北方民族大学研究生处成立于2006年11月，是从北方民族大学科研处分离出来的一个独立性机构。2003年我校被教育部批准拥有硕士学位授予权，其中三个专业获得招生资格，分别是：中国少数民族史、计算机应用技术、应用数学。2004年9月这三个专业开始面向全国招收硕士研究生，有8名研究生入校学习，并于2007年6月顺利毕业，其中有2位同学 的硕士学位论文获2007年宁夏回族自治区区级优秀毕业论文。在全国第十次硕士学位授予工作启动时，我校申报成功7个硕士学位点，分别是专门史、语言学及应用语言学、中国古代文学、思想政治教育、计算数学、电路与系统、生态学。现在我校硕士学位点共10个，其中理工科5个，人文社科5个，目前在校研究生91名。
　　我校硕士生导师队伍结构合理，学术水平较高，有北大博导在内的校级主管领导、有博士学位的硕士生导师占导师总数的1/3.主要研究方向特色鲜明，与民族地区和西部地区的工农业生产及社会发展密切相关，研究成果具有一定影响。
　　研究生处设有招生就业科、管理与培养科、学位与学科建设科3个科室，在学校的领导下，具体负责全校研究生招生、管理、培养、及学位授予等工作。