1987年建系，同年开始招收全日制本科生，所设专业为企业管理，年招生人数30人，同时，继续承担学校其他院系的管理类课程的教学任务。先后担任系主任的是张乃惠、于向华、陈文选。于向华先后任直属支部书记和总支书记。
1996年10月6日正式建院，学院的历届院长是陈文选、李野，党总支书记是聂秀范、李野。学院的建立标志工商管理学院的发展进入了一个新的阶段。教师队伍的数量不断扩大，质量不断提高，办学规模扩大，办学层次提高，教学、科研，研究生教育都得到迅速发展。本科专业发展到三个，即企业管理，市场营销和国际经济与贸易专业，在校生达500多人。
从2001年开始，本科生招生规模进一步扩大，年招生规模为6个班。学院所设的三个专业均为我国医药经济和医药管理所急需的热门专业。这三个专业的特色是集药学、经济学与管理学为一体的具有鲜明特色的应用型专业。学生入学后先学习两年药学类课程，然后，用两年时间学习经济与管理类课程，使学生具有药学、企业管理，市场营销和国际经济与贸易方面的知识和技能。实践表明，我院毕业生具有基础扎实，外语、计算机基础好，思路开阔，具有开扩进取精神，适应性强等特点，深受用人单位好评，多年来，毕业生一直供不应求。许多毕业生已成为医药管理的骨干。
学院从1994年开始招收药事管理硕士研究生（挂靠药剂学科），到2003年6月，已毕业8届毕业生。从2001年开始，经省教委批准，我院正式设立企业管理硕士点，这是目前全国唯一的一个药事管理类硕士点。现已独立招生。近年来，许多医药企事业的管理人员来我院攻读硕士学位，目前统招和同等学历学位的研究生数已达50余人，此外，研究生课程班教育也已经开展。我院本科毕业生除可攻读本院硕士学位外，还有许多学生考取了我校其他学院的研究生和外校的研究生，特别是一些学生考取了全国知名大学的研究生，例如：北京大学、清华大学、复旦大学、天津大学、吉林大学、北京师范大学、北京对外经济贸易大学、上海财经大学、东北大学、河海大学、大连财经大学等。从2001年开始，我院开始招生博士生，办学层次得到了提升，至此，学院的本、硕、博三层次的办学构架已经形成，目前，我院正面临快速发展研究生教育的良好机遇。
学院有一支团结向上，年富力强的教职工队伍，中青年骨干教师正在健康成长，他们积极工作，刻苦学习，攻读学位已成为学位文化的主流。目前有硕士学位的教师已占教师总数的70%左右，已取得硕士学位的大部分教师正在攻读和准备攻读博士学位。与此同时，到2003年9月学院先后派出4名教师到北大经济学院和光华管理学院去进修学习。学院还聘请有实践经验的兼职教授5人。“十五”期间，我院教师的学历结构，职称结构、年龄结构、学术结构将得到进一步改善，教师队伍的综合实力将有很大的提高。学院教师在完成繁重的教学任务的同时，积极开展科学研究工作。先后承担国家自然科学基金委、国家教育部，国家药品监督管理局，中医药局，辽宁省及沈阳市课题10余项，在各类学术期刊或学术会议上发表论文400余篇、获奖论文及成果30余项，出版专著和教材30余部。
学院正在学校的领导下与美国ALLIANT国际商学院联合办MBA和3+1本科专业。
目前学院正根据学校的发展规划，以学科建设为主线，在提高教师的学历层次，业务水平上，科研能力上开展扎实的工作，争取为设立博士点打下坚实的基础，为把学院办成规模适当，本硕博层次齐全，特色鲜明，质量较高，团结向上，办学条件良好的外向型，走在国内同类学科前列的工商管理学院而努力。
