丁琛教学副院长


复旦大学人类表型组研究院教学副院长
教授，博士生导师

Email:chend@fudan.edu.cn


工作经历
2008年毕业于中国科学技术大学，细胞生物学博士。毕业后赴美国贝勒医学院从事生物质谱和蛋白质组学博士后研究工作。2012年全职回国在北京蛋白质组研究中心任副研究员、研究员。北京市第九批“海聚工程”，2014年入选“北京市优秀青年人才”。2015年起受聘为复旦大学生命科学学院研究员。


研究方向
发展蛋白质组学新技术新方法；基于质谱/蛋白质组学技术的转录调控研究；蛋白质组各高维度关系解析（配体-受体、酶-底物等）。在大规模、低丰度、高维度蛋白质组学技术开发与应用方面具备特色，建立了国际上最高效的蛋白质组深度覆盖平台和首个蛋白质组数据综合分析云平台；发明了细胞内源性转录因子大规模鉴定、活性定量方法和单一转录因子转录调控复合物质谱研究模式。近5年以第一作者或通讯作者在Nature Biotechnology、Molecular Cell、Journal of Experimental Medicine、Nature Communications、PNAS、Molecular & Cellular Proteomics、Analytical Chemistry等高水平杂志发表论文11篇。作为项目负责人主持科技部国际合作项目1项、863子课题1项、国家自然科学基金1项、北京市自然科学基金面上项目1项、北京市留学人员择优资助重点项目1项。获得中国专利3项、美国专利1项。


获奖情况
2013年北京市第九批“海聚工程”
2014年北京市第七批“优秀青年人才”


代表论文
1. Feng J#,Ding C#, *, Qiu N#, Ni X#, Zhan D#, Liu W, Xia X, Li P, Lu B, Zhao Q, Nie P, Song L, Zhou Q, Lai M, Guo G, Zhu W, Ren J, Shi T*, Qin J*. Firmiana: Towards a One-stop Proteomic Cloud Platform for Data Processiong and Analysis. DOI: 10.1038/nbt.3825,Nature Biotechnology, 2017. (#Co-first author, *Co-corresponding author)
2. Zhou Q, Liu M, Xia X, Gong T, Feng J, Liu W, Liu Y, Zhen B, Wang Y,Ding C*, Qin J*. A Mouse Tissue Transcription Factor Atlas. DOI: 10.1038/ncomms15089,Nature Communications, 2017. (*Co-corresponding author)
3. Lang X, Tang T, Jin T,Ding C*, Zhou R*, Jiang W*. TRIM65 Catalyzed Ubiquitination is Essential for MDA5-mediated Antiviral Innate Immunity.Journal of Experimental Medicine. 2017.2.1, 214(2): 459~473. (*Co-corresponding author)
4. Shi W, Li K, Song L, Liu M, Wang Y, Liu W, Xia X, Qin Z, Zhen B, Wang Y, He F, Qin J,Ding C. TFRE on Tip (TOT): A sensitive approach for large-scale endogenous transcription factor quantitative identification.Analytical Chemistry. 2016.12.20, 88(24): 11990~11994.
5. Liu M, Ge R, Liu W, Liu Q, Xia X, Lai M, Liang L, Li C, Song L, Zhen B, Qin J,Ding C. Differential proteomics profiling identifies lipid droplet proteins and biological functions in high fat diet induced fatty livers.J Lipid Res. 2017 Feb 8. pii: jlr.M071407. doi: 10.1194/jlr.M071407. [Epub ahead of print]