药学院创建于1936年，是全国医药院校中最具影响的药学院之一。学院设本科专业1个、硕士点6个、博士点5个。药学学科具有一级学科博士学位授予权、系上海市重中之重建设学科、复旦大学‘985’重点学科。药物化学学科为上海市重点建设学科。学院设有药学研究所、《中国临床药学》杂志社等机构。

　　学院有教授、研究员26人（博士生导师12人）、副教授、副研究员33人（硕士生导师36人）。

　　治学严谨、基础扎实、动手能力强是该学院的教学特色。学院共培养本科毕业生近5000名、硕士和博士研究生近300名，其中五位已成为中国科学院、中国工程院院士。