无线电工程系的办学历史，可追溯到1923年国立东南大学建立的电机工程系。当时该系设有电机制造、荷电铁道、无线电三个组。1928年国立东南大学更名为国立中央大学。1932年陈章先生来中央大学电机工程系任教授。1936年起担任系主任。解放后，国立中央大学改名为国立南京大学。1952年，以南京大学工学院为主体，并入了金陵大学和江南大学的工科系科，建立了南京工学院，并将电机工程系分设为电力工程系和电信工程系。陈章教授任电信工程系主任，该系就是无线电工程系的前身，故将1952年定为系的诞生之年。
　　
　　1953年，在全国高等学校的院系调整中，又有浙江大学、厦门大学、山东工学院的电信系并入，建立了无线电工程系。在系的发展历程中，1956年有三分之一的教师支援新建的成都电讯工程学院（现电子科技大学），1962年又分出电真空专业，成立我校电子工程系。经过长期的努力，全系在学科地区、科研水平、教学质量、师资队伍、人才培养对外合作、科研成果产业化等方面均居全校之首，目前已成为国内一流、国际有影响的无线电电子学教学和科研中心，可谓人才济济、成果斐然。现有教师160人，其中一名中国工程院院士、一名国家攀登计划首席科学家、四名教育部****奖励计划特聘教授、博士生导师18人，教授30人，副教授36人，博士后15人、博士150人、硕士生500名、本科生1200人。无线电工程系设有“信息与通信工程”、“电子科学与技术”两个一级学科博士后流动站，拥有“毫米波”和“移动通信”两个国家重点实验室，全系有“通信与信息系统”、“电磁场与微波技术”、“信号与信息处理”、“电路与系统”四个学科均为硕士、博士点、教育部****计划特聘教授岗，可招博士后。前三个学科为国家重点学科。通信为江苏省重中之中学科。目前有三人入选全国百千万人才工程，四人入选教育部跨世纪人才计划、四人获国家杰出青年基金、四人获有突出贡献的中青年专家称号、七人任全国各类专家组成员，十人入选江苏省“333”人才工程、三个江苏省蓝青工程人选，对外合作拥有七个联合研究中心、省市级工程中心四个、一个实验中心、四个股份公司共有资本七千万元。
　　
　　无线电工程系本科按信息工程（含通信工程、电子信息工程专业方向）招生。本系重视学科基础建设和专业技能培养，注意学生全面素质的提高，特别是创新能力的培养，使学生对新技术、新环境具有较强的适应能力，为国家培养了许多通信和信息方面的高级工程技术人才和组织管理人才。毕业生供不应求。无线电工程系曾多次主办国际学术会议。每年在国际刊物和会议上发表论文的数量和质量在全国同行中均名列前茅。近年来，与美国、加拿大、英国、法国、德国、日本等进行广泛学术交流与合作。无线电工程系在全国首次教学成果奖评选中，荣获全国电子类专业中唯一的特等奖。近又获国家二等奖。改革的成果受到兄弟院校的高度赞扬和移植。许多种教材被兄弟院校广泛应用。
　　
　　无线电工程系多年来承担了数十项国家、省部级重大的重点科研项目和国际合作项目，每年都有科研成果获奖，2000年全系科研经费达3884多万元。研制的高科技产品正在向产业化发展。无线电工程系毕业生人数近万人，他们具有坚实的理论基础，较强的实际工作能力以及组织管理能力，受到社会的广泛好评，成为许多用人部门首选单位。我系培养的毕业生中已有九名院士。毕业生适应的工作范围有：通信工程、信息处理、传输、交换检测技术的研究与教学工作；电子设备与系统的研制、生产和应用；计算机硬件及网络软件技术的应用与开发；安全防范电子系统设计与开发等。就业的行业主要有：电信、电子、银行、广播电视、航空航天、航海、国防、能源交通等高科技企业单位、科研院所、高等院校等。