电气工程系历史悠久，从原中央大学到原南京工学院、直到今天的东南大学都一直设有电气工程相关学科和专业，本系有国内外学术界拥有较高知名度的专家、学者，如：吴大榕教授、严一士教授、闵华教授、周鹗教授、陈珩教授等。
　　
　　在电气工程一级学科所属的5个二级学科目录下，我系有4个二级学科硕士点和2个博士点。它们是：电机与电器、电力系统及其自动化、电力电子与电力传动和电工理论及新技术，电机与电器、电力系统及其自动化2个博士点。
　　
　　1998年国家人事部正式正式批准设立电气工程一级学科博士后流动站。
　　
　　2000年批准电气工程为一级学科博士授权点。
　　
　　我系是江苏省省级重点学科和国家211工程重点建设的单位之一，为国家计委所属国家火电机组工程振动研究中心的成员单位之一。
　　
　　1999年与国家电力公司电力需求侧管理中心共同建立了东南大学电力需求侧管理研究所。
　　
　　目前，电气工程系现有教授15人，副教授24人，讲师19人，助教6人，其他5人。（含博士后3人，博士13人，在职博士生13人，硕士15人）省级优秀骨干教师3名，省333工程培养对象2名，省青蓝工程学术带头人2名，国家教育部优秀骨干教师1名。
　　
　　我系承担了国家863高技术项目5个、华宝CIMS工程等研究项目、国家重点科技攻关项目、国家自然科学基金重点项目。取得一批达到了国内外先进水平的重要研究成果。
　　
　　获得16项国家和省部级奖项、16项国家专利、另有43项通过了省部级鉴定。
　　
　　国家级教学成果奖2项、国家级优秀教材1项省部级优秀教材奖2项发表论文500余篇、学术专著5部、全国统编教材9部。
　　
　　我系有设备一流的实验室11个，实验室面积1440m2，仪器设备580台、件，价值达800多万元。新建了Rockwell实验室、南京市电器设备与自动化工程中心、东南大学电气工程系-香港德昌电机研究中心、国家电力公司认可的东南大学电力需求侧管理研究所、东南大学-如皋高压电器新技术研究所、东南大学通讯技术研究所，强化了科研与经济建设相结合，提高了社会知名度。
　　
　　与国外、境外多所大学建立科研合作，互派学者讲学，交换留学生，如亚琛工业大学（德）、苏黎士工业大学（瑞士）、巴士（BATH）大学（英）、伦敦城市大学（英）、斯德莱克德（Strathclyde）大学（英）、伊阿华州立大学（美）、爱知工业大学（日）、莫纳什（Monash）大学（澳大利亚）、香港大学及香港理工大学。