自动化工程学院重组于2001年，其前身为自动化系与高能物理研究所测控专业。学院办学实力雄厚，现有测控技术及仪器、自动化、环境工程3个本科专业，测试计量技术及仪器、控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、模式识别与智能系统4个硕士点和测试计量技术及仪器、检测技术与自动化装置2个博士点，其中控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置均为部重点学科。现有教职工100余名，青年教师均具有硕士、博士学位，现有博士生、硕士生、本专科生等各类在校生2300余名。学院下设八个实验室，其中与全球著名企业联合设立了电子科大-美国NI联合实验室、电子科大-日本三菱电机单片机实验室、电子科大-美国HP联合实验室：“211”工程重点投入近500万元建设了电磁测量学科基地实验室、虚拟仪器实验室、智能自动化实验室、智能传感器实验室和微机实验室等5个实验室，电磁测量学科基地实验室和虚拟仪器实验室为省级重点实验室及教育部重点支持项目。我院科研项目硕果累累，仅“九五”期间从事国防预研、军工型号、自然科学基金、国防基金、重点实验室基金，企业横向技改项目等课题研究近40项，总经费达2000万元。近两年科研形势良好，每年科研经费到款均在1000万元以上。