沈林園,男,1987年出生,学硕导师
工作单位 动物遗传育种研究所
电子邮箱 shenlinyuan0815@163.com
招生专业 【学硕】:090501动物遗传育种与繁殖，【专硕】:095133畜牧
◆个人简历
沈林園，男，汉族，籍贯四川广安，中国党员，博士。2008年-2018年先后在四川农业大学动物科技学院完成动物遗传育种与繁殖专业的本硕博学位学习。于2016-2018年获得国家留学基金委资助在美国伊利诺伊香槟分校进行博士联合培养学习，主要从事参与DNA损伤修复通路中的蛋白功能研究。先后获得六次研究生一等学业奖学金，两次普爱奖学金，博士生国家奖学金，四川省优秀毕业研究生，校级优秀博士论文，四川省科技进步一等奖、四川省科技进步二等奖等奖项。主持国家自然科学基金项目一项，作为骨干成员参与了国家重要研发、国家科技支撑、“十二五”和“十三五”育种攻关等项目。2018年12月进入四川农业大学动物科技学院工作至今，主要从事一些典型的非编码RNA（miRNAs, lncRNAs，circRNAs）在猪的脂肪沉积和肌肉肉质性状上的遗传机制的研究工作。以第一作者在Frontiers in Genetics, Meat Science, Biomolecules等杂志上发表SCI论文16篇，累计影响因子为51.52，此外以并列第一作者发表SCI论文17篇。担任FEBS Letters, Frontiers in Genetics, Frontiers in Neuroscience,Current Molecular Medicine等SCI杂志审稿专家。
◆工作经历
2018.12-至今，四川农业大学，动物遗传育种研究所，讲师
◆教育经历
2016.9–2018.9, 伊利诺伊香槟分校, 细胞与分子生物学,博士联合培养, 导师: Supriya
2014.9–2018.12, 四川农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 博士, 导师: 朱砺
2012.9–2014.6, 四川农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 硕士, 导师: 朱砺
2008.9–2012.6, 四川农业大学, 动物科学, 学士, 导师：朱庆
◆获奖荣誉
四川省科技进步一等奖；四川省科技进步二等奖；四川省海外高层次留学人才；博士生国家奖学金；四川省优秀毕业研究生；校级优秀博士学位论文等
◆研究领域
猪的遗传育种；非编码RNA的表观遗传调控；功能基因组学。
◆科研项目
1.tRNA碎片对IUGR仔猪肌肉代谢综合征的表观调控 (**)，国家自然科学基金青年科学基金项目，2020.01-2022.12，在研，主持
2.tRFs通过竞争miRNAs/circRNAs绑定位点调控猪脂肪沉积的分子机制研究（21YYJC1801），四川省科技厅基础研究项目，2021.04-2023.03，在研，主持
◆发表论文
1. L.Y. Shen, Z.D. Tan, M.L. Gan, et al. tRNA-Derived Small Non-Coding RNAs as Novel Epigenetic Molecules Regulating Adipogenesis [J]. Biomolecules, 2019, 9(7): 274. (SCI收录, IF=4.694, 第一作者)
2. L.Y. Shen, M.L. Gan, Q.Z. Tang, et al. Comprehensive Analysis of lncRNAs and circRNAs Reveals the Metabolic Specialization in Oxidative and Glycolytic Skeletal Muscles [J]. International journal of molecular sciences, 2019, 20(12): 2855. (SCI收录, IF=4.183, 第一作者)
3. L.Y. Shen, S.H. Zhang, Q. Li, et al. The Landscape of Non-Coding RNA in an Adult Pig Model of Intrauterine Growth Restriction [J]. Cellular Physiology and Biochemistry, 2018, 50:1764-1778. (SCI收录, IF=5.5, 第一作者)
4. L.Y. Shen, M.L. Gan, S.H. Zhang, et al. Transcriptome Analyses Reveal Adult Metabolic Syndrome With Intrauterine Growth Restriction in Pig Models [J]. Frontiers in genetics, 2018, 9:291. (SCI收录, IF=4.2, 第一作者)
5. L.Y. Shen, M.L. Gan, Q. Li, et al. MicroRNA-200b regulates preadipocyte proliferation and differentiation by targeting KLF4. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2018, 103, 1538-1544. (SCI收录, IF=3.5, 第一作者)
6. L.Y. Shen, M.L. Gan, Z.D. et al. A Novel Class of tRNA-Derived Small Non-Coding RNAs Respond to Myocardial Hypertrophy and Contribute to Intergenerational Inheritance. Biomolecules, 2018, 8, 54. **. (SCI收录, IF=4.694, 第一作者)
7. L.Y. Shen, J.J. Du, Y.D Xia, et al. Genome-wide landscape of DNA methylomes and their relationship with mRNA and miRNA transcriptomes in oxidative and glycolytic skeletal muscles. Scientific Reports. 2016, 6: 32186. (已发表, SCI收录, IF=5.2, 第一作者)
8. L.Y. Shen, L. Chen, S.H. Zhang, et al.. MicroRNA-27b regulates mitochondria biogenesis in myocytes. PloS one, 2016, 11(2): e**. (已发表, SCI收录, IF=3.1, 第一作者)
9. L.Y. Shen, J. Luo, J.J. Du, et al. Transcriptome analysis of Liangshan pig muscle development at the growth curve inflection point and asymptotic stages using digital gene expression profiling. Plos One. 2015, 10(8): e**. (已发表, SCI收录, IF=3.2, 第一作者)
10. L.Y. Shen, L. Chen, S.H. Zhang, et al. MicroRNA-23a regulates slow myosin heavy chain isoforms composition through myocyte enhancer factor 2C (MEF2C) and influences pork quality. Meat science, 2016, 116: 201-206. (已发表, SCI收录, IF=2.8, 第一作者)
11. L.Y. Shen, H.G Lei, S.H. Zhang, et al. The comparison of energy metabolism and meat quality among three pig breeds. Animal Science Journal. 2014, 85, (7), 770-779. (已发表, SCI收录, IF=1.0, 第一作者, 导师为通讯作者)
12. L.Y. Shen, C.D. Liu, S.H. Zhang and L. Zhu. The complete sequence of the mitochondrial genome of Liangshan pig (Sus Scrofa). Mitochondrial DNA. 2015, Ahead of Print : Pages 1-2.(doi: 10.3109/**.2014.**). (已发表, SCI收录, IF=1.8, 第一作者, 导师为通讯作者)
13. L.Y. Shen, S.H. Zhang and L. Zhu. Transcriptome analysis of genetic mechanism of growth curve inflection point using a pig model. Genomics Data. 2015, 6:149-150. (已发表, SCI暂未收录, 第一作者)
14. L.Y. Shen, S.H. Zhang, L. Zhu. Complete mitochondrial genome sequence of Chenghua pig (Sus Scrofa) and its phylogenetic analysis[J]. Mitochondrial DNA Part B, 2016, 1(1): 530-531. (已发表, SCI收录, IF=0.5, 第一作者)
15. L.Y. Shen, Y. Zhang, J.J. Du, et al. MicroRNA-23a regulates 3T3-L1 adipocyte differentiation. GENE. 2015, 575(2), 761-764 (已发表, SCI收录, IF=2.1, 第一作者)
16. L.Y. Shen, J. Luo, H.G. Lei, et al. Effects of muscle fiber type on glycolytic potential and meat quality traits in different Tibetan pig muscles and their association with glycolysis-related gene expression. Genetics and molecular research. 2015, 14(4), 14366-14378 (已发表, SCI收录, IF=0.8, 第一作者)
17. L.Y. Shen, Q. Li, J.W. Wang, et al. miR-144 promotes adipogenesis through releasing C/EBPα from Klf3 1 and CtBP2. Frontiers in Genetics. 2018. (已FABIAO , SCI收录, IF=4.2, 第一作者)
18. J.J. Du#, L.Y. Shen#, et al. The regulation of skeletal muscle fiber-type composition by betaine is associated with NFATc1/MyoD. Journal of Molecular Medicine. 2018, 96:685–700. (已发表, SCI收录, IF=4.9, 并列第一作者)
19. J.J. Du#, L.Y. Shen#, Z.D. Tan, et al. Betaine Supplementation Enhances Lipid Metabolism and Improves Insulin Resistance in Mice Fed a High-Fat Diet. Nutrients. 2018, 10, 131. (已发表, SCI收录, IF=4.2, 并列第一作者)
20. J. Luo#, L.Y. Shen#, Z.D. Tan, et al. Comparison reproductive, growth performance, carcass and meat quality of Liangshan pig crossbred with Duroc and Berkshire genotypes and heterosis prediction. Livestock Science. 2018, 212:61-68. (已发表, SCI收录, IF=1.2, 并列第一作者)
21. S.H. Zhang#, L.Y. Shen#, Y.D. Xia, Q. Yang, X.W. Li, G.Q. Tang, Y.Z. Jiang, J.Y. Wang, M.Z. Li, L. Zhu. DNA methylation landscape of fat deposits and fatty acid composition in obese and lean pigs. Scientific reports, 2016, 6: 35063 (已发表, SCI收录, IF=5.2, 并列第一作者, 导师为通讯作者)
22. Luo J#, Shen Y L#, Lei G H, et al. Correlation between three glycometabolic‐related hormones and muscle glycolysis, as well as meat quality, in three pig breeds. Journal of the Science of Food and Agriculture, 2017, 97(9): 2706-2713. (已发表, SCI收录, IF=2.5, 并列第一作者)
23. S.H. Zhang#, L.Y. Shen#, J. Luo, et al. Analysis of carcass and meat quality traits and nutritional values of hybrid wild boars under different crossing systems. Genetics and molecular research 2014, 14, (1), 2608-2616. (已发表, SCI收录, IF=0.8, 并列第一作者)
24. H.G. Lei#, L.Y. Shen#, S.H. Zhang, et al. Comparison of the meat quality, post-mortem muscle energy metabolism, and the expression of glycogen synthesis-related genes in three pig crossbreeds. Animal Production Science 2014, 55:501-507 6. (已发表, SCI收录, IF=1.0, 并列第一作者)
25. C.D. Liu#, L.Y. Shen#, J.J. Du,et al. The effect of lipid metabolism-related genes on intramuscular fat content and fatty acid composition in multiple muscles. Animal Production Science. 2017, doi.org/10.1071/AN16292. (已发表, SCI收录, IF=1.4, 并列第一作者)
26. Z.D. Tan#, L.Y. Shen#, X. Cheng, et al. The complete mitochondrial genome sequence of Changbai Mountains wild boar (Cetartiodactyla: Suidae). Conservation Genetics Resources. 2018, 10: 99-10. (已发表, SCI收录, IF=0.7, 并列第一作者)
27. X.Q. Wu#, Y. Zhang#, L.Y. Shen#. A 6-bp deletion in exon 8 and two mutations in introns of TYRP1 are associated with blond coat color in Liangshan pigs. Gene, 2016, 578(1): 132-136. (已发表, SCI收录, IF=2.3, 并列第一作者)
28. 沈林園, 朱砺, 廖坤, 等. 青峪猪的胴体性状, 肉质特性及营养成分分析[J]. 营养学报, 2014, 36(5): 516-518. (CSCD收录，第一作者)
29. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 骨骼肌卫星细胞对肉品质的影响及其分化调控 [J]. 遗传, 2013,35(9):1081-1086.(CSCD收录，第一作者)
30. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 杜洛克猪、长白猪、大白猪和梅山猪组合配套杂交商品猪屠宰性能和肉质性状研究[J]. 中国畜牧兽医,2013,40,193-196.(CSCD收录，第一作者)
31. 沈林園,杜晓惠.臭氧在养鸡生产中的应用.[J]. 中国家禽,2011,33(14),54-55.(CSCD收录，第一作者)
32. 沈林園,朱砺.中药在养鸡生产中的应用.[J]. 中国家禽,2012,34(16),56-59.(CSCD收录，第一作者)
32. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 有关猪场常规育种工作的几点建议 [J]. 猪业科学,2013,5,108-109.(第一作者)
33. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 质构仪在猪肉品质分析中的应用[J]. 猪业科学,2012,11,110-111.(第一作者)
34. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 猪的肉质测定技术[J]. 猪业科学,2012,8,110-111.(第一作者)
35. 沈林園, 张顺华,朱砺, 等. 猪屠宰后pH变化对肉品质的影响[J]. 猪业科学,2013,4,114-115.(第一作者)
◆指导学生
协助指导博士研究生4名，硕士研究生27名。
◆我的团队
隶属于一只由17名固定研究人员组成的“猪分子遗传育种”创新团队，本团队于2013年获得教育部创新团队称号，2015年获得四川省青年科技创新研究团队项目资助。本团队目前拥有教授6人、副教授2人、博导5人、硕导6人、海外知名高校留学经历6人。依托于国家211重点建设学科、国家重点 (培育) 学科、省重点实验室、省2011协同创新中心等平台，每年招收培养硕士、博士研究生20余名。现有在读博士生12人、硕士生26人、在站博士后6人。近年来，本团队围绕四川丰富的优良地方猪种资源，开展了“猪遗传资源的发掘与评价”、“猪重要经济性状形成的分子基础与遗传调控”等为内容的研究。经过近些年的努力和拓展，在国内外具有一定影响力的。