王文宁(WenningWang)博士，复旦大学化学系教授，复旦大学生物医学研究院兼职PI。1990年于复旦大学化学系获学士学位。1996年于复旦大学化学系物理化学专业获理学博士学位。1995年12月-1996年3月于日本分子科学研究所从事博士后研究。2002年2月-2003年8月于香港科技大学生物化学系任访问学者。

研究领域：结构生物学及计算生物学，主要包括神经系统信号传导和细胞极性的分子及结构基础，膜蛋白的构像变化动力学及生物功能等。

蛋白质是生物体中各种生理功能的主要执行者，了解蛋白质在各种生理过程中如何发挥其功能不但有助于我们理解生命活动的本质，也是疾病治疗和药物设计的前提。蛋白质的物理化学性质，特别是其三维结构和构像动力学，是我们理解其功能的关键。我们实验室运用多种技术手段研究蛋白质的结构、动力学与功能的关系。我们结合X-射线晶体衍射和多维核磁共振技术解析蛋白质三维高分辩结构，结合核磁共振和分子动力学模拟方法研究蛋白质的动力学性质，运用生物化学和细胞生物学手段进行蛋白质生物功能的验证，针对疾病治疗靶标蛋白结合核磁共振和计算机生物学方法筛选药物先导化合物。具体的研究方向包括：
（1）细胞非对称分裂调控机制的研究。细胞非对称分裂是干细胞分化的一种重要分裂形式，生物体内细胞的对称和非对称分裂受到精确的调控。非对称分裂的失调会导致发育缺陷或肿瘤。我们运用生物化学和结构生物学手段研究这一调控过程中一系列相关蛋白的相互作用，通过解析蛋白质复合物的三维结构，结合生物化学表征和细胞生物学实验了解调控机理。
（2）神经系统信号传导通路相关蛋白的研究。主要研究NMDA受体和Netrin受体下游信号通路相关蛋白的结构与功能关系。针对治疗神经退行性疾病的治疗靶标蛋白，解析其三维结构，筛选药物先导化合物。
（3）膜相关蛋白构像变化的动力学和调控。蛋白质是一种软物质，在生理环境下，蛋白质的三维结构具有柔性。蛋白质在执行其生理功能时往往在溶液中发生构像改变，因此了解蛋白质本身的动力学柔性是理解其功能的另一个关键因素。我们实验室关注两类膜相关蛋白的构像动力学研究。一类是与多重抗药性密切相关的转运体蛋白，另一类是介导细胞内囊泡疏运和膜融合的SNARE蛋白。


近期论文：
1.PanZ.,ShangY.,JiaM.,ZhangL.,XiaC.,ZhangM.,WangW.*,WenW.*(2013)“StructuralandbiochemicalcharacterizationoftheinteractionbetweenLGNandFrmpd1”,J.Mol.Biol.,doi:10.1016/j.jmb.2013.01.003.
2.LiuX.,LiF.,PanZ.,WangW.*,WenW.*(2012)“SolutionStructureoftheSH3domainofDOCK180“,Proteins,DOI10.1002/prot.24236.
3.JiaM.,LiJ.,ZhuJ.,WenW.,ZhangM.*,WangW*(2012)“CrystalStructuresofthescaffoldingproteinLGNrevealthegeneralmechanismbywhichGoLocobindingmotifsinhibitthereleaseofGDPfromGaisubunitsinG-coupledheterotrimericproteins“,J.Biol.Chem.,287:36766-36776.
4.WangB.,WengJ.,FanK.,WangW.*(2012)“InterdomainFlexibilityandpH-InducedConformationalChangesofAcrARevealedbyMolecularDynamicsSimulations“,J.Phys.Chem.B,116,3411-3420.
5.WengJ.,FanK.,WangW.*(2012)“TheConformationalTransitionPathwaysofATP-bindingCassetteTransporterBtuCDRevealedbyTargetedMolecularDynamicsSimulation”,PLOSOne,71(1):e30465.
6.DaiG.,LiZ.,LuJ.,WangW.*,FanK.*(2012)“TheDeepOxidationsintheOxidativeDehydrogenationReactionofPropaneoverV2O5(001):APeriodicDensityFunctionalTheoryStudy”,J.Phys.Chem.C,116,807-817.
7.ZhuJ.,ShangY.,XiaC.,WangW,WenW.,ZhangM.(2011)“GuanylateKinaseDomainsoftheMAGUKFamilyScaffoldProteinsasSpecificPhospho-ProteinBindingModules”,EMBOJ.,30,4986-4997.
8.ZhuJ.,WenW.,ZhengZ.,ShangY.,WeiZ.,XiaoZ.,PanZ.,DuQ.*,WangW.*,ZhangM.*(2011)“LGN/mInscandLGN/NuMAcomplexesstructuressuggestdistinctfunctionsinasymmetriccelldivisionforthePar3/mInsc/LGNandGai/LGN/NuMApathways”,Mol.Cell,43,418-431.
9.WangB.,WengJ.,FanK.,WangW.*(2011)“ElasticNetworkModel-basedNormalModeAnalysisRevealstheConformationalCouplingsintheTripartiteAcrAB-TolCMultidrugEffluxComplex”Proteins:Structure,FunctionandBioinformatics,70,2936-2945.
10.XiaoF.,WengJ.,FanK.,WangW.*(2011)“DetailedRegulatoryMechanismoftheInteractionbetweenZO-1PDZ2andConnexin43RevealedbyMDSimulations”PLOSOne,6(6):e21527.
11.XiaoF.,WengJ.,FanK.,WangW.*(2010)“MechanismofSer88PhosphorylationInducedDimerDissociationinDyneinLightChainLC8”J.Phys.Chem.B,114,15663-15672.
12.Ma,W.,Shang,Y.,Wei,Z.,Wen,W.,Wang,W.*,Zhang,M.*(2010)“PhosphorylationofDCCbyERK2isFacilitatedbyDirectDockingoftheReceptorP1DomaintotheKinase”Structure,18,1502-1511.
13.Guo,Q.1,Weng,J.1,Xu,X.,Wang,M.,Wang,X.,Ye,X.,Wang,W.*,Wang,M.*(2010)“AmutationalanalysisandmoleculardynamicssimulationofquinoloneresistanceproteinsQnrA1andQnrCfromProteusmirabilis”BMCStruct.Biol.10:33.
14.Weng,J.,Fan,K.andWang,W.*(2010)“TheconformationaltransitionpathwayofATPbindingcassettetransporterMsbArevealedbyatomisticsimulations”J.Biol.Chem.285,3053-3063.
15.WenW.,YuJ.,PanL.,WeiZ.,WengJ.,WangW.,OngY.S.,TranT.H.T.,HongW.,ZhangM.*(2010)“Lipid-InducedConformationalSwitchControlsFusionActivityofLonginDomainSNAREYkt6”Mol.Cell37,383-395.
16.Wang,W.*,Weng,J.,Zhang,X.,Liu,M.andZhang,M.*(2009)“Creatingconformationalentropybyincreasinginter-domainmobilityinligandbindingregulation:arevisittoN-terminaltandemPDZdomainsofPSD-95“,J.Am.Chem.Soc.131,787-796.
17.Weng,J.,Ma,J.Fan,K.,andWang,W.*(2009)“AsymmetricconformationalflexibilityintheATP-BindingCassettetransporterHI1470/1“Biophys.J.96,1918-1930.
18.Weng,J.,Ma,J.,Fan,K.andWang,W.*(2008)“TheConformationalCouplingandTranslocationMechanismofVitaminB12ATP-bindingCassette(ABC)TransporterBtuCD“,Biophys.J.,94,612-621.
19.DaiG.,LiuZ.,WangW.*,FanK.*(2008)“OxydativeDehydrogenationofEthaneoverV2O5(001):APeriodicDensityFunctionalTheoryStudy”,J.Phys.Chem.C,112,3719.
20.Fu,H.,Liu,Z.,Li,Z.,Wang,W.*andFanK.*(2006)“PeriodicdensityfunctionaltheorystudyofpropaneoxidativedehydrogenationoverV2O5(001)surface“,J.Am.Chem.Soc.128,11114-11123.

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