姓名: 张研 导师类别: 硕导
所在专业: 水产养殖 研究方向:
学院/单位: 水科院院部
专业所属学院: 水产与生命学院
专业技术职务: 副研究员 行政职务: 副研
性别: 女 E-Mail: zhangy@cafs.ac.cn
最高学位: 博士
通讯地址:
备注:
简历
教育经历
1998年9月~2002年6月
生物科学专业,获学士学位
东北林业大学
2002年9月~2005年6月
特种经济动物饲养专业,获硕士学位
东北林业大学
2005年9月~2008年6月
水产养殖专业,获博士学位
上海水产大学
工作经历
2008.7-2011.1
中国水产科学研究院
水产分子育种
工作
助理研究员
2011.1-至今
中国水产科学研究院
水产分子育种
工作
副研究员
研究成果
1. 农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目“水产主导品种分子育种技术引进” (2011-G12),子课题负责人。
该项目的主要内容是引进我国水产养殖动物开展分子育种和基因组选择育种研究中所缺少的一些关键技术和方法,并结合已开展的分子育种研究工作进行消化吸收,解决相关生物良种培育过程中遇到的实际问题,迅速建立完善的分子育种和基因组选择育种技术路线和方法,并将获得可培育成品种的镜鲤核心群体进一步培育成可推广的优良品种,建立了全国同行可共享的技术方案与技术资源平台。
2. 中央级科研院所基本科研业务费项目“鲤饲料转化率性状相关的功能基因和 SNP标记深度挖掘” (2010-C016),课题负责人
该项目的主要内容是挖掘饲料转化率相关功能基因和SNP标记。利用在畜牧中已鉴定出与饲料转化率相关的功能基因和利用鲤鱼已有的精细连锁图谱和BAC库进行图位克隆。分离和鉴定与该性状相关的功能基因和SNP标记,并将功能基因和SNP标记在养殖家系中进行进一步验证。
3. 中央级科研院所基本科研业务费项目“利用转座子元件进行鲤鱼分子地理生物学研究” (2012-C013),课题负责人
该项目主要内容是针对我国鲤鱼地理品系繁多,但不易鉴定为科学问题出发点,从鲤鱼基因组中对反转录转座子元件进行挖掘、鉴定和分析,整理出一套适用于水产动物的反转录转座子标记开发的体系,并研发出一套适用水产动物基因型分析的实验体系。
4. 中央级科研院所基本科研业务费项目“东欧和南亚地区鲤科鱼类种质资源收集鉴定和基因多态性评估” (2016GH02),课题负责人
该项目依托水科院和华大基因水产基因组联合研究中心的平台和技术优势,与南亚和东欧等“一带一路”国家水产科研机构合作,收集鲤科主养鱼类种质资源样本500余尾,开展鲤基因组优化和种质资源的系统鉴定评价,开发分子标记5万余个,丰富我国鲤科鱼类种质数据储备,在此基础上遴选优秀种质,开展有针对性地种质资源引进和育种应用,为我国和这些“一带一路”国家的鲤科鱼类遗传育种工作奠定基础。
5.主持淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室“鲤饲料转化率性状候选基因tgfb2 的克隆及验证” (KF-2017-01)。该项目以饲料转化率性状的候选基因tgfb2为研究对象,借助鲤全基因组及转录组数据库,参考斑马鱼等模式鱼类,对tgfb2进行定位克隆,在此基础上分析同池饲养镜鲤体重极端个体组间的表达差异,以验证tgfb基因表达差异与饲料转化率及体重等性状的相关性,并从中筛选与饲料转化率性状显著相关的微卫星及SNP标记,为饲料转化率性状标记辅助育种提供参考。
6. 国家高技术研究发展计划(863计划)“鲤鱼等功能基因组资源开发及其数据库与网站构建” (2011AA100401), 项目参与人
本课题主要研究内容为通过鲤鱼转录组的深度测序和生物信息学数据处理,全面挖掘鲤鱼功能基因组数据资源;依托鲤鱼转录组数据进行鲤鱼重要功能基因全长cDNA拼接与获取,并构建全长cDNA数据库;研究不同种群或品系鲤鱼的表达谱差异和基因组差异,获取重要性状相关差异基因和种群或品系特异性标记;研究鲤鱼鳞被、品质和生殖发育相关性状的功能基因及其调控机制;建立鲤鱼功能基因组数据库和交互式网站,为鱼类基因组研究领域提供数据存储和交流平台。
获奖情况
基于细菌人工染色体的鲤鱼基因组学研究(院科技进步二等奖,第四完成人,2014,2014-2-05-R4;
鲤鱼全基因组精细图绘制和遗传多样性分析(大渔奖,第八完成人,2014,2014-2-R08。
专利著作
一种评估鲤鱼种群遗传多样性的REMAP标记
2017.06.13
ZL9.1
论文发表
Ji, P., G. Liu, J. Xu, X. Wang, J. Li, Z. Zhao, X. Zhang, Y. Zhang, P. Xu and X. Sun (2012). "Characterization of Common Carp Transcriptome: Sequencing, De Novo Assembly, Annotation and Comparative Genomics." Plos One 7(4): e35152.
Laghari, M. Y., P. Lashari, X. Zhang, P. Xu, N. T. Narejo, Y. Liu, S. Mehboob, K. Al-Ghanim, Y. Zhang and X. Sun (2014). "Mapping QTLs for Swimming Ability Related Traits in Cyprinus carpio L." Marine Biotechnology 16(6): 629-637.
Laghari, M. Y., P. Lashari, X. Zhang, P. Xu, N. T. Narejo, B. Xin, Y. Zhang and X. Sun (2015). "QTL mapping for economically important traits of common carp (Cyprinus carpio L.)." Journal of Applied Genetics 56(1): 65.
Laghari, M. Y., P. Lashari, X. Zhang, P. Xu, B. Xin, Y. Zhang, N. T. Narejo and X. Sun (2014). "Mapping quantitative trait loci (QTL) for body weight, length and condition factor traits in backcross (BC1) family of Common carp (Cyprinus carpio L.)." Molecular Biology Reports 41(2): 721-731.
Laghari, M. Y., P. Lashari, Y. Zhang and X. Sun (2014). "Identification of Quantitative Trait Loci (QTLs) in Aquaculture Species." Reviews in Fisheries Science 22(3): 221-238.
Laghari, M. Y., Y. Zhang, P. Lashari, X. Zhang, P. Xu, B. Xin and X. Sun (2013). "Quantitative trait loci (QTL) associated with growth rate trait in common carp (Cyprinus carpio)." Aquaculture International 21(6): 1373-1379.
Lashari, P., M. Y. Laghari, P. Xu, Z. Zhao, L. Jiang, N. T. Narejo, Y. Deng, X. Sun and Y. Zhang (2015). "Complete mitochondrial genome of the Freshwater Catfish Rita rita (Siluriformes, Bagridae)." Mitochondrial Dna 26(6): 817.
Lashari, P., M. Y. Laghari, P. Xu, Z. Zhao, L. Jiang, N. T. Narejo, Y. Deng, X. Sun and Y. Zhang (2016). "Complete mitochondrial genome of catfish Bagarius bagarius (Hamilton, Sisoridae; Siluriformes) from Indus River Sindh, Pakistan." Mitochondrial Dna Part A Dna Mapping Sequencing & Analysis 27(1): 439.
Lashari, P., M. Y. Laghari, P. Xu, Z. Zhao, L. Jiang, N. T. Narejo, Y. Deng, X. Sun and Y. Zhang (2016). "Complete mitochondrial genome of catfish Sperata seenghala (Sykes, 1839) (Siluriformes, Bagridae) from Indus River Sindh, Pakistan." Mitochondrial Dna Part A Dna Mapping Sequencing & Analysis 27(1): 387.
Lashari, P., M. Y. Laghari, P. Xu, Z. X. Zhao, L. Jiang, X. W. Sun and Y. Zhang (2014). "Complete mitochondrial genome of burbot (Lota lota: family Gadidae) from Amur basin lineage, Northeastern China." Mitochondrial Dna A Dna Mappseq Anal(1): 140-141.
Lashari, P., M. Y. Laghari, Y. Zhang and X. Sun (2015). "Current Research on Quantitative Trait Loci (QTL) in Meat Quality."
Li, Y., P. Xu, Z. Zhao, J. Wang, Y. Zhang and X. W. Sun (2011). "Erratum to: Construction and Characterization of the BAC Library for Common Carp Cyprinus Carpio L. And Establishment of Microsynteny with Zebrafish Danio Rerio." Marine Biotechnology 13(6): 1183-1183.
Lu, C., M. Y. Laghari, X. Zheng, D. Cao, X. Zhang, Y. Kuang, C. Li, L. Cheng, S. Mahboob and K. A. Al-Ghanim (2016). "Mapping quantitative trait loci and identifying candidate genes affecting feed conversion ratio based onto two linkage maps in common carp ( Cyprinus carpio L)." Aquaculture.
MY, L., L. P, X. P, Z. Z, J. L, N. NT, X. B, S. X and Z. Y (2014). "Complete mitochondrial genome of freshwater shark Wallago attu (Bloch & Schneider) from Indus River Sindh, Pakistan." Mitochondrial Dna A Dna Mapp Seq Anal 27(1): 518-519.
P, X., Z. X, W. X, L. J, L. G, K. Y, X. J, Z. X, R. L and W. G (2014). "Genome sequence and genetic diversity of the common carp, Cyprinus carpio." Nature Genetics 46(11): 1212.
Peng, W., J. Xu, Y. Zhang, J. Feng, C. Dong, L. Jiang, J. Feng, B. Chen, Y. Gong and L. Chen (2016). "An ultra-high density linkage map and QTL mapping for sex and growth-related traits of common carp (Cyprinus carpio)." Scientific Reports 6: 26693.
Punhal, L., M. Y. Laghari, N. T. Narejo, X. F. Zhang, P. Xu, X. W. Sun and Y. Zhang (2014). "QTL for short-duration vigorous swimming movements in common carp (Cyprinus carpio L.) based on LDH activity." Pakistan Journal of Zoology 46(2): 383-390.
Wan, Y., Y. Zhang, P. Ji, Y. Li, P. Xu and X. Sun (2012). "Molecular characterization of CART, AgRP, and MC4R genes and their expression with fasting and re-feeding in common carp (Cyprinus carpio)." Molecular Biology Reports 39(3): 2215-2223.
Wang, J., R. Cui, Y. Li, J. Li, P. Xu, J. Wang, Y. Zhang, Z. Zhao and X. Sun (2011). "Genomic insight into the common carp (Cyprinus carpio) genome by sequencing analysis of BAC-end sequences." Bmc Genomics 12(1): 1-7.
Xu, J., P. Ji, Z. Zhao, Y. Zhang, J. Feng, J. Wang, J. Li, X. Zhang, L. Zhao and G. Liu (2012). "Genome-Wide SNP Discovery from Transcriptome of Four Common Carp Strains." Plos One 7(10): e48140.
Xu, J., J. T. Li, Y. Jiang, W. Peng, Z. Yao, B. Chen, L. Jiang, J. Feng, P. Ji and G. Liu (2017). "Genomic Basis of Adaptive Evolution: The Survival of Amur Ide (Leuciscus waleckii) in an Extremely Alkaline Environment." Molecular Biology & Evolution 34(1): 145.
Xu, J., Z. Zhao, X. Zhang, X. Zheng, J. Li, Y. Jiang, Y. Kuang, Y. Zhang, J. Feng and C. Li (2014). "Development and evaluation of the first high-throughput SNP array for common carp (Cyprinus carpio)." Bmc Genomics 15(1): 307.
Xu, P., J. Wang, R. Cui, Y. Li, Z. Zhao, P. Ji, Y. Zhang, J. Li and X. Sun (2011). "Generation of the first BAC-based physical map of the common carp genome." Bmc Genomics 12(1): 537.
Zhang, X., Y. Zhang, X. Zheng, Y. Kuang, Z. Zhao, L. Zhao, C. Li, L. Jiang, D. Cao and C. Lu (2013). "A consensus linkage map provides insights on genome character and evolution in common carp (Cyprinus carpio L.)." Marine Biotechnology 15(3): 275.
Zhang, Y., S. Wang, J. Li, X. Zhang, L. Jiang, P. Xu, C. Lu, Y. Wan and X. Sun (2013). "Primary genome scan for complex body shape-related traits in the common carp Cyprinus carpio." Journal of Fish Biology 82(1): 125.
Zhang, Y., P. Xu, C. Lu, Y. Kuang, X. Zhang, D. Cao, C. Li, Y. Chang, N. Hou and H. Li (2011). "Genetic linkage mapping and analysis of muscle fiber-related QTLs in common carp (Cyprinus carpio L.)." Marine Biotechnology 13(3): 376.
Zhao, L., Y. Zhang, P. Ji, X. Zhang, Z. Zhao, G. Hou, L. Huo, G. Liu, C. Li and P. Xu (2013). "A Dense Genetic Linkage Map for Common Carp and Its Integration with a BAC-Based Physical Map." Plos One 8(5): e63928.
Zhu, Y. P., W. Xue, J. T. Wang, Y. M. Wan, S. L. Wang, P. Xu, Y. Zhang, J. T. Li and X. W. Sun (2012). "Identification of common carp ( Cyprinus carpio ) microRNAs and microRNA-related SNPs." Bmc Genomics 13(1): 413.
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