性　　别： 男
出生日期： 1968.7
职　　称： 研究员
工作单位： 中国科学院水生生物研究所（联合培养基地）
行政职务： 学科组长
联系电话：
电子信箱： qiu@ihb.ac.cn
学术任职： 湖北省微生物学会理事
荣誉称号： 中国科学院“百人计划”入选者
指导专业： 水生生物学（水生所）研究方向：生物学
其他专业： 无
更新时间： 2018-11-6
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个人简介

中国科学院“百人计划”入选者(A类，引进国外优秀人才;2012年获得择优支持)。主要从事细菌分子遗传与分子微生物学、环境生物技术、生态修复、蓝藻水华控制、水生植物恢复重建和人工湿地等方面的研究。阐明富营养化浅水湖泊中水生植被的演替特征和沉水植被生态恢复的磷营养阈值；参与开发垂直流人工湿地污水处理技术，该项技术已在国内广泛应用。进行纳豆菌比较基因组学分析并阐明纳豆发酵和多聚D-谷氨酸生物合成调控。阐明了假单胞菌从非粘液野生型向大量产藻酸盐的粘液型转换的信号传导机制。建立了希瓦氏菌基因组足迹分析技术，筛选到多个与低温适应相关基因；阐明希瓦氏菌血红素与细胞色素合成调控和无氧呼吸调节机理；基本阐明活性污泥微生物优势种动胶菌的胞外多聚物生物合成与菌胶团形成调控机制。利用解叔丁醇水居菌为模型，发现调控细菌菌胶团形成的关键调节基因。在PNAS(美国科学院院刊，该论文被Faculty 1000推荐)、Water Research、Applied & Environmental Microbiology （共5篇）、Microbiology （共2篇）、Journal of Bacteriology、Ecological Engineering、BMC Microbiology等国内外重要刊物上发表论文40多篇，已被SCI引用360余次，其中他引320余次。中文核心期刊论文已被国内同行引用2200余次。授权美国专利3项，授权中国发明专利1项。



学习经历
起止年月
学校
所学专业
学历
学位

1985.09-1989.06
华中师范大学
生物学
本科
理学学士
1989.09-1992.06
华中师范大学
植物学
研究生
理学硕士
1998.09-2001.08
中国科学院研究生院
水生生物学
博士研究生
理学博士

2001.09-2005.03
日本庆应义塾大学大学院
生物信息学
博士后期课程
学术博士


工作经历
起止年月
工作单位
任职

1992.07-1995.06
中国科学院水生生物研究所
研究实习员

1995.07-2001.08
中国科学院水生生物研究所

助理研究员

2001.09-2005.03
日本庆应大学先端生命科学研究所

研究助理

2005.03-2005.06
日本琦玉县越谷市Taitec株式会社
社员
2005.06-2008.03
美国西弗吉尼亚州Marshall大学医学院生物化学与微生物系
博士后

2008.04-2011.02
美国Oklahoma大学环境基因组学研究所
博士后、研究科学家

2011.03-
中国科学院水生生物研究所
研究员


承担科研课题情况
序号
项目名称
项目来源
起止年月
经费
(万元)
主持/参加
完成情况

1 细菌低温适应与无氧呼吸研究
中国科学院
2011.03-2015.12
150.0 结题
2 中科院百人计划科研费
中国科学院
2012.03-2016.12
200.0
结题
3 一泓清水出污泥—活性污泥处理技术百年祭
中国科学院科普项目
2015．01-2016.12
4.0 结题
4 卢旺达等一带一路沿线国家水资源保护与清洁水环境卫生任务
中国科学院
2016.01-2020.12
140.0 进行中

科研获奖情况
序号
获奖项目名称
奖励类别（等级）
授予单位
获奖时间
本人排名

1 富营养化水体修复机制与水生植被重建生态学研究
自然科学奖（二等奖）
湖北省
2014
3
2 水生态系统修复与水质净化关键技术研发和工程应用
国家环境保护科学技术奖（二等奖）
国家环保部
2014 6



授权专利情况
序号
专利名称
授权专利号
年份
专利类别
（发明/实用新型）
本人排名





论文与专著情况
序号
论文、专著名称
学术期刊或出版社名称
发表(出版)年份
论文
检索情况
作(著）者
名次

1 RpoN (σ54) is required for floc formation but not for extracellular polysaccharide biosynthesis in a floc-forming Aquincola tertiaricarbonisstrain
Applied and Environmental Microbiology
2017 SCI 通讯作者

2 Comparative genomics analyses on EPS biosynthesis genes required for floc formation ofZoogloearesiniphilaand other activated sludge bacteria.
Water Research
2016 SCI 通讯作者

3 Functional roles of CymA and NapC in Reduction of Nitrate and Nitrite by ShewanellaputrefaciensW3-18-1
Microbiology-sgm,UK
2016 SCI 通讯作者

4 Differential regulation of the two ferrochelatase paralogues in ShewanellaloihicaPV-4 in response to environmental stresses
Applied and Environmental Microbiology
2016 SCI 第一作者
5 Truncated Type IV pilin PilA108 Activates the intramembrane protease AlgW to cleave MucA and PilA108 itself invitro
Archives of Microbiology
2016 SCI 通讯作者

6 An extracytoplasmic function sigma factor-dependent periplasmic glutathione peroxidase is involved in oxidative stress response of Shewanellaoneidensis.
BMC Microbiology
2015 SCI 通讯作者

7 Combined genomics and experimental analyses of respiratory characteristics of Shewanellaputrefaciens W3-18-1
Applied and Environmental Microbiology
2013 SCI 第一作者

8 A series of PBAD-based shuttle vectors for functional analysis of toxic and highly-regulated genes in Pseudomonasand Burkholderiaspp. and other bacteria
Applied and Environmental Microbiology
2008 SCI 第一作者

9 ClpXP proteases positively regulate overexpression of alginate and mucoid conversion inPseudomonas aeruginosa.
Microbiology-sgm,UK
2008 SCI 第一作者

10 Regulated proteolysis controls mucoid conversion in Pseudomonas aeruginosa.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
2008 SCI 第一作者


指导研究生情况
在读人数
4 已毕业人数

所指导研究生在读期间取得的成绩和荣誉、就业去向等情况介绍