东南大学计算机科学与工程系拥有一支以院士1人、博导11人、教授21人为核心的结构合理、精干的学术队伍。这支队伍中有教育部跨世纪人才2人，教育部青年骨干教师4人，江苏省跨世纪学术带头人2人，江苏省“333”人才5人，江苏省优秀青年骨干教师3人，江苏省优秀教育工作者1人，整体实力强。

　　目前，东南大学计算机科学与工程系拥有“计算机科学与技术”一级学科博士点，包括了“计算机应用技术”、“计算机软件和理论”与“计算机系统结构”全部3个博士点和硕士点；其中“计算机应用技术”学科1994年被评为江苏省重点学科，在1996年、1998年和2000年历次评估中均被评为A级，1999年设立教育部长江特聘教授岗，2002年被评选为国家重点学科。2000年被批准建立“计算机科学与技术”一级学科博士后流动站。

　　自1995年以来，计算机系承担的各类科研项目共150多项，其中包括国家自然科学基金、国家973、国家863、国家科技攻关、教育部和江苏省等重要科研项目90多项。在已取得的成果中，获得国际工业领先奖1项、国家科技进步奖6项、部省级奖20多项，有不少项目已取得了明显的经济效益和社会效益。在国内外著名的学术会议和学术期刊上发表论文700多篇，其中SCI、EI、ISTP三大检索100多篇。

　　计算机系建有“计算机网络与信息集成”教育部重点实验室、“计算机网络技术”江苏省重点实验室、中国教育科研网华东（北）地区中心、国家863/CIMS“网络与数据库”工程实验室等一批实验基地，还建有东南大学CIMS技术中心、东南大学电子商务研究与开发中心、东南大学信息安全技术中心等交叉学科研究机构。

　　经过40多年的建设，东南大学计算机科学与工程系在顾冠群院士率领下，形成了以计算机网络和数据库技术研究和应用为龙头，带动整个学科发展的特色，完成了大量的国家和省部级重要科研项目，获得较多的国家和省部级科技进步奖项，为国家和地方经济和信息化建设做出了贡献，成为国内具有明显特色和较高学术水平的计算机院系。