吴语研究室成立于1981年，以吴语为主要研究对象。十多年来取得了丰硕的成果，研究水平处于国内前列。其中上海市区方言志获得1999年国家社会科学三等奖，并曾多次获省部级奖励。与日本京都外国语大学合作编纂的汉语方言大词典是中国第一部大型综合性方言词典。全国高等学校首届人文社会科学研究成果奖（1996－2000）一等奖（2003年）。所编上海方言词典、宁波方言词典、温州方言词典各为现代汉语方言大词典之一种。现代汉语方言大词典曾获新闻出版署颁布的国家图书奖辞书类一等奖（1999年）。游汝杰所著汉语方言学导论是第一本从语言学理论角度通论汉语方言的著作。游汝杰教授与周振鹤合著的方言与中国文化则是继罗常培先生语言与文化之后的又一力作，在国内外有广泛的影响。
最近的集体研究成果有吴语声调的实验研究。
近期的研究项目有：西洋传教士的汉语方言学著作与十九世纪汉语方言研究 、中国地方戏曲音韵研究、吴语语料库、吴语音韵比较等。

吴语室历年积累的调查各地吴语的材料有一百多种。 此外还收藏大量西洋传教士的吴方言研究著作的复印件。
吴语研究室的历任研究人员有：许宝华教授（已退休）、游汝杰教授（现任研究室主任）、陶寰副教授、张洪明（已出国）、陈忠敏（已出国）等。
在学博士生和硕士生每年近十人。