| 序号 | 二级学科硕士点 | 批准时间 | 一级学科硕士点 | 所属学院 |
| 1 | 010101 马克思主义哲学 | 2000 | 人文学院 | |
| 2 | 010107 宗教学 | 2005 | 蒙古学学院 | |
| 3 | 010108 科学技术哲学 | 1998 | 人文学院 | |
| 4 | 020101 政治经济学 | 1998 | 经济管理学院 | |
| 5 | 020202 区域经济学 | 2000 | 经济管理学院 | |
| 6 | 020204 金融学 | 2003 | 经济管理学院 | |
| 7 | 030102 法律史 | 2005 | 法学院 | |
| 8 | 030103 宪法学与行政法学 | 2003 | 法学院 | |
| 9 | 030105 民商法学 | 1993 | 法学院 | |
| 10 | 030106 诉讼法学 | 2000 | 法学院 | |
| 11 | 030201 政治学理论 | 2005 | 公共管理学院 | |
| 12 | 030401 民族学 | 2000 | 蒙古学学院 | |
| 13 | 030403 中国少数民族经济 | 2000 | 蒙古学学院 | |
| 14 | 030404 中国少数民族史 | 2003 | 蒙古学学院 | |
| 15 | 030501 马克思主义基本原理 | 2005 | 0305 马克思主义理论 (2005年批准) | 公共管理学院 |
| 16 | 030502 马克思主义发展史 | 2005 | 公共管理学院 | |
| 17 | 030503 马克思主义中国化研究 | 2005 | 公共管理学院 | |
| 18 | 030504 国外马克思主义研究 | 2005 | 公共管理学院 | |
| 19 | 030505 思想政治教育(原马克思主义理论与思想政治教育) | 2005 (1993) | 公共管理学院 | |
| 20 | 050101 文艺学 | 2003 | 0501 中国语言文学 (2005年批准) | 蒙古\人文\艺术学院 |
| 21 | 050102 语言学及应用语言学 | 2003 | 外国语学院 | |
| 22 | 050103 汉语言文字学 | 1996 | 人文学院 | |
| 23 | 050104 中国古典文献学 | 2005 | 人文学院 | |
| 24 | 050105 中国古代文学 | 1986 | 人文学院 | |
| 25 | 050106 中国现当代文学 | 2005 | 人文学院 | |
| 26 | 050107 中国少数民族语言文学 | 1981 | 蒙古学学院 | |
| 27 | 050108 比较文学与世界文学 | 2005 | 蒙古学学院 | |
| 28 | 050201 英语语言文学 | 2005 | 外国语学院 | |
| 29 | 050202 俄语语言文学 | 2005 | 外国语学院 | |
| 30 | 050205 日语语言文学 | 2003 | 外国语学院 | |
| 31 | 050211 外国语言学及应用语言学 | 1993 | 外国语学院 | |
| 32 | 050301 新闻学 | 2003 | 蒙古\人文学院 | |
| 33 | 050401 艺术学 | 2005 | 艺术学院 | |
| 34 | 050402 音乐学 | 2005 | 艺术学院 | |
| 35 | 050403 美术学 | 2005 | 艺术学院 | |
| 36 | 060101 史学理论及史学史 | 2005 | 0601 历史学 (2005年批准) | 人文学院 |
| 37 | 060102 考古学及博物馆学 | 2005 | 人文学院 | |
| 38 | 060103 历史地理学 | 2005 | 人文学院 | |
| 39 | 060104 历史文献学 | 2003 | 人文学院 | |
| 40 | 060105 专门史 | 1981 | 人文学院 | |
| 41 | 060106 中国古代史 | 1981 | 人文学院 | |
| 42 | 060107 中国近现代史 | 1998 | 人文学院 | |
| 43 | 060108 世界史 | 1986 | 人文学院 | |
| 44 | 070101 基础数学 | 1981 | 0701 数学 (2005年批准) | 理工学院 |
| 45 | 070102 计算数学 | 2000 | 理工学院 | |
| 46 | 070103 概率论与数理统计 | 2005 | 理工学院 | |
| 47 | 070104 应用数学 | 1981 | 理工学院 | |
| 48 | 070105 运筹学与控制论 | 2000 | 理工学院 | |
| 49 | 070201 理论物理 | 1981 | 0702 物理学 (2005年批准) | 理工学院 |
| 50 | 070202 粒子物理与原子核物理 | 2005 | 理工学院 | |
| 51 | 070203 原子与分子物理 | 2005 | 理工学院 | |
| 52 | 070204 等离子体物理 | 2005 | 理工学院 | |
| 53 | 070205 凝聚态物理 | 1998 | 理工学院 | |
| 54 | 070206 声学 | 2005 | 理工学院 | |
| 55 | 070207 光学 | 2005 | 理工学院 | |
| 56 | 070208 无线电物理 | 2005 | 理工学院 | |
| 57 | 070301 无机化学 | 1986 | 0703 化学 (2005年批准) | 化学化工学院 |
| 58 | 070302 分析化学 | 2005 | 化学化工学院 | |
| 59 | 070303 有机化学 | 1984 | 化学化工学院 | |
| 60 | 070304 物理化学 | 1993 | 化学化工学院 | |
| 61 | 070305 高分子化学与物理 | 2005 | 化学化工学院 | |
| 62 | 071001 植物学 | 1981 | 0710 生物学 (2003年批准) | 生命科学学院 |
| 63 | 071002 动物学 | 1998 | 生命科学学院 | |
| 64 | 071003 生理学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 65 | 071004 水生生物学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 66 | 071005 微生物学 | 1990 | 生命科学学院 | |
| 67 | 071006 神经生物学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 68 | 071007 遗传学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 69 | 071008 发育生物学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 70 | 071009 细胞生物学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 71 | 071010 生物化学与分子生物学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 72 | 071011 生物物理学 | 1996 | 生命科学学院 | |
| 73 | 071012 生态学 | 1986 | 生命科学学院 | |
| 74 | 077501 环境科学 | 1998 | 生命\化工学院 | |
| 75 | 080501 材料物理与化学 | 2005 | 化工学院 | |
| 76 | 080901 物理电子学 | 1993 | 理工学院 | |
| 77 | 081002 信号与信息处理 | 1986 | 理工学院 | |
| 78 | 081104 模式识别与智能系统 | 2000 | 理工学院 | |
| 79 | 081201 计算机系统结构 | 2003 | 0812 计算机科学与技术(2005年批准) | 计算机学院 |
| 80 | 081202 计算机软件与理论 | 2000 | 计算机学院 | |
| 81 | 081203 计算机应用技术 | 1993 | 计算机学院 | |
| 82 | 081704 应用化学 | 2005 | 化学化工学院 | |
| 83 | 090503 草业科学 | 2003 | 生命科学学院 | |
| 84 | 120100 管理科学与工程 | 2003 | 计算机学院 | |
| 85 | 120201 会计学 | 2003 | 经济管理学院 | |
| 86 | 120202 企业管理 | 2000 | 经济管理学院 | |
| 87 | 120401 行政管理 | 2003 | 公共管理学院 |
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