机械自动化工程系下设四个本科专业：机械工程及自动化专业、工业工程专业、包装工程专业、工业设计专业。目前机械自动化工程系共含13个教研室/研究室：机自教研室、机制教研室、工业工程教研室、包装教研室、气动液压教研室、CAD／CAM教研室、机械原理及零件教研室、工业设计教研室，以及轴承研究室、润滑研究室、断裂研究室、齿轮研究室、光电及信息技术研究室；分别承担本科学生的各种专业基础课和专业课的教学任务。设有五个实验中心：即CIMS和机器人中心、机械电子工程实验中心、机械传动与测控实验中心、生产工程实验中心和包装和工业设计实验中心；其中CIMS和机器人中心在1997年9月被批准为上海市重点实验室，“先进制造及自动化技术”学科被列为“十五”期间“211工程”重点建设项目，以“机械电子工程”学科名义分别于2001年和2002年被批准为上海市重点学科和国家重点学科；主要承担本科生、研究生的实验、研究教学任务。拥有三个二级学科博士点：机械设计及理论、机械制造及其自动化、机械电子工程；三个二级学科硕士点：机械设计及理论、机械制造及自动化、机械电子工程（原流体传动与控制）。

　　现有教职工124人，其中正高职职称18人（博士生导师10人），副高职职称41人，获博士学位26人。

　　在读本科生1002人、硕士研究生132人、博士研究生63人。

　　按照学校“培养的学生首先是一个全面发展的人，其次才是专门家”的教学思想，根据机械学科毕业生以制造业为主要服务对象的目标，我系主要培养以机械、电子、自动控制、计算机应用、传感检测及信息处理等多门专业理论和技术为背景，能在机械工程及自动化领域从事设备制造、产品开发、应用研究、运行管理和经营销售方面工作的高级工程技术人才；大学期间主要打好学科基础，同时重视素质和能力的培养；在将来的工作实践中能运用创新思维方法，解决工程问题。

　　根据宽口径人才培养的需要，我系课程设置具有基础宽、实，知识面广的特点，新制订的教学计划，淡化学科内专业的界限，新的课程体系与内容中体现设计能力，综合能力的培养。

　　课程结构：公共基础课 + 学科基础课 + 专业主干与选修课 + 任选课 + 实践环节。

　　学科基础课平台：工程数学，工程力学，设计基础，电学基础,制造基础，测量与控制，计算机及应用七个模块；

　　专业课平台：设计与制造，传动与控制，机电一体、工程与管理四个专业主干课平台

　　实践环节主要包含两大部分：实习和设计，其中包括生产实习，课程设计和毕业设计。

　　机械自动化工程系教师科研项目较多，把科研成果溶入到教学内容中；组织学生参加各项科研工作。每届学生的毕业设计题目大多来自指导教师的科研课题，因而毕业设计新题率、结合工程率均达到90 % 。每年都有学生获市级优秀毕业论文奖、通讯杯机电一体化毕业设计大奖赛奖。

　　 我系还广泛组织学生参加各项课外活动和比赛。全国机器人灭火比赛、中央电视台主办机器人足球大赛上海市青少年科技节等，均有获奖。

　　 我系同样也实行选课制和学分制。一般情况下，四年累计修完310学分，即可毕业获得学士学位。对于学有余力，不到四年累计修完310学分的学生，可以提前毕业；极个别学有困难的学生，可以延长学习年限，但最多不得超过两年。