电子工程系是东南大学在电子信息领域集教学、科研、科技开发为一体的重点院系，具有“电子科学与技术”一级学科博士点和博士后流动站以及“光学工程”一级学科博士点，三个二级学科博士点和四个二级学科硕士点。其中“微电子学与固体电子学”、“物理电子学”为江苏省重点学科，设有“****奖励计划”特聘教授岗。

　　电子工程系设有国家专用集成电路系统工程技术研究中心、MEMS教育部重点实验室、江苏省显示技术工程研究中心、江苏省信息显示工程技术研究中心、江苏省光通信器件与技术工程研究中心、南京市光电子材料与器件工程技术中心和南京市嵌入式处理器工程中心。

　　电子工程系现有八个专业方向：信息显示工程、光纤技术与光纤通信、微电子技术、大规模集成电路系统工程、微波与毫米波技术、信息光电子工程、真空电子技术和电子信息材料科学与工程。拥有博士生导师15名、教授27名、副教授22名，一批学者教授在国际和全国学术团体、专家组、评审委员会中担任重要职务。

　　电子工程系成立以来，已培养博士150余名，硕士900余名，本科生4000余名，为推动科学技术进步以及国家经济建设和社会发展做出了积极贡献。

　　近年来电子工程系毕业生就业方向主要是通信工程、信息处理、微电子技术，计算机网络、计算机软件技术应用与开发、光电子技术、电信、电力、能源、交通、银行、金融系统、航空航天等部门及领域。

　　电子工程系所具有的学科优势和科研优势成为电子科学与技术专业强有力的支撑，以物理电子学、微电子学与固体电子学等学科发展所展示的专业特色为电子科学与技术专业建立了稳固的基础，体现了该专业在电子信息领域中的重要地位。