国际上被普遍采用的分析策略。

  本次讲座为辰山科研中心开展相关研究提供了新的思路和方法,为双方进一步开展合作研究创造了条件。(辰山中心)






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