近日,我所李国辉研究员团队(1106组)与中科院上海生物化学与细胞生物学研究所杨巍维研究员团队合作,通过分子动力学模拟的手段,阐明了代谢小分子抑制肺癌转移的分子机制,相关结果以共同通讯作者的形式发表于《自然》(Nature)杂志上。
尿嘧啶核苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGDH)可以将尿嘧啶核苷二磷酸葡萄糖(UDP-Glc)转化为尿嘧啶二磷酸葡萄糖醛酸(UDP-GlcUA);Hu抗体R(HuR)可结合并稳定Snail mRNA。杨巍维团队实验发现了UGDH磷酸化后可与HuR相互作用,导致HuR的抑制作用被减弱,同时Snail mRNA的表达量增加,促进了肺癌细胞的转移。在UDP-Glc与HuR结合时,Snail mRNA就不能与HuR结合,使得Sail mRNA衰变,大大降低了肺癌的转移。但是,仅依据实验无法在分子层面上阐明UDP-Glc是如何抑制肿瘤转移的。
为了回答这一关键科学问题,李国辉和楚慧郢副研究员运用分子动力学模拟的方法,针对UGDH底物及产物两种代谢小分子与HuR结合的分子机制进行大规模理论计算研究,发现UDP-Glc和UDP-GlcUA两者均与HuR结合,而且二者结合位点都与mRNA与HuR的结合位点重合,但UDP-Glc与HuR的结合自由能要强于UDP-GlcUA,这与实验测量完全一致;正是由于UGDH结合HuR后催化UDP-Glc转化为UDP-GlcUA,而UDP-GlcUA与HuR的结合较弱,因此降低了HuR的抑制。基于分子动力学模拟对结合起主要贡献的残基分析,理论计算预测了N134等是对小分子结合贡献的残基,实验上对上述位点突变的结果表明突变会造成两种代谢小分子结合能力降低,与理论预测结果一致。这一发现,首次从分子层面对UGDH与HuR的结合会促进肺癌转移,以及UDP-Glc可抑制肺癌转移进行了理论解析,为肺癌转移新机制以及肺癌转移控制的新药研发提供了坚实的理论依据。
该研究工作得到国家****科学基金的资助。(文/图 楚慧郢、李国辉)
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
我所生物分子模拟应用研究取得重要进展
本站小编 Free考研考试/2020-04-08
相关话题/生物 进展
我所钠离子电池聚阴离子型正极材料研究取得新进展
近日,我所储能技术研究部(DNL17)李先锋研究员、张华民研究员、郑琼副研究员带领的研究团队,在钠离子电池聚阴离子型正极材料研究方面取得新进展,研究成果在线发表于《美国化学会能源快报》(ACSEnergyLetters)上。 钠离子电池具有资源丰富、低成本、高性价比等优点,在电动自行车、低速电动车 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所低温F+H2反应研究取得新进展
近日,我所肖春雷研究员、孙志刚研究员、张东辉院士和杨学明院士团队,与美国马里兰大学M.Alexander教授、伯克利大学D.Neumark教授合作,研究了低温下F+H2反应中共振增强隧穿效应,以及探索了其在星际化学中对于产生HF的贡献,相关结果发表在《自然-化学》(NatureChemistry)上 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所利用器官芯片技术培育人胰岛类器官取得新进展
近日,我所秦建华研究员团队利用器官芯片技术培育人多能干细胞衍生的胰岛类器官取得新进展,相关成果发表在器官芯片领域重要刊物Labonachip上,并被选为封面文章。 类器官(organoids)是一种通过干细胞自组织方式形成的多细胞三维复杂结构,它能够在体外模拟具有来源组织器官的特定结构和功能,为发 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所在单分子甲醛吸附研究中取得新进展
近日,我所分子反应动力学国家重点实验杨学明院士、马志博副研究员与中国科技大学李微雪教授,浙江师范大学黄传奇助理研究员合作,在单分子层面甲醛在金红石型氧化钛110表面吸附结构研究中取得新进展,相关结果发表在TheJournalofPhysicalChemistryLetters上。 氧化钛110表面 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所在生物质制氢和柴油领域取得新进展
近日,我所王峰研究员团队在生物质制氢和柴油领域取得新进展,相关成果发表在《自然-能源》(NatureEnergy)上。 由于生物质储量大、年产量高且容易被氧化,因此光催化生物质制氢是一种有潜力的制氢方式。目前生物质制氢后通常被转化成了组分更复杂,更难以解聚的产物而成为废弃物,限制了生物质制氢的应用 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所新型光热电探测器研究取得新进展
近日,我所姜鹏研究员、包信和院士团队在新型光热电探测器开发研究中取得新进展,相关成果发表在《自然-通讯》(NatureCommunications)上。 光热电探测器是基于光热转换和热电转换两个基本能量转换过程的一种探测器。当光照射在热电材料的一端时,光能经过光热转换首先转化为热能,从而在热电材料 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所纳米晶多空穴转移动力学研究取得新进展
近日,我所光电材料动力学特区研究组(11T6组)吴凯丰研究员团队基于钙钛矿纳米晶与并四苯分子构建模型体系,利用飞秒瞬态吸收光谱揭示了该体系的超快空穴转移、超长电荷分离态,以及多空穴转移动力学过程。相关成果发表于《化学科学》(ChemicalScience)上。 多电荷转移过程在光催化与太阳能转换领 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所高稳定性二维钙钛矿太阳电池研究取得新进展
近日,我所郭鑫研究员和李灿院士团队在钙钛矿太阳电池稳定性研究方面取得新进展,相关研究成果在Cell出版集团旗下的Joule杂志上发表。 有机-无机杂化钙钛矿太阳电池(PSC)因较高的光电转换效率而受到广泛关注,近年来发展迅速,成为光伏领域的研究热点,然而其器件稳定性差的问题制约它进一步发展。虽然通 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所发展了生物质发酵液转化的新策略
近日,我所生物能源研究部王峰研究员团队与北京大学马丁教授合作发展并报道了生物质发酵液转化的新策略,实现了ABE溶液(丙酮-丁醇-乙醇-水)的高效率、高选择性制备化学品4-庚酮。相关研究成果发表在《自然-通讯》(NatureCommunications)上。 因其可再生性和环保性,生物质能源的开发和 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08我所非铅双钙钛矿纳米晶发光动力学研究取得新进展
近日,我所复杂分子体系反应动力学研究组(1101组)韩克利研究员团队在非铅双钙钛矿纳米晶发光动力学研究中取得新进展。该团队设计了一组具有直接带隙的非铅双钙钛矿纳米晶,其在紫光范围内的发光量子产率接近于含铅钙钛矿。相关研究结果以全文的形式发表在《美国化学会志》(J.Am.Chem.Soc.)上。 全 ...大连化学物理研究所 本站小编 Free考研考试 2020-04-08