生态环境学院是由原内蒙古林学院沙漠治理系、原内蒙古农牧学院草原系等五个部门1999年合并组建。学院现设五个专业：草业科学、水土保持与荒漠化防治、农业资源与环境、土地资源管理、资源环境与城乡规划管理。草业科学是国家级重点学科，博士后流动站；水土保持与荒漠化防治为自治区级重点学科，博士授权点。这两个学科在国内具有明显的学科优势、地区优势和办学特色。学院下设沙漠治理研究所，建有国家林业局重点开放性实验室—沙地生物资源保护和培育实验室。在乌兰布和沙漠建有产、学、研三结合的教学实验基地。学院现有教职工117人，其中教授20人，副教授39人，讲师27人，实验师和高级实验师14人。教师中具有博士学位的13人，硕士学位的23人，14人在职攻读博士学位，12人在职攻读硕士学位。学院在校生915人，其中博士生25人，硕士生52人。学院承担着30多项各级国家重点攻关项目、国家自然基金项目和省部级重点研究项目，已有多项科研课题获国家、省部级科技成果奖。在国家实施西部大开发战略以来，学院积极与地方合作，承担了多项生态建设规划设计和生产任务，为西部大开发和地方经济建设做出了重要贡献。