基于此,中国科学院沈阳生态研究所团队成员以河流底泥为接种源,建立了BD厌氧生物转化微宇宙体系。研究发现在产乙酸的条件下,BD发生氢化反应,被快速转化为1-丁烯。细菌16S rRNA 基因的扩增子测序表明产乙酸菌Acetobacterium 随着富集培养代数的增加,其丰度也显著提高(图1和图2)。团队成员利用宏基因测序和生信分析等手段,成功拼装出完成度为94%的Acetobacterium基因组草图。比较基因组及进化分析表明该菌株为威尔氏醋酸杆菌属(Acetobacterium wieringae)下的一株新型菌株,将其命名为菌株N(图3)。菌株N基因组中含有多个编码黄素蛋白氧化还原酶和短链脱氢/还原酶的基因,可能涉及参与BD的厌氧生物氢化;同时该类特殊氢化酶对共轭二烯烃底物具有立体选择性,如仅催化共轭二烯烃中某个双键。本研究首次揭示产乙酸菌Acetobacterium在BD转化中所发挥的潜在重要地位,丰富了我们对Acetobacterium生态功能多样性的认识,且相关氢化酶的基因挖掘也对未来开发高效选择性生物催化剂用于BD到1-丁烯的工业转化提供了重要资源(如替代高成本的非贵金属(Cu、Ni、Co)催化剂)。
以上研究成果以“Biohydrogenation of 1,3-Butadiene to 1?Butene under Acetogenic Conditions by Acetobacterium wieringae”为题,于2023年1月18日发表于Environmental Science & Technology。中国科学院沈阳生态研究所杨毅研究员为第一作者,严俊和杨毅研究员为共同通讯作者。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金项目、中国科学院前沿科学重点研究计划项目及中国科学院沈阳生态所“双碳”重大项目等项目支持。

图1 BD可被底泥和不同代际菌群厌氧转化

图2不同代际菌群的微生物群落结构对比

图3 菌株N与Acetobacterium属代表性菌株的16S rRNA基因发育进化树