张思宇
生态与环境科学学院??????


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研究方向
开授课程
科研项目
学术成果
荣誉及奖励







个人资料
部门： 生态与环境科学学院
毕业院校： 中科学生态环境研究中心
学位： 理学博士
学历： 博士研究生
邮编： 200241
联系电话：
传真：
电子邮箱： syzhang@des.ecnu.edu.cn
办公地址： 闵行校区资环楼112
通讯地址： 上海市闵行区东川路500号

教育经历

2010.09 – 2015.07 中国科学院生态环境研究中心, 环境科学, 理学博士, 导师:朱永官院士
2006.09 – 2010.07 南京农业大学，农业资源与环境，农学学士


工作经历

2020.11 – 至今 华东师范大学，生态与环境科学学院，青年研究员（紫江青年）
2017.08 – 2020.10 佐治亚理工学院（Georgia Tech），博士后
2015.07 – 2017.07 北京师范大学，博士后


个人简介

社会兼职

Environmental Microbiology, Applied Microbiology and Biotechnology 等期刊审稿人



研究方向

研究领域：微生物生态学、环境微生物学、生物信息学
研究兴趣：基于微生物生态、环境微生物和生物信息学的交叉学科，主要关注：
1. 人类活动对湿地环境中微生物群落结构的影响：以湿地环境为研究对象，应用宏基因组学、宏转录组学等手段，研究城市化进程中，环境微生物群落结构和生态系统功能（如，生物地球化学循环和提升人群健康等方面）的变化。
2. 环境胁迫对功能微生物群落结构的影响：以砷污染水稻土为例，研究砷胁迫条件下，水稻土中砷代谢微生物群落结构及功能的变化，微生物介导的砷的生物地球化学循环过程，及其与其他元素耦合过程的微生物生态学机制。
3. 开发生物信息学工具，用于检测高通量测序数据中抗性基因及其他功能基因片段。



开授课程


科研项目

主持的科研项目：
1.博士后科学基金面上资助一等资助（2015M580062）：水稻土中微生物砷甲基化过程及其环境影响因子研究（2015.11-2017.07），项目负责人
2.华东师范大学紫江青年****启动项目（2020.11-2027.01），项目负责人
参与的科研项目：
1.Grant from the National Science Foundation (NSF：Award Number DEB **) to study how complex microbial systems use their genetic diversity to respond to human-induced change. PI: Kostas T. Konstantinidis, Co-PI: Eberhardt Coit and Jim Spain.主要承担应用宏基因组技术研究人类活动对印度恒河中微生物群落多样性的影响。
2.国家自然科学基金重点项目（No.**)：水稻土中砷形态转化的生物学机理与调控措施。主要承担水稻土中微生物砷代谢基因多样性的研究。
3.国家自然科学基金面上项目（No.**)：水稻土中藻对砷的甲基化作用于分子机制。主要承担藻类对砷的代谢机制研究。
4.国家自然科学基金面上项目（No.**）：固定化基因工程菌强化挥发修复砷污染土壤及其机制。参与固定化基因工程菌对砷的代谢研究。
5.美国国家地理资助项目（GEFC10-12)：A survey of rare earth elements distribution in the origin areas of Gan River and Pearl River。



学术成果

学术成果发表在Environmental Microbiology, Environmental Science & Technology, Nature Microbiology, Proceedings of the National Academy of Sciences, Scientific Reports, Environmental Pollution,Applied Microbiology and Biotechnology, Chemosphere等期刊，其中：
第一作者及通讯：
1.Si-Yu Zhang, Despina Tsementzi, Janet K. Hatt,Aaron Bivins, Nikunj Khelurkar, Joe Brown, Sachchida Nand Tripathi, Konstantinos T. Konstantinidis. Intensive allochthonous inputs along the Ganges River and their effect on microbial community composition and dynamics. Environmental Microbiology. 2019. 21 (1): 182-196. (Top downloaded paper 2018-2019 in Environmental Microbiology)
2.Si-Yu Zhang, Jian-Qiang Su, Guo-Xin Sun, Yunfeng Yang, Yi Zhao, Junjun Ding, Yong-Shan Chen, Yu Shen, Guibing Zhu, Christopher Rensing, Yong-Guan Zhu. Land scale biogeography of arsenic biotransformation genes in estuarine wetland. Environmental Microbiology. 2017. 19 (6): 2468-2482.
3.Si-Yu Zhang, Paul N. Williams, Jinming Luo, Y.-G. Zhu. Microbial mediated arsenic biotransformation in wetlands. Frontiers of Environmental Science & Engineering. 2017. 722 (25): 555-563.
4.Si-Yu Zhang, Fang-Jie Zhao, Guoxin Sun, Jianqiang Su, Xiaoru Wang, Hu Li, Yong-guan Zhu. Diversity and abundance of arsenic biotransformation genes in Chinese paddy soils.Environmental Science & Technology. 2015. 49 (7): 4138-4146.
5.Siyu Zhang,Dan Wang, Yihua Wang, Henrik Hasman, Frank M. Aarestrup, Hend A. Alwathnani, Yong-Guan Zhu, Christoper Rensing. Genome sequences of copper resistant and sensitive Enterococcus faecalisstrain isolated from copper-fed pigs in Denmark. Standards in Genomic Sciences. 2015. 10 (35): 1-10.
6.Siyu Zhang,Christopher Rensing, Yong-guan Zhu. Cyanobacteria–mediated arsenic redox dynamics is regulated by phosphate in aquatic environment. Environmental Science & Technology. 2014. 48 (2): 994-1000.
7.Si-Yu Zhang, Guoxin Sun, Xixiang Yin, Christopher Rensing, Yong-guan Zhu. Biomethylation and volatilization of arsenic by the marine microalgae Ostreococcus tauri.Chemosphere. 2013. 93 (1): 47-53.
共同作者：
8.Song-Can Chen, Guo-Xin Sun, Yu Yan, Konstantinos T Konstantinidis, Si-Yu Zhang, Ye Deng, Xiao-Min Li, Hui-Ling Cui, Florin Musat, Denny Popp, Barry P Rosen, Yong-Guan Zhu. The Great Oxidation Event expanded the genetic repertoire of arsenic metabolism and cycling. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2020. 117 (19): 10414–10421.
9.Haiqing Chang, Baicang Liu, Huizhong Wang, Si-Yu Zhang, Sheng Chen, Alberto Tiraferri, Yue-Qin Tang. Evaluating the performance of gravity-driven membrane filtration as desalination pretreatment of shale gas flowback and produced water. Journal of Membrane Science. 2019. 587.
10.Yong-Guan Zhu, Yi Zhao, Bing Li, Chu-Long Huang, Si-Yu Zhang, Shen Yu, Yong-Shan Chen, Tong Zhang, Michael R Gillings, Jian-Qiang Su. Continental-scale pollution of estuarines with antibiotic resistance genes. Nature Microbiology.2017. 2: 1-7.(高被引论文)
11.Song-Can Chen, Guo-Xin Sun, Barry P Rosen, Si-Yu Zhang, Ye Deng, Bo-Kai Zhu, Christopher Rensing, Yong-Guan Zhu. Recurrent horizontal transfer of arsenite methyltransferase genes facilitated adaptation of life to arsenic. Scientific Reports. 2017. 7(1).
12.Ke-Qing Xiao, Li-Guan Li, Li-Ping Ma, Si-Yu Zhang, Peng Bao, Tong Zhang, Yong-Guan Zhu. Metagenomic analysis revealed highly diverse microbial arsenic metabolism genes in paddy soils with low-arsenic content. Environmental Pollution. 2016. 211: 1-8.
13.Xiuli Hao, Freya L. Lu?thje, Yanan Qin, Sylvia Franke McDevitt, Nataliya Lutay, Jon Hobman, Karishma Asiani, Fernando C. Soncini, Nadezhda German, Si-Yu Zhang, Yong-Guan Zhu and Christopher Rensing. Survival in amoeba-a major selection pressure on the presence of bacterial copper and zinc resistance determinants? Identification of a ‘copper pathogenicity island’. Applied Microbiology and Biotechnology. 2015. 99 (14): 5817 – 5824.
14.Ke-Qing Xiao, Li-Hong Wang, Ren Bai, Si-Yu Zhang, Xi-Xiang Yin. Arsenic biotransformation in Cyanobacterium Synechocystissp.PCC 6803 under different phosphate regimes. Fresenius Environmental Bulletin. 2012. 21(9): 2551-2557.



荣誉及奖励

2015 北京市“优秀毕业生”，中国科学院大学“优秀毕业生”



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