本学科是国家首批获得软件工程一级学科硕士学位授予权单位（学制2.5年）。本学科按照一级学科设置培养方案，学生选修课程和研究方向不受专业限制，采用导师负责制完成培养过程。本学科紧贴国家和上海市战略发展需要，主要研究方向集中在：1.数据库与信息系统 （1）数据库：数据库理论、数据库管理系统实现、数据库安全等； （2）信息系统：信息系统、企业ERP、知识管理、决策支持系统，面向电子政务、电子商务、交通、制造业等领域系统应用开发等； （3）Web计算：语义Web、社区网络、Web应用开发等；  2.软件设计理论 （1）软件体系结构：SOA架构、软件构件、中间件、代理技术、人机交互等； （2）软件工具与环境：程序语言与系统、Case工具、UML技术等； （3）软件开发方法：面向对象开发、敏捷开发等； （4）信息安全：密码理论与技术、信息安全技术、信息对抗技术等；  3.软件项目管理 （1）软件项目管理：需求分析、项目管理、软件维护、软件标准等； （2）软件测试与分析：软件测试、软件质量、可信软件等；  4.软件系统开发 （1）软件开发技术：J2EE、.Net、XML技术、流媒体等； （2）图像处理与模式识别：图像处理、音频处理、视频处理、多源数据融合等； （3）嵌入式系统软件：嵌入式操作系统、移动应用开发等； （4）计算机辅助设计：纺织服装CAD、计算机模拟和仿真、虚拟现实等； （5）智能信息处理：数据分析、数据挖掘、认知计算等。