近日，我校生命科学与技术学院生物信息学中心林昊副教授课题组在计算分子生物学权威期刊、牛津大学出版社出版的《Nucleic Acids Research》和《Bioinformatics》上连续发表研究论文。



　　发表于《Nucleic Acids Research》的论文题目为“iPro54-PseKNC: a sequence-based predictor for identifying sigma-54 promoters in prokaryote with pseudo k-tuple nucleotide composition”（iPro54-PseKNC：基于PseKNC的原核sigma54启动子预测系统）。林昊为论文第一作者和通讯作者，电子科技大学生命科学与技术学院为第一通讯单位。

　　该文章发展了一种称为“伪核苷酸组分PseKNC”的方法，该方法不仅考虑了DNA中核苷酸的组分信息，还增加了核苷酸空间结构的长程关联效应。基于该方法，开发了在线免费服务iPro54-PseKNC用于sigma54启动子的预测，精度可以达到90%以上。该服务将为在基因组中分析和识别sigma54启动子提供帮助。

　　发表于《Bioinformatics》的论文题目为“iNuc-PseKNC: a sequence-based predictor for predicting nucleosome positioning in genomes with pseudo k-tuple nucleotide composition”（iNuc-PseKNC：基于序列信息的核小体定位预测软件）。硕士研究生郭守辉为论文第一作者，林昊为第一通讯作者，电子科技大学生命科学与技术学院为第一通讯单位。

　　文章仍基于伪核苷酸组分PseKNC的思想，开发了一套用于人类、果蝇、线虫的基因组核小体预测的在线服务。文章已被基本科学指标数据库ESI收录。

　　《Nucleic Acids Research》（《核酸研究》）是牛津大学出版社出版的生化与分子生物学领域权威性期刊，2013年影响因子为8.808，5年影响因子为8.378。《Bioinformatics》（《生物信息学》）为牛津大学出版社出版的数学与计算生物学领域的顶级期刊，2013年影响因子为4.621，5年影响因子为6.968。两本期刊在JCR期刊分区中，均属于生物领域的TOP期刊。

　　林昊副教授课题组专注于DNA调控元件和蛋白质功能的信息学研究，目前已在Nucleic Acids Research，Bioinformatics，Journal of Proteomics，Journal of Computational Chemistry等生物计算领域杂志，发表第一或通讯作者SCI论文40余篇，引用超过1500篇次，6篇论文被ESI数据库收录。

论文连接：

　　http://nar.oxfordjournals.org/content/42/21/12961.long

　　http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/11/1522.abstract

相关介绍：

　　电子科大生物信息学中心成立于2007年。中心主要通过计算手段进行生物和信息学的交叉研究，研究方向包括基因组信息学、蛋白质信息学、系统生物学、化学信息学与计算机辅助药物设计。七年来，中心先后获四川省科技进步奖1项，发表SCI论文100多篇，其中影响因子大于5的论文10余篇，多篇论文被ESI数据库收录。